These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5410#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 430 fasta sequence [TATTCGTGTAGATTCAGCTTCAGCATTTGCCGGTGCAATTATTTCTCCGTATTATGATTCATTA-TTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCTACGCTCATTGGCGGAATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAATGTAATTAAACATGAACAATTTTTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACATCCTGACTTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAAAAATTATTACGTTATATCGGTAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCATCTGATATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTAATATGCTACTA] [+] EMBL CD129328 [TATTCGTGTAGATTCAGCTTCAGCATTTGCCGGTGCAATTATTTCTCCGTATTATGATTCATTACTTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCTACGCTCATTGGCGGAATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAATGTAATTAACCATGAACAATTTTTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACATCCTGACCTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAGAAATTATTACGTTATATCGGCAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCGTCTGATATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTAATATGCTACTA] [+] EMBL CD185434 [ ATTATTTCTCCGTATTATGATTCATTA TTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCTACACTCATTGGCGGAATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAATGTAATTAAACATGAACAATTTCTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACATCCTGACTTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAAAGATTATTACGTTATATCGGTAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCATCTGATATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTA ] [+] EMBL CD133766 [ ATTATTTCTCCGTATTATGATTCATTA TTGGTTAAAATAATTGCACGGGCAAGTGATTTTCGTTTAGCTGCTAAAAAAATGCTACGCTCATTGGCGGGATTTCGTATACATGGTGTTAAAACAAACATTCCATTTCTTATGAATGTAATTAAACATGAACAATTTTTATCTGGGATTGTCGATACTAATTTTATTGATGAACATCCTGACTTGTTTGATTTACCTCCGGCTAAACAACGTGCCCAAAAATTATTACGTTATATCGGTAATATTATGATTAATGGACCATCTACTATGTTAGCTACACAACTTCCACCATCTGATATTGAACCAAAGGTACCAACAATTTCTTATGCCAATCATATTCCACGTGGTTGGCGTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||