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Schistosoma mansoni
cluster # 5482 cluster # 5482       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5482#0 length = 582 sequences # 3  

consensusID : consensus_5482#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 582
fasta sequence
                              [AGACCACTATGGAAAACCTGGAAGTACTGGACAGCCGTTTCGTCCTATTGTGGGACTCCTCAGTGGTAGTGCTCATCCAAGAACAAAGTTATTTCAATTTTATTACATCATATTAAGATTGTAATTCATTGATCTAAGTACAGCACATTTTCTGTAGAATTAGAATATTTGTATTCCGTTTTTCAGTACGAATATACATAGCTCCATGTTGTGTGTTCGAGTATGGTTGATAAGCTTAATCGATGAATGTAGAATACACGTTAAGGTTGGTTACCTTTAATTATACATGTCTTCAAATGGTCTTTCTTGTATGTTAAGGTTGGAAGATAAGTATTTCTGGGGTTAGACGTAGGGAACTAGATCAATTTAGTGGGTCGTTAAAATAGTAATATTAATAATAATGATAAAATGTTTAATAACTGAGGTATTTGGGACCTGTGTGACAGTGTAACACCATCTACATAAATATAACCGTTAGTATGAGATATGTTGTAATACAAATAGTAAGTATCAGGGGGCAATGTTTTAATCGTAGGTGAAAAAGCATAAGATTTGTTGCATTAAGGCAGATGTATTCATTTT]

[-] EMBL CD156052             [AGACCACTATGGAAAACCTGGAAGTACTGGACAGCCGTTTCGTCCTATTGTGGGACTCCTCAGTGGTAGTGCTCATCCAAGAACAAAGTTATTTCAATTTTATTACATCATATTAAGATTGTAATTCATTGATCTAAGTACAGCACATTTTCTGTAGAATTAGAATATTTGTATTCCGTTTTTCAGTACGAATATACATAGCTCCATGTTGTGTGTTCGAGTATGGTTGATAAGCTTAATCGATGAATGTAGAATACACGTTAAGGTTGGTTACCTTTAATTATACATGTCTTCAAATGGTCTTTCTTGTATGTTAAGGTTGGAAGATAAGTATTTCTG                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD156071             [                                                                                    AAAGTTATTTCAATTTTATTACATCATATTAAGATTGTAGTTCATTGATCTAAGTACAGCACATTTTCTGTAGAATTAGAATATTTGTATTCCGTTTTTCAGTACGAATATACATAGCTCCATGTTGTGTGTTCGAGTATGGTTGATAAGCTTAATCGATGAATGTAGAATACACGTTAAGGTTGGTTACCTTTAATTATACATGTCTTCAAATGGTCTTTCTTGTATGTTAAGGTTGGAAGATAAGTATTTCTGGGGTTAGACGTAGGGAACTAGATCAATTTAGTGGGTCGTTAAAATAGTAATATTAATAATAATGATAAAATGTTTAATAACTGAGGTATTTGGGACCTGTGTGACAGTGTAACACCATCTACATAAATATAACCGTTAGTATGAGATATGTTGTAATACAAATAGTAAGTATCAGGGGGCAATGTTTTAATCGTAGGTGAAAAAGCATAAGATTTGTTGCATTAAGGCAGATGTATTCATTTT]
[+] EMBL CD156508             [                                                                                                                  AAGATTGTAATTCATTGATCTAAGTACAGCACATTTTCTGTAGAATTAGAATATTTGTATTCCGTTTTTCAGTACGAATATACATAGCTCCATGTTGTGTGTTCGAGTATGGTTGATAAGCTTAATCGATGAATGTAGAATACACGTTAAGGTTGGTTACCTTTAATTATACATGTCTTCAAATGGTCTTTCTTGTATGTTAAGGTTGGAAGATAAGTATTTCTGGGGTTAGACGTAGGGAACTAGATCAATTTAGTGGGTCGTTAAAATAGTAATATTAATAATAATGATAAAATGTTTAATAACTGAGGTATTTGGGACCTGTGTGACAGTGTAACACCATCTACATAAATATAACCGTTAGTATGAGATATGTTGTAATACAAATAGTAAGTATCAGGGGGCAATGTTTTAATCGTAGGTGAAAAAGCATAAGATTTGTTGCATTAAGGCAGATGTATTCATTTT]


>consensus_5482#0 AGACCACTATGGAAAACCTGGAAGTACTGGACAGCCGTTTCGTCCTATTGTGGGACTCCT CAGTGGTAGTGCTCATCCAAGAACAAAGTTATTTCAATTTTATTACATCATATTAAGATT GTAATTCATTGATCTAAGTACAGCACATTTTCTGTAGAATTAGAATATTTGTATTCCGTT TTTCAGTACGAATATACATAGCTCCATGTTGTGTGTTCGAGTATGGTTGATAAGCTTAAT CGATGAATGTAGAATACACGTTAAGGTTGGTTACCTTTAATTATACATGTCTTCAAATGG TCTTTCTTGTATGTTAAGGTTGGAAGATAAGTATTTCTGGGGTTAGACGTAGGGAACTAG ATCAATTTAGTGGGTCGTTAAAATAGTAATATTAATAATAATGATAAAATGTTTAATAAC TGAGGTATTTGGGACCTGTGTGACAGTGTAACACCATCTACATAAATATAACCGTTAGTA TGAGATATGTTGTAATACAAATAGTAAGTATCAGGGGGCAATGTTTTAATCGTAGGTGAA AAAGCATAAGATTTGTTGCATTAAGGCAGATGTATTCATTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)