cluster # 5465

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Schistosoma mansoni
cluster # 5465 cluster # 5465 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5465#0 length = 615 sequences # 3

consensusID : consensus_5465#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 615
fasta sequence

                              [CCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGAGTCATTCAAGAATAATTTGGACTTGTGCATGGAGTCCAGATGATAAATACTTTTTCACAGGATCCAGAGACTCATCAATTTATTGCTGGAATGCTACTGTCAAAATACAGAAATCAACGGACTATGTGCTTCCTGAAGCTCTTCGTCGTTTAGATACATATAAAGAACTTGGAAAGTCGGTAACAGCTATCGATGTTTGCGAAAGTTTTAACTCAGAATCCTTGTCTAATCTCCGTTCGTATTTAATGGCTGTTGGTTTAGAGTCCGGTAACATAATCTTGCTTAAATTATATGAAACAGGCTCATCTGAGAGCTTTTTCACATGGTCGATTGTTTTAAATTTCCCTCCAGATTGGTGTCATGTTCCAGGTAAACGGTTGAGGCGAATTTCGTTTTCACCACAGAATGATAGTTACCTCAAAACAGCAATTAGATACTTGGCGACATCTGGTGATGATGGAATTGTACGAATTTTTAAAATCAACATTAAATTATTATAATGTCGTTGTGTATTTATACTCACTTGAAATAAAATCAGCTNTGGTTNTTTATTTTCATACTGTATGATTTCAATCCAATAAAGTTTGT]

[+] EMBL CD082669             [CCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGAGTCATTCAAGAATAATTTGGACTTGTGCATGGAGTCCAGATGATAAATACTTTTTCACAGGATCCAGAGACTCATCAATTTATTGCTGGAATGCTACTGTCAAAATACAGAAATCAACGGACTATGTGCTTCCTGAAGCTCTTCGTCGTTTAGATACATATAAAGAACTTGGAAAGTCGGTAACAGCTATCGATGTTTGCGAAAGTTTTAACTCAGAATCCTTGTCTAATCTCCGTTCGTATTTAATGGCTGTTGGTTTAGAGTCCGGTAACATAATCTTGCTTAAATTATATGAAACAGGCTCATCTGAGAGCTTTTTCACATGGTCGATTGTTTTAAATTTCCCTCCAGATTGGTGTCATGTTCCAGGTAAACGGTTGAGGCGAATTTCGTTTTCACCACAGAATGATAGTTACCTCAAAACAGCAATTAGATACTTGGCGACATCTGGTGATGATGGAATTGTACGAATTTTTAAAATCAACATTAAATTATTATAATGTCGTTGTGTATTTATACTCACTTGAAATAAAATCAGCTNTGGTTNTTTATTTTCATACTGTATGATTTCAATCCAATAAAGTTTG ]
[+] EMBL CD083586             [                          AGTCATTCAAGAATAATTTGGAC TGTGCATGGAGTCCAGATGATAAATACTTTTTCACAGGATCCAGAGACTCATCAATTTATTGCTGGAATGCTACTGTCAAAATACAGAAATCAACGGACTATGTGCTTCCTGAAGCTCTTCGTCGTTTAGATACATATAAAGAACTTGGAAAGTCGGTAACAGCTATCGATGTTTGCGAAAGTTTTAACTCAGAATCCTTGTCTAATCTCCGTTCGTATTTAATGGCTGTTGGTTTAGAGTCCGGTAACATAATCTTGCTTAAATTATATGAAACAGGCTCATCTGAGAGCTTTTTCACATGGTCGATTGTTTTAAATTTCCCTCCAGATTGGTGTCATGTTCCAGGTAAACGGTTGAGGCGAATTTCGTTTTCACCACAGAATGATAGTTACCTCAAAACAGCAATTAGATACTTGGCGACATCTGGTGATGATGGAATTGTACGAATTTTTAAAATCAACATT                                                                                                    ]
[-] EMBL CD076264             [                           GTCATTCAAGAATAATTTGGACTTGTGCATGGAGTCCAGATGATAAATACTTTTTCACAGGATCCAGAGACTCATCAATTTATTGCTGGAATGCTACTGTCAAAATACAGAAATCAACGGACTATGTGCTTCCTGAAGCTCTTCGTCGTTTAGATACATATAAAGAACTTGGAAAGTCGGTAACAGCTATCGATGTTTGCGAAAGTTTTAACTCAGAATCCTTGTCTAATCTCCGTTCGTATTTAATGGCTGTTGGTTTAGAGTCCGGTAACATAATCTTGCTTAAATTATATGAAACAGGCTCATCTGAGAGCTTTTTCACATGGTCGATTGTTTTAAATTTCCCTCCAGATTGGTGTCATGTTCCAGGTAAACGGTTGAGGCGAATTTCGTTTTCACCACAGAATGATAGTTACCTCAAAACAGCAATTAGATACTTGGCGACATCTGGTGATGATGGAATTGTACGAATTTTTAAAATCAACATTAAATTATTATAATGTCGTTGTGTATTTATACTCACTTGAAATAAAATCAGCTTTGGTTTTTTATTTTCATACTGTATGATTTCAATCCAATAAAGTTTGT]




>consensus_5465#0
CCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGAGTCATTCAAGAATAATTTGGACTTGTGCATGGA
GTCCAGATGATAAATACTTTTTCACAGGATCCAGAGACTCATCAATTTATTGCTGGAATG
CTACTGTCAAAATACAGAAATCAACGGACTATGTGCTTCCTGAAGCTCTTCGTCGTTTAG
ATACATATAAAGAACTTGGAAAGTCGGTAACAGCTATCGATGTTTGCGAAAGTTTTAACT
CAGAATCCTTGTCTAATCTCCGTTCGTATTTAATGGCTGTTGGTTTAGAGTCCGGTAACA
TAATCTTGCTTAAATTATATGAAACAGGCTCATCTGAGAGCTTTTTCACATGGTCGATTG
TTTTAAATTTCCCTCCAGATTGGTGTCATGTTCCAGGTAAACGGTTGAGGCGAATTTCGT
TTTCACCACAGAATGATAGTTACCTCAAAACAGCAATTAGATACTTGGCGACATCTGGTG
ATGATGGAATTGTACGAATTTTTAAAATCAACATTAAATTATTATAATGTCGTTGTGTAT
TTATACTCACTTGAAATAAAATCAGCTNTGGTTNTTTATTTTCATACTGTATGATTTCAA
TCCAATAAAGTTTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case