cluster # 5379

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Schistosoma mansoni
cluster # 5379 cluster # 5379 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5379#0 length = 482 sequences # 3

consensusID : consensus_5379#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 482
fasta sequence

                              [TATTCTTATGGATAAATCTTAATCCATGTTTCTGATTACAACCGTTTTAGTGGACACCCGTTTCATCCTAGTATGGGACACTTTCTTAGTGCAA-ATCTACG-ACCCCATCAGCTATC-GAATCAATAA-CCTTCAGGTGTTGTGGGGAGTATTTGATCTTTAGATCCCTGAGCTAGTATCCAATGGCCCACATTTCTAACTGTCCATTTGAGTCAAACATGTGAACTTCTAAGTTCAAAACCTGTTTCTACATAATTTAAACTTTATCAACAGTTCGTATTTGCAACCATGTTTAAGAGAGTATCTAGACCGTTCAGACTGCTCTACTGGCAGTAAGTTGCTTGACATTATTTCATAGTGAAAAATAATAATACCTTGGTTTTTTCTGTCTTTACTTGACCACTAGCCGGTGAATATTATAATTGCATTATAAGTATAACTAATTGGTTGGTCAGTGAATAGTAAGCATTTTAACAGAGATGGAT]

[+] EMBL CD089459             [TATTCTTATGGATAAATCTTAATCCATGTTTCTGATTACAACCGTTTTAGTGGACACCCGTTTCATCCTAGTATGGGACACTTTCTTAGTGCAA ATCTACG ACCCCATCAGCTATC GAATCAATAA CCTTCAGGTGTTGTGGGGAGTATTTGATCTTTAGATCCCTGAGCTAGTATCCAATGGCCCACATTTCTAACTGTCCATTTGAGTCAAACATGTGAACTTCTAAGTTCAAAACCTGTTTCTACATAATTTAAACTTTATCAACAGTTCGTATTTGCAACCATGTTTAAGAGAGTATCTAGACCGTTCAGACTGCTCTACTGGCAGTAAGTTGCTTGACATTATTTCATAGTGAAAAATAATAATACCTTGGTTTTTTCTGTCTTTACTTGACCACTAGCCGGTGAATATTATAATTGCATTATAAGTATAACTAATTGGTTGGTCAGTGAATAGTAAGCATTTTAACAGAGATGGAT]
[+] EMBL CD089430             [TATTCTTATGGATAAATCTTAATCCATGTTTCTGATTACAACCGTTTTAGTGGACACCCGTTTCATCCTAATATGGGACACTTTCTTAGTGCAA ATCTACG ACCCCATCAGCTATC GAATCAATAA CCTTCATGTGTTGTGGGGAGTATTTGATCTTTAGATCCCTGAGCTAGTATCCAATGGCCCACATTTGTAACTGTCCATTTGAGTCAAACATGTGAACTTCTAAGTTCAAAACCTGTTTCTACATAATTTAAACTTTATCAACAGTTCGTATTTGCAACCATGTTTAAGAGAGTATCTAGACCGTTCAGACTGCTCTACTGGCAGTAAGTTGCTTGACATTATTTCATAGTGAAAAATAATAATACCTTGGCTTTTTCTGTCTTTACTTGACCACTAACCGGTGAATATTATAATTGCATTATAAGTATAACTAATTGGTTGGTCAGTGAATAGTAAGCA TTTAACAGAGATGGAT]
[+] EMBL CD089429             [                                                                                   TCTTAGTGCAAGATCTACGAACCCCATCAGCTATCAGAATCAATAANCCTTCAGGTGTTGTGGGGAGTATTTGATCTTTAGATCCCTGAGCTAGTATCCAATGGCCCACATTTCTAACTGTCCATTTGAGTCAAACATGTGAACTTCTAAGTTCAAAACCTGTTTCTACATAATTTAAACTTTATCAACAGTTCGTATTTGCAACCATGTTTAAGAGAGTATCTAGACCGTTCAGACTGCTCTACTGGCAGTAAGTTGCTTGACATTATTTCATAGTGAAAAATAATAATACCTTGGTTTTTTCTGTCTTTACTTGACCACTAGCCGGTGAATATTATAATTGCATTATAAGTATAACTAATTGGTTGGTCAGTGAATAGTAAGCATTTTAACAGAGATGGAT]




>consensus_5379#0
TATTCTTATGGATAAATCTTAATCCATGTTTCTGATTACAACCGTTTTAGTGGACACCCG
TTTCATCCTAGTATGGGACACTTTCTTAGTGCAAATCTACGACCCCATCAGCTATCGAAT
CAATAACCTTCAGGTGTTGTGGGGAGTATTTGATCTTTAGATCCCTGAGCTAGTATCCAA
TGGCCCACATTTCTAACTGTCCATTTGAGTCAAACATGTGAACTTCTAAGTTCAAAACCT
GTTTCTACATAATTTAAACTTTATCAACAGTTCGTATTTGCAACCATGTTTAAGAGAGTA
TCTAGACCGTTCAGACTGCTCTACTGGCAGTAAGTTGCTTGACATTATTTCATAGTGAAA
AATAATAATACCTTGGTTTTTTCTGTCTTTACTTGACCACTAGCCGGTGAATATTATAAT
TGCATTATAAGTATAACTAATTGGTTGGTCAGTGAATAGTAAGCATTTTAACAGAGATGG
AT

clustalw multiple alignements is not computed in this case