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Schistosoma mansoni
cluster # 5485 cluster # 5485       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5485#0 length = 614 sequences # 3  

consensusID : consensus_5485#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 614
fasta sequence
                              [GTTTAATTACAGGTCTAGATAATCGATTAGTTGTAACCTGTAAATATGCATTTGGTCCTCTTCCAGCTCTTGATACAGCTGACAGCGCAAATCGGTAGTAATAACCTGGAATAAGATTTGGTAATCTCAGCACTCTGCGACCAGGAAGATAAGCGGAAGGCCCATGGAAAGCACCACGTGGATGAGTTTGGATCCTTAATTCATAATGAGTTAGTGGCAAACCACCTGTCTCATTTGGAGGTTCAACACACAATTCAATTAAAGTTGCTTCAACTCTACAAGCTCTTAAAGCTGGTCTACCAGGATGGCTAGCTAGCTGCAGTCGAACATGCCCAGTAGCATGGCCTAATCTATTAGTTGCAGTACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATTCAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTAGTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTGGTCCCACCCATTTCCATTGAGGTGTTGGTTGTCCTAGTGCTTGACAAGCTATTTTAGAAGGTAAATGAGATAAACCATANNACACATATTTGCCAGGTTGA]

[+] EMBL CD123474             [GTTTAATTACAGGTCTAGATAATCGATTAGTTGTAACCTGTAAATATGCATTTGGTCCTCTTCCAGCTCTTGATACAGCTGACAGCGCAAATCGGTAGTAATAACCTGGAATAAGATTTGGTAATCTCAGCACTCTGCGACCAGGAAGATAAGCGGAAGGCCCATGGAAAGCACCACGTGGATGAGTTTGGATCCTTAATTCATAATGAGTTAGTGGCAAACCACCTGTCTCATTTGGAGGTTCAACACACAATTCAATTAAAGTTGCTTCAACTCTACAAGCTCTTAAAGCTGGTCTACCAGGATGGCTAGCTAGCTGCAGTCGAACATGCCCAGTAGCATGGCCTAATCTATTAGTTGCAGTACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATTCAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTAGTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTGGTCCCACCCATTTCCATTGAGGTGTTGGTTGTCCTAGTGCTTGACAAGCTATTTTAGAAGGTAAATGAGATAAACCATANNACACATATTTGCCAGGTTGA]
[+] EMBL CD123461             [GTTTAATTACAGGTCTAGATAATCGATTAGTTGTAACCTGTAAATATGCATTTGGTCCTCTTCCAGCTCTTGATACAGCTGACAGCGCAAATCGGTAGTAATAACCTGGAATAAGATTTGGTAATCTCAGCACCCTGCGACCAGGAAGATAAGCGAAAGGCCCATGGAAAGCACCACGTGGATGAGTTTGGATCCTTAATTCATAATGAGTTAGTGGCAAACCACCTGTCTCATTTGGAGGTTCAACACACAATTCAATTAAAGTTGCTTCAACTCTACAAGCTCTTAAAGCTGGTCTACCAGGATGGCTAGCTAGCTGCAGTCGAACATGCCCAGTAGCATGGCCTAATCTATTAGTTGCAGTACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATTCAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTAGTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTGGTCCCACCCATTTCCATTGAGGTGTTGGTTGTCCTAGTGCTTGACAAGCTA TTTAGAAGGTAAATGAGATAAACCATAaacaac                ]
[-] EMBL CD169747             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATTCAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTAGTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTG                                                                                                     ]


>consensus_5485#0 GTTTAATTACAGGTCTAGATAATCGATTAGTTGTAACCTGTAAATATGCATTTGGTCCTC TTCCAGCTCTTGATACAGCTGACAGCGCAAATCGGTAGTAATAACCTGGAATAAGATTTG GTAATCTCAGCACTCTGCGACCAGGAAGATAAGCGGAAGGCCCATGGAAAGCACCACGTG GATGAGTTTGGATCCTTAATTCATAATGAGTTAGTGGCAAACCACCTGTCTCATTTGGAG GTTCAACACACAATTCAATTAAAGTTGCTTCAACTCTACAAGCTCTTAAAGCTGGTCTAC CAGGATGGCTAGCTAGCTGCAGTCGAACATGCCCAGTAGCATGGCCTAATCTATTAGTTG CAGTACATGAATAAGTACCAAATACCCCGACATTCCAATAACCCGCGGGAACAGTTAATT CAGTTACAGAGTATTCACCGTCTTGATAGTCCATTTTGATATAACCTTTCGGATCATTTA GTTCACCTAATGGTACACTTGGTCCACTTTGTGGTCCCACCCATTTCCATTGAGGTGTTG GTTGTCCTAGTGCTTGACAAGCTATTTTAGAAGGTAAATGAGATAAACCATANNACACAT ATTTGCCAGGTTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)