cluster # 5423

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Schistosoma mansoni
cluster # 5423 cluster # 5423 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_5423#0 length = 1104 sequences # 3
consensusID : consensus_5423#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1104
fasta sequence
                              [TTTATCATCAATTTCAACATTTACTTCATCAATGGATAATAATTAATGAATAACTGGTTTTTCTTTTCATCATTGATAATAATAATAATTATTTCCCTTCGTTATCATCTATTTATTAA-ACAATAACCAAATGATTATCGATATTACATCATAGATTCTTATGATCTCTCTCTATCTCTATATACAATAAATGTTTGTTGTTGCTAAGAGGTAATTGGAGTTGTTATTGTTTTTGCCAGTTCCCTTTTCTAGTTGTTTATTGTTCTCTGTTTTTATTAGTTTACAATATGCATTTGTTGACTGTCTATCATATCCAATGATGTGTTTATGAGTAGTATCATTAGTAGTAGTAACAGTAATAATGAAGGCTATCTATCTTTGTTTATCGTACGTTTATTTTGACTGTCTTCTACAAAAAGAAACTGACTAAAACTTAAATCTCGGTTTACATTTGTAAATGATCTGCAAATATCACTTGACTTTCTACTTGTTTTTTTGTCTCATCACTATGAAAATAGAAGCTTTTTTTGTTTTCTGAGTTTGTATTTGCCGCATTTCTTTTGTCTTTCAATTCTATAGCTATTAGATCAATGTGGCTCAAACACTTTCATACATCAACAGATATACACATACTCACAAACTTGAAGTTGTACAGAGTACTTCAAGTTACTTACCTATTCGATATTGAATATCCTATATTACCTAATTATTTGATATTTTTCAAACAAAATACTGTAAATTTGTAGAATAATCCTGAATTATTTATTTATTTATTTTTGTGCTGTTACTTATTATTTACCTCATTTTTATCCAGTGTTTGTTTACTGCTTAATTTGTCTGCTATTACTTGTGCTACTTGCATCTAATTAAGTAGTTTAAATTGTTATACATTATTTCTGTTTCGTTTACTTTGGAAAAGATTGTGCTTAAGTGTTTGCGCCTTTTCCCGATGGCCTTTTCCCGATGTCCTTTTCGCCTTTCGAACAGAATATATATATATTATAGTACATTAACCATTTACAAATAAAAACTGACAGTATTGTGTACATGTACTTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTTTACACGTTAGAATCCTCAATAAATTATT]

[+] EMBL CD079030             [TTTATCATCAATTTCAACATTTACTTCATCAATGGATAATAATTAATGAATAACTGGTTTTTCTTTTCATCATTGATAATAATAATAATTATTTCCCTTCGTTATCATCTATTTATTAA ACAATAACCAAATGATTATCGATATTACATCATAGATTCTTATGATCTCTCTCTATCTCTATATACAATAAATGTTTGTTGTTGCTAAGAGGTAATTGGAGTTGTTATTGTTTTTGCCAGTTCCCTTTTCTAGTTGTTTATTGTTCTCTGTTTTTATTAGTTTACAATATGCATTTGTTGACTGTCTATCATATCCAATGATGTGTTTATGAGTAGTATCATTAGTAGTAGTAACAGTAATAATGAAGGCTATCTATCTTTGTTTATCGTACGTTTATTTTGACTGTCTTCTACAAAAAGAAACTGACTAAAACTTAAATCTCGGTTTACATTTGTAAATGATCTGCAAATATCACTTGACTTTCTACTTGTTTTTTTGTCTCATCACTATGAAAATAGAAGCTTTTTTTGTTTTCTGAGTTTGTATTTGCCGCATTTCTTTTGTCTTTCAATTCTATAGCTATTAGATCAATGTGGCTCAAACACTTTCATACATCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD077353             [                                                                     ggATTGAT ATAATAATAATTATTTCCCTTCGTTATCATCTATTTATTAATACAATAACCAAATGATTATCGATATTACATCATAGATTCTTATGATCTCTCTCTATCTCTATATACAATCAATGTTAGTTGTTGCTAAGAGGTAATTGGAGTTGTTATTGTTTATGCCAGTat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD073481             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTTGCCGCATTTCTTTTGTCTTTCAATTCTATAGCTATTAGATCAATGTGGCTCAAACACTTTCATACATCAACAGATATACACATACTCACAAACTTGAAGTTGTACAGAGTACTTCAAGTTACTTACCTATTCGATATTGAATATCCTATATTACCTAATTATTTGATATTTTTCAAACAAAATACTGTAAATTTGTAGAATAATCCTGAATTATTTATTTATTTATTTTTGTGCTGTTACTTATTATTTACCTCATTTTTATCCAGTGTTTGTTTACTGCTTAATTTGTCTGCTATTACTTGTGCTACTTGCATCTAATTAAGTAGTTTAAATTGTTATACATTATTTCTGTTTCGTTTACTTTGGAAAAGATTGTGCTTAAGTGTTTGCGCCTTTTCCCGATGGCCTTTTCCCGATGTCCTTTTCGCCTTTCGAACAGAATATATATATATTATAGTACATTAACCATTTACAAATAAAAACTGACAGTATTGTGTACATGTACTTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTTTACACGTTAGAATCCTCAATAAATTATT]




>consensus_5423#0
TTTATCATCAATTTCAACATTTACTTCATCAATGGATAATAATTAATGAATAACTGGTTT
TTCTTTTCATCATTGATAATAATAATAATTATTTCCCTTCGTTATCATCTATTTATTAAA
CAATAACCAAATGATTATCGATATTACATCATAGATTCTTATGATCTCTCTCTATCTCTA
TATACAATAAATGTTTGTTGTTGCTAAGAGGTAATTGGAGTTGTTATTGTTTTTGCCAGT
TCCCTTTTCTAGTTGTTTATTGTTCTCTGTTTTTATTAGTTTACAATATGCATTTGTTGA
CTGTCTATCATATCCAATGATGTGTTTATGAGTAGTATCATTAGTAGTAGTAACAGTAAT
AATGAAGGCTATCTATCTTTGTTTATCGTACGTTTATTTTGACTGTCTTCTACAAAAAGA
AACTGACTAAAACTTAAATCTCGGTTTACATTTGTAAATGATCTGCAAATATCACTTGAC
TTTCTACTTGTTTTTTTGTCTCATCACTATGAAAATAGAAGCTTTTTTTGTTTTCTGAGT
TTGTATTTGCCGCATTTCTTTTGTCTTTCAATTCTATAGCTATTAGATCAATGTGGCTCA
AACACTTTCATACATCAACAGATATACACATACTCACAAACTTGAAGTTGTACAGAGTAC
TTCAAGTTACTTACCTATTCGATATTGAATATCCTATATTACCTAATTATTTGATATTTT
TCAAACAAAATACTGTAAATTTGTAGAATAATCCTGAATTATTTATTTATTTATTTTTGT
GCTGTTACTTATTATTTACCTCATTTTTATCCAGTGTTTGTTTACTGCTTAATTTGTCTG
CTATTACTTGTGCTACTTGCATCTAATTAAGTAGTTTAAATTGTTATACATTATTTCTGT
TTCGTTTACTTTGGAAAAGATTGTGCTTAAGTGTTTGCGCCTTTTCCCGATGGCCTTTTC
CCGATGTCCTTTTCGCCTTTCGAACAGAATATATATATATTATAGTACATTAACCATTTA
CAAATAAAAACTGACAGTATTGTGTACATGTACTTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTTTACA
CGTTAGAATCCTCAATAAATTATT
clustalw multiple alignements is not computed in this case