cluster # 5422

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Schistosoma mansoni
cluster # 5422 cluster # 5422 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5422#0 length = 509 sequences # 3

consensusID : consensus_5422#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 509
fasta sequence

                              [CAGTCATCACGAAAGAAAATTACAACATGGCAAAATCCATACCTCCTACTATTTTTGTTATAAAAATTATTTCAAAATATCTACAATTGTGTGACTAAATAAGTGAAAATAACTAATTACCATTTACGATACACTTAGGTGATCTGATAACGTGAAATTCACCCACGACCGCGATTAAACGTTGTTCTTGATAATTGTGATCCTTTTCACAGTTTCAAATCGTTGTCATGCTTCGTACTGATCGAATGTGTACAGGATAGCTGTTAAATAAACGCTTATTGAACCAATCGGTTAACCTTATGAAACACCAATAACTGACTTTTCTTGTTATGGTTTATAGTATATTCTACTAAGCGCTTTTGTATCCGTAGATTCAAAATATCTTTTCCTACGTAGTTTTTTCAAGAACATGATTAGCTAAAACTATAGACTCTGTACTCAAGCATATCCTTGTATGCTAACCCTGTAACATAAATTTTGAAATAATGCACATGGAAAGTGATAACCAT]

[+] EMBL CD112470             [CAGTCATCACGAAAGAAAATTACAACATGGCAAAATCCATACCTCCTACTATTTTTGTTATAAAAATTATTTCAAAATATCTACAATTGTGTGACTAAATAAGTGAAAATAACTAATTACCGTTTACGATACACTTAGGTGATCTGATAACGTGAAATTCACCCACGACCGCGATTAAACGTTGTTCTTGATAATTGTGATCCTTTTCACAGTTTCAAATCGTTGTCATGCTTCGTACTGATCGAATGTGTACAGGATAGCTGTTAAATAAACGCTTATTGAACCAATCGGTTAACCTTATGAAACACCAATAACTGACTTTTCTTGTTATGGTTTATAGTATATTCTACTAAGCGCTTTTGTATCCGTAGATTCAAAATATCTTTTCCTACGTAGTTTTTTCAAGAACATGATTAGCTAAAACTATAGACTCTGTACTCAAGCATATCCTTGTATGCTAACCCTGTAACATAAATTTTG                             ]
[-] EMBL CD112239             [                               AAAATCCATACCTCCTACTATTTGTGTTATAAAAATTATTTCAAAATATCTACAATTGTGTGACTAAATAAGTGAAAATAACTAATTACCATTTACGATACACTTAGGTGATCTGATAACGTGAAATTCACCCACGACCGCGATTAAACGTTGTTCTTGATAATTGTGATCCTTTTCACAGTTTCAAATCGTTGTCATGCTTCGTACTGATCGAATGTGTACAGGATAGCTGTTAAATAAACGCTTATTGAACCAATCGGTTAACCTTATGAAACACCAATAATTGACTTTTCTTGTTATGGTTTATAGTATATTCTACTAAGCGCTTTTGTGTCCGTAGATTCAAAATATCTTTTCCTACGTAGTTTTTTCAAGAACATGATTAGCTAAAACTATAGACTCTGTACTCAAGCATATCCTTGTATGCTAACCCTGTAACATAAATTTTGAAATAATGCACATGGAAAGTGATAACCAT]
[-] EMBL CD112318             [                                                                                          GTGACTAAATAAGTGAAAATAACTAATTACCATTTACGATACACTTAGGTGATCTGATAACGTGAAATTCACCCACGACCGCGATTAAACGTTGTTCTTGATAATTGTGATCCTTTTCACAGTTTCAAATCGTTGTCATGCTTCGTACTGATCGAATGTGTACAGGATAGCTGTTAAATAAACGCTTATTGAACCAATCGGTTAACCTTATGAAACACCAATAACTGACTTTTCTTGTTATGGTTTATAGTATATTCTACTAAGCGCTTTTGTATCCGTAGATTCAAAATATCCTTTCCTACGTAGTTTTTTCAAGAACATGATTAGCTAAAACTATAGACTCTGTACTCAAGCATATCCTTGTATGCTAACCCTGTAACATAAATTTTGAAATAATGCACATGGAAAGTGATAACCAT]




>consensus_5422#0
CAGTCATCACGAAAGAAAATTACAACATGGCAAAATCCATACCTCCTACTATTTTTGTTA
TAAAAATTATTTCAAAATATCTACAATTGTGTGACTAAATAAGTGAAAATAACTAATTAC
CATTTACGATACACTTAGGTGATCTGATAACGTGAAATTCACCCACGACCGCGATTAAAC
GTTGTTCTTGATAATTGTGATCCTTTTCACAGTTTCAAATCGTTGTCATGCTTCGTACTG
ATCGAATGTGTACAGGATAGCTGTTAAATAAACGCTTATTGAACCAATCGGTTAACCTTA
TGAAACACCAATAACTGACTTTTCTTGTTATGGTTTATAGTATATTCTACTAAGCGCTTT
TGTATCCGTAGATTCAAAATATCTTTTCCTACGTAGTTTTTTCAAGAACATGATTAGCTA
AAACTATAGACTCTGTACTCAAGCATATCCTTGTATGCTAACCCTGTAACATAAATTTTG
AAATAATGCACATGGAAAGTGATAACCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case