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Schistosoma mansoni
cluster # 5502 cluster # 5502       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5502#0 length = 1007 sequences # 3  
consensusID : consensus_5502#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1007
fasta sequence 
                              [CTCTATATATTTTGTATCACATTATTAAAACAAACTAAATAAACATTATGTTCTACAAAATCTGAGATCACATTTGCGAACAGATGGAATAAAATATGAAAAGAAAGGATTACAAAAATATGCATTACTTCATACAGAATAAAAAACAGCTTTGAAATCACATCTAGTTACACATTATTCTTGAATAGTGACATAAAAAAATAGTTTAAATAAATGCAATATGTTACATAACTACTGTCTACATCAGTAATGATAATATGAAAGAAATTAGCTAAGAAATTTCTCTTCAATACCACGAGGTAAAAGTTGTTCATGAGGTAATAATACACCTTTGCGTTCCTTCATTACTCCAGTTTTTTCAAATAAAGATTCACCACAATGTTCGCATGGTTTTGAAGGATAACGGTCTAATGATACAGTTCGTTTTGAACACTGACGACAGCGAAAATAATGTTTGAAGCCCTTTAGATATTTAATTTGGTGATTACTGGTACGACAGTTAGGAGCTGTTTTAAGAGCACGATAGTTACACGTTTCACAGATTACATATGTACATGCTTCTTTATCTTGATTTACAAGTTTCTGTTCAAATTCATCACGTTTTTCTAAATTATTCAAACGAATTTGTTCAGTTTGATTNTC-AGTACATCAACTAGATTTTTATGCGCTGAACCTTGATTAATTTGTTTAGCTAATTCAGTTAATTTTTTTGTACGATTTTCTTTTAATAATTTTCGAGTTGTTTCATCATTTGAATGCTGATTAGTTTTTAAATCCAATGAAGATGATGAAGAAGAAGTGAGTTTCGCACGTTTTGAAGGATTATTATCGAGAATTTCAGATAAAACCGACACTTTTGAACAAGATGATACATTCGAAAAATTTGCTTTCCGTTTCAAAGTTTCCTTTTCAGTCATTTTCTTCACACCTCCTTGAGCATTAACTAAAGGTGTAGCACGCAAACGTGCAGCATCTGTTATCAATGATGATGATGACACAGGGCGCCT]

[+] EMBL CD073667             [CTCTATATATTTTGTATCACATTATTAAAACAAACTAAATAAACATTATGTTCTACAAAATCTGAGATCACATTTGCGAACAGATGGAATAAAATATGAAAAGAAAGGATTACAAAAATATGCATTACTTCATACAGAATAAAAAACAGCTTTGAAATCACATCTAGTTACACATTATTCTTGAATAGTGACATAAAAAAATAGTTTAAATAAATGCAATATGTTACATAACTACTGTCTACATCAGTAATGATAATATGAAAGAAATTAGCTAAGAAATTTCTCTTCAATACCACGAGGTAAAAGTTGTTCATGAGGTAATAATACACCTTTGCGTTCCTTCATTACTCCAGTTTTTTCAAATAAAGATTCACCACAATGTTCGCATGGTTTTGAAGGATAACGGTCTAATGATACAGTTCGTTTTGAACACTGACGACAGCGAAAATAATGTTTGAAGCCCTTTACATATTTAATTTGGTGATTACTGGTACGACAGTTAGGAGATGTTTTAAGAGCACGATAGTTACACGTTTCACAGATTACATATGTACATGCTTCTTTATCTTGATTTACAAGTTTCTGTTCAAATTCATCACGTTTTTCTAAATTATTCAAACGAATTTGTTCAGTTTGATTNTC AGTACATCAACTAGATTTTTATGCGCTGAACCTTGATTAATTTGTTTAGCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD075697             [CTCTATATATTTTGTACCACATTATTAAAACAAAATAAATAAACATTATGTTCTACAAAATCTGAGATCACATTTGCGAACGGATGGAATAAAATATGAAAAGAAAGGATTACAAAAATATGCAATACTTCATACAGAATAAAAAACAGCTTTGAAATCACATCTAGTTACACATTATTCTTGAATAGTGACATAAAAAAATAGTTTAAATAAATGCAATATGTTACATAACTACTGTCTACATCAGTAATGATAATATGAAAGAAATTAGCTAAGAAATTTCTCTTCAATACCACGAGGTAAAAGTTGTTCATGAGGTAATAATACACCTTTGCGTTCCTTCATTACTCCAGTTTTTTCAAATAAAGATTCACCACAATGTTCGCATGGTTTTGAAGGATAACGGTCTAATGATACAGTTCGTTTTGAACACTGACGACAGCGAAAATAATGTTTGAAGCCCTTTAGATATTTAATTTGGTGATTACTGGTACGACAGTTAGGAGCTGTTTT AGAGCACGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD082082             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGAGGTAATAATACACC TTGCGTTCCTTCA TACTCCAG TTTTTCAAATAAAGATTCACCACAATGTTCGCATGGTTNTGAAGGATAACGGTCTAATGATACAGTTCGTTTTGAACACTGACGACAGCGAAAATAATGTTTGAAGCCCTTTAGATATTTAATTTGGTGATTACTGGTACGACAGTTAGGAGCTGTTTTAAGAGCACGATAGTTACACGTTTCACAGATTACATATGTACATGCTTCTTTATCTTGATTTACAAGTTTCTGTTCAAATTCATCACGTTTTTCTAAATTATTCAAACGAATTTGTTCAGTTTGATTTTCAAGTACATCAACTAGATTTTTATGCGCTGAACCTTGATTAATTTGTTTAGCTAATTCAGTTAATTTTTTTGTACGATTTTCTTTTAATAATTTTCGAGTTGTTTCATCATTTGAATGCTGATTAGTTTTTAAATCCAATGAAGATGATGAAGAAGAAGTGAGTTTCGCACGTTTTGAAGGATTATTATCGAGAATTTCAGATAAAACCGACACTTTTGAACAAGATGATACATTCGAAAAATTTGCTTTCCGTTTCAAAGTTTCCTTTTCAGTCATTTTCTTCACACCTCCTTGAGCATTAACTAAAGGTGTAGCACGCAAACGTGCAGCATCTGTTATCAATGATGATGATGACACAGGGCGCCT]




>consensus_5502#0
CTCTATATATTTTGTATCACATTATTAAAACAAACTAAATAAACATTATGTTCTACAAAA
TCTGAGATCACATTTGCGAACAGATGGAATAAAATATGAAAAGAAAGGATTACAAAAATA
TGCATTACTTCATACAGAATAAAAAACAGCTTTGAAATCACATCTAGTTACACATTATTC
TTGAATAGTGACATAAAAAAATAGTTTAAATAAATGCAATATGTTACATAACTACTGTCT
ACATCAGTAATGATAATATGAAAGAAATTAGCTAAGAAATTTCTCTTCAATACCACGAGG
TAAAAGTTGTTCATGAGGTAATAATACACCTTTGCGTTCCTTCATTACTCCAGTTTTTTC
AAATAAAGATTCACCACAATGTTCGCATGGTTTTGAAGGATAACGGTCTAATGATACAGT
TCGTTTTGAACACTGACGACAGCGAAAATAATGTTTGAAGCCCTTTAGATATTTAATTTG
GTGATTACTGGTACGACAGTTAGGAGCTGTTTTAAGAGCACGATAGTTACACGTTTCACA
GATTACATATGTACATGCTTCTTTATCTTGATTTACAAGTTTCTGTTCAAATTCATCACG
TTTTTCTAAATTATTCAAACGAATTTGTTCAGTTTGATTNTCAGTACATCAACTAGATTT
TTATGCGCTGAACCTTGATTAATTTGTTTAGCTAATTCAGTTAATTTTTTTGTACGATTT
TCTTTTAATAATTTTCGAGTTGTTTCATCATTTGAATGCTGATTAGTTTTTAAATCCAAT
GAAGATGATGAAGAAGAAGTGAGTTTCGCACGTTTTGAAGGATTATTATCGAGAATTTCA
GATAAAACCGACACTTTTGAACAAGATGATACATTCGAAAAATTTGCTTTCCGTTTCAAA
GTTTCCTTTTCAGTCATTTTCTTCACACCTCCTTGAGCATTAACTAAAGGTGTAGCACGC
AAACGTGCAGCATCTGTTATCAATGATGATGATGACACAGGGCGCCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)