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Schistosoma mansoni
cluster # 5496 cluster # 5496       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5496#0 length = 694 sequences # 3  

consensusID : consensus_5496#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 694
fasta sequence
                              [TTTTGTTGTCCCAATAATTAATAATTCTCCAGGACCTTGTGTAATAGTTCTTACAGCACCATATAATTCAGTTAATTCTTCAGTATGACCAGTTGGATTAAGAGCCGCATCAAAAAATACTAAACGACGATCTTTCCCACCACCAGATATAAGATGTCCATTATTTGTTAAACATAATGAAAATATACCACCTTCATGTACACCTTGACATATTT-GATTCACTGTATTTGTACCTCGTTTCCATGCAATAATATTCCCAGCAGAATCACCAGTCAGTAGATCACCATTTTCAGCAAATGTTAAACAAAGTATAAATTTCGGTTTCTCGATTGGTTGTTTACCATTTTCAAATATTCCCATCTTTTTGCTTAATGTACATCCATCGAATGTCCAAAATGCTAAATGACCTTTACCACCACTTACAAGTGTTGCATCGTCTAATGGATGAAATTCAACAGCTGTTATTGGTTCTGTGGAACATTTAGTCTCCGTTATTTTGCGACTTTTCTGCCAATCCCATATTGAAATTACATGATCCGTAGCTTCGTCAACTGCGCATAATTTAACTCCGCTATCCGTTTTTGAAAAAGATAAACAACATACAGAACGTTCAAATTCGCCTAAACCAATAATCTTCAATGTTTTCAAATCGACTGAACTCCAAATTCGTACATGTGGTTTTCCAAACTGTTTA]

[+] EMBL CD184920             [TTTTGTTGTCCCAATAATTAATAATTCTCCAGGACCTTGTGTAATAGTTCTTACAGCACCATATAATTCAGTTAATTCTTCAGTATGACCAGTTGGATTAAGAGCCGCATCAAAAAATACTAAACGACGATCTTTCCCACCACCAGATATAAGATGTCCATTATTTGTTAAACATAATGAAAATATACCACCTTCATGTACACCTTGACATATTT GATTTACTGTGTTTGTACCTCGTTTCCATGCAATAATATTCCCAGCAGAATCACCAGTCAGTAGATCACCATTTTCAGCGAATGTTAAACAAAGTATAAATTTCGGTTTCTCGATTGGTTGTTTACCATTTTCAAATATTCCCATCTTTTTGCTTAATGTACATCCATCGAATGTCCAAAATGCTAAATGACCTTTACCACCACTTACAAGTGTTGCATCGTCTAATGGATGAAATTCAACAGCT                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD166877             [                                                                                                                                               CAGATAT AGATGT CATTATTTGTTAAACATAATGAAAATATACCACCTTCATGTACACC TGACATATTTGGATTCACTGTATTTGTACCTCGTTTCCATGCAATAATATTCCCAGCAGAATCACCAGTCAGTAGATCACCATTTTCAGCAAATGTTAAACAAAGTATAAATTTCGGTTTCTCGATGGGTTGTTTACCATTTTCAAATATTCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD128954             [                                                                                                                                                 GATATAAGATGTCCATTATTTGTTAAACATAATGAAAATATACCACCTTCATGTACACCTTGACATATTT GATTCACTGTATTTGTACCTCGTTTCCATGCAATAATATTCCCAGCAGAATCACCAGTCAGTAGATCACCATTTTCAGCAAATGTTAAACAAAGTATAAATTTCGGTTTCTCGATTGGTTGTTTACCATTTTCAAATATTCCCATCTTTTTACTTAATGTACATCCATCGAATGTCCAAAATGCTAAATGACCTTTACCACCAGTTACAAGTGTTGCATCGTCTAATGGATGAAATTCAACAGCTGTTATTGGTTCTGTGGAACATTTAGTCTCCGTTATTTTGCGACTTTTCTGCCAATCCCATATTGAAATTACATGATCCGTAGCTTCGTCAACTGCGCATAATTTAACTCCGCTATCCGTTTTTGAAAAAGATAAACAACATACAGAACGTTCAAATTCGCCTAAACCAATAATCTTCAATGTTTTCAAATCGACTGAACTCCAAATTCGTACATGTGGTTTTCCAAACTGTTTA]


>consensus_5496#0 TTTTGTTGTCCCAATAATTAATAATTCTCCAGGACCTTGTGTAATAGTTCTTACAGCACC ATATAATTCAGTTAATTCTTCAGTATGACCAGTTGGATTAAGAGCCGCATCAAAAAATAC TAAACGACGATCTTTCCCACCACCAGATATAAGATGTCCATTATTTGTTAAACATAATGA AAATATACCACCTTCATGTACACCTTGACATATTTGATTCACTGTATTTGTACCTCGTTT CCATGCAATAATATTCCCAGCAGAATCACCAGTCAGTAGATCACCATTTTCAGCAAATGT TAAACAAAGTATAAATTTCGGTTTCTCGATTGGTTGTTTACCATTTTCAAATATTCCCAT CTTTTTGCTTAATGTACATCCATCGAATGTCCAAAATGCTAAATGACCTTTACCACCACT TACAAGTGTTGCATCGTCTAATGGATGAAATTCAACAGCTGTTATTGGTTCTGTGGAACA TTTAGTCTCCGTTATTTTGCGACTTTTCTGCCAATCCCATATTGAAATTACATGATCCGT AGCTTCGTCAACTGCGCATAATTTAACTCCGCTATCCGTTTTTGAAAAAGATAAACAACA TACAGAACGTTCAAATTCGCCTAAACCAATAATCTTCAATGTTTTCAAATCGACTGAACT CCAAATTCGTACATGTGGTTTTCCAAACTGTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)