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Schistosoma mansoni
cluster # 5384 cluster # 5384       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5384#0 length = 952 sequences # 3  

consensusID : consensus_5384#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 952
fasta sequence
                              [AGGAGATTGTTGTTGATTAATCCAGAAATTGGAAATGTTGACAGTGTGAGATTTGTAGAAGAATACGACTCAAATAGTCAAACAACTATATGTAAACTTGCTCCTATAATTCCATCTCCTATTCAAACTGAATATCGAAATAAATCTGAACTTACTGTTGGCTACGACATGGATGGTTCAGGCCCAGTTATTGGTTTTCGCTATTCCAAGTACAAAGGGGGTTCAGTTGCTGTCGGATCATTTAAGAGTTGGAACTTTATGCCAAGAAACTCTAATAAGGTCATAAATGCTTTACAAAATTTCTTAACCGCC-GTTTTAAAGGAGACTTTGAACAATTACCTATGCTTGATGCTTTTGATCCAATCACGTATAATGGAAACTGGCGCCATGTACTCATTCGTGAATCAAGGTCTGGAGATACATTAGTTGTTTTATACATTAATACATATGGCTTTACTGAGGAGAATGTAAATAATTTGTTGGACGAATTACGAACATGGTTCCAAACCGGTCCAGGCTCAGATTCTGGTTTAACTAGCCTATATCTGTCTATCTGTTCAAGGTCAGGTATAAAACAATCTGATGAAGATCTTCGTCAAGTTTTTGGTAAACCTTATATTATTGAACAATGTTGCGGATTAAACTTTCATATATCCATTTCTGCATTCTTCCAAGTGAATACACTTGCTGCTGAATTATTATTTGAAAGAATATCATGTCTATGTAATTTACCTTCAGAAAATGAGATTACATGTGCTAATAAAAATCCTAATGAGAAGAAACGAATACTGCTTGATGTATGTTGTGGTACTGGAACAATAGCTTTATGTCTTTCAAAGCATTTCGATCGTGTAATCGGTATTGATATGTGTAACAGTGCAATTGAAGATGCCAAATCANACGCAAAATTGAATGATATCCAGAATGTTGAATTCTTTGCCGGTAAAGCGGA]

[-] EMBL CD201009             [AGGAGATTGTTGTTGATTAATCCAGAAATTGGAAATGTTGACAGTGTGAGATTTGTAGAAGAATACGACTCAAATAGTCAAACAACTATATGTAAACTTGCTCCTATAATTCCATCTCCTATTCAAACTGAATATCGAAATAAATCTGAACTTACTGTTGGCTACGACATGGATGGTTCAGGCCCAGTTATTGGTTTTCGCTATTCCAAGTACAAAGGGGGTTCAGTTGCTGTCGGATCATTTAAGAGTTGGAACTTTATGCCAAGAAACTCTAATAAGGTCATAAATGCTTTACAAAATTTCTTAACCGCC GTTTTAAAGGAGACTTTGAACAATTACCTATGCTTGATGCTTTTGATCCAATCACGTATAATGGAAACTGGCGCCATGTACTCATTCGTGAATCAAGGTCTGGAGATACATTAGTTGTTTTATACATTAATACATATGGCTTTACTGAGGAGAATGTAAATAATTTGTTGGACGAATTACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD077572             [                                                                                                                                                                                                                                                                         GAAACTCTAATAAAGTCATAAATGCTTTACAAAATTTCTTAACCGCCTGTTTTAAAGGAGAATTTGAACAATTACCTATGCTTGATGCTTTTGATCCAATCACGTATAATGGAAACTGGCGCCATGTACTCATTCGTGAATCAAGGTCTGGAGATACATTAGTTGTTTTATACATTAATACATATGGCTTTACTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD134710             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTAATACATATGGCTTTACTGAGGAGAATATAAATAATTTGTTGGACGAATTACGAACATGGTTCCAAACCGGTCCAGGCTCAGATTCTGGTTTAACTAGCCTATATCTGTCTATCTGTTCAAGGTCAGGTATAAAACAATCTGATGAAGATCTTCGTCAAGTTTTTGGTAAACCTTATATTATTGAACAATGTTGCGGATTAAACTTTCATATATCCATTTCTGCATTCTTCCAAGTGAATACACTTGCTGCTGAATTATTATTTGAAAGAATATCATGTCTATGTAATTTACCTTCAGAAAATGAGATTACATGTGCTAATAAAAATCCTAATGAGAAGAAACGAATACTGCTTGATGTATGTTGTGGTACTGGAACAATAGCTTTATGTCTTTCAAAGCATTTCGATCGTGTAATCGGTATTGATATGTGTAACAGTGCAATTGAAGATGCCAAATCANACGCAAAATTGAATGATATCCAGAATGTTGAATTCTTTGCCGGTAAAGCGGA]


>consensus_5384#0 AGGAGATTGTTGTTGATTAATCCAGAAATTGGAAATGTTGACAGTGTGAGATTTGTAGAA GAATACGACTCAAATAGTCAAACAACTATATGTAAACTTGCTCCTATAATTCCATCTCCT ATTCAAACTGAATATCGAAATAAATCTGAACTTACTGTTGGCTACGACATGGATGGTTCA GGCCCAGTTATTGGTTTTCGCTATTCCAAGTACAAAGGGGGTTCAGTTGCTGTCGGATCA TTTAAGAGTTGGAACTTTATGCCAAGAAACTCTAATAAGGTCATAAATGCTTTACAAAAT TTCTTAACCGCCGTTTTAAAGGAGACTTTGAACAATTACCTATGCTTGATGCTTTTGATC CAATCACGTATAATGGAAACTGGCGCCATGTACTCATTCGTGAATCAAGGTCTGGAGATA CATTAGTTGTTTTATACATTAATACATATGGCTTTACTGAGGAGAATGTAAATAATTTGT TGGACGAATTACGAACATGGTTCCAAACCGGTCCAGGCTCAGATTCTGGTTTAACTAGCC TATATCTGTCTATCTGTTCAAGGTCAGGTATAAAACAATCTGATGAAGATCTTCGTCAAG TTTTTGGTAAACCTTATATTATTGAACAATGTTGCGGATTAAACTTTCATATATCCATTT CTGCATTCTTCCAAGTGAATACACTTGCTGCTGAATTATTATTTGAAAGAATATCATGTC TATGTAATTTACCTTCAGAAAATGAGATTACATGTGCTAATAAAAATCCTAATGAGAAGA AACGAATACTGCTTGATGTATGTTGTGGTACTGGAACAATAGCTTTATGTCTTTCAAAGC ATTTCGATCGTGTAATCGGTATTGATATGTGTAACAGTGCAATTGAAGATGCCAAATCAN ACGCAAAATTGAATGATATCCAGAATGTTGAATTCTTTGCCGGTAAAGCGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)