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Schistosoma mansoni
cluster # 5488 cluster # 5488       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5488#0 length = 930 sequences # 3  
consensusID : consensus_5488#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 930
fasta sequence 
                              [GGCCACGAATTCGGCACGAGGTGTGATTAGATAACTGCTTCTATTTATTATTAGCTTTATTCAATATACAATATAGAATTCTCAGCATAAAGTATTTCAATTATTGGATCATTTCAACAGAATGTTATTTAAGCAGCATAAACAAGTCAACAATTGGAAATCATCACCCAATATAGATTTAATAAAATTTTTTATAGTTACTTGTTTACCACTAATTGAAATGATTATTACTACAATACTCATATGTAAATTTTGCCATGAATGTAAGAACATTAATCAATATAAATGGTATCTGATTGGTTTAATACCAAGCTCCATAATTTTCTCACTTCTAATGGTTATTGTTCGTGATATGCGTGCACGTTTCCCACTTAATTATGTCTTCCTGTTTCTAAATACTCTGTTATTATGTTACACATTTATACCACCAATACTAATGATAATGATCAAAAATATCATGATATCCTTTACTGTCGCAACAGTTATTGCATTTTCAATGATAGTACTCGGGATGTTCATCAAGGTTAAAATTCCTCCTGTTTTGTCGGCTGCAGTTTCAATCAGTTTCATTATTGTAGGGCTTGCAATATTTGTTGGACTGTATTTTGCCCAAAAACAAGTAGCGCTTCAGGTAATGGGAGCATTTTTTATTTTGTCAATTTTACCAATCCTATTATTTGTTGGCCAGCAGCTGAGAACTGAATACTTTCCACGGATGCTTCCCTCTGATTATATATTGTATGCTGGACTGATGTCAGCAATATATTTATTCATATTTTATTCAATCTCTGGGCAATTTTTTAATCACAGACATGAATCAACCCCTTATAGCTGGTAATATGTAAAATGTAACGCCTATTTTAGCAAGATGGTAATCCGTGATTTTATATTTACTCTCTATAAGGTATTCCCCATACAAACAAAAATAGT]

[+] EMBL CD084172             [GGCCACGAATTCGGCACGAGGTGTGATTAGATAACTGCTTCTATTTATTATTAGCTTTATTCAATATACAATATAGAATTCTCAGCATAAAGTATTTCAATTATTGGATCATTTCAACAGAATGTTATTTAAGCAGCATAAACAAGTCAACAATTGGAAATCATCACCCAATATAGATTTAATAAAATTTTTTATAGTTACTTGTTTACCACTAATTGAAATGATTATTACTACAATACTCATATGTAAATTTTGCCATGAATGTAAGAACATTAATCAATATAAATGGTATCTGATTGGTTTAATACCAAGCTCCATAATTTTCTCACTTCTAATGGTTATTGTTCGTGATATGCGTGCACGTTTCCCACTTAATTATGTCTTCCTGTTTCTAAATACTCTGTTATTATGTTACACATTTATACCACCAATACTAATGATAATGATCAAAAATATCATGATATCCTTTACTGTCGCAACAGTTATTGCATTTTCAATGATAGTACTCGGGATGTTCATCAAGGTTAAAATTCCTCCTGTTTTGTCGGCTGCAGTTTCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD077309             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CACCAATACTAATGATAATGATCAAAAATATCATGATATCCTTTACTGTCGCAACAGTTATTGCATTTTCAATGATAGTACTCGGGATGTTCATCAAGGTTAAAATTCCTCCTGTTTTGTCGGCTGCAGTTTCAATCAGTTTCATTATTGTAGGGCTTGCAATATTTGTTGGACTGTATTTTGCCCAAAAACAAGTAGCGCTTCAGGTAATGGGAGCATTTTTTATTTTGTCAATTTTACCAATCCTATTATTTGTTGGCCAGCAGCTGAGAACTGAATACTTTCCACGGATGCTTCCCTCTGATTATATATTGTATGCTGGACTGATGTCAGCAATATATTTATTCATATTTTATTCAATCTCTGGGCAATTTTTTAATCACAGACATGAATCAACCCCTTATAGCTGGTAATATGTAAAATGTAACGCCTATTTTAGCAAGATGGTAATCCGTGATTTTATATTTACTCTCTATAAGGTATTCCCCATACAAACAAAAATAGT]
[+] EMBL CD136399             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCAGTTTCATTATTGTAGGGCTTGCAATATCTGTTGGACTGTATCTTGCCCAAAAACAAGTAGCGCTTCAGGTAATGGGAGCATTTTTTATCTTGTCAATTTTACCAATCCTATTATTTGTTGGCCAGCAGCTGAGAACTGAATACTCTCCACGGATGCTTCCCTCTGATTATATATTGTATGCTGTACTGATGTCAGCAATATATTTATTCATATTCTATTCAATCTCTGTGCAATTTTTAAATCACAGACATGAATC                                                                                                               ]




>consensus_5488#0
GGCCACGAATTCGGCACGAGGTGTGATTAGATAACTGCTTCTATTTATTATTAGCTTTAT
TCAATATACAATATAGAATTCTCAGCATAAAGTATTTCAATTATTGGATCATTTCAACAG
AATGTTATTTAAGCAGCATAAACAAGTCAACAATTGGAAATCATCACCCAATATAGATTT
AATAAAATTTTTTATAGTTACTTGTTTACCACTAATTGAAATGATTATTACTACAATACT
CATATGTAAATTTTGCCATGAATGTAAGAACATTAATCAATATAAATGGTATCTGATTGG
TTTAATACCAAGCTCCATAATTTTCTCACTTCTAATGGTTATTGTTCGTGATATGCGTGC
ACGTTTCCCACTTAATTATGTCTTCCTGTTTCTAAATACTCTGTTATTATGTTACACATT
TATACCACCAATACTAATGATAATGATCAAAAATATCATGATATCCTTTACTGTCGCAAC
AGTTATTGCATTTTCAATGATAGTACTCGGGATGTTCATCAAGGTTAAAATTCCTCCTGT
TTTGTCGGCTGCAGTTTCAATCAGTTTCATTATTGTAGGGCTTGCAATATTTGTTGGACT
GTATTTTGCCCAAAAACAAGTAGCGCTTCAGGTAATGGGAGCATTTTTTATTTTGTCAAT
TTTACCAATCCTATTATTTGTTGGCCAGCAGCTGAGAACTGAATACTTTCCACGGATGCT
TCCCTCTGATTATATATTGTATGCTGGACTGATGTCAGCAATATATTTATTCATATTTTA
TTCAATCTCTGGGCAATTTTTTAATCACAGACATGAATCAACCCCTTATAGCTGGTAATA
TGTAAAATGTAACGCCTATTTTAGCAAGATGGTAATCCGTGATTTTATATTTACTCTCTA
TAAGGTATTCCCCATACAAACAAAAATAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)