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Schistosoma mansoni
cluster # 5509 cluster # 5509       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5509#0 length = 849 sequences # 3  

consensusID : consensus_5509#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 849
fasta sequence
                              [AGAATAGACAAATCAGTCAACCTTTAACACAACTCTTTAACCCACGCTGCTATTCATCTGGAATACATGTACTTCGCTCCTTCCTTTGATTTCTTTACTATCTAAGTGAATATATATGTACTTATTTCAGCGCACATCTTAATTTATACCGTTGTAAATAAAATGTTTTGCATTGTTTTTTTCGTTCTTTCAATGTTCAGTCATTAATTTTATTACTATCATTATTTAATTTTCCCTTCTTTGTAGTATTCTTCACCAATGTTCCAATAATATTCTGTAGTATATCCCTTGCGATTTGGTATCAAAAATGATTATTTTTTCAATAGAAAGCAATGTTTTTTTCTTGCTCCGTCAGAAATAAAAAGTTTTGTGTCTGTTCCCATATTCAACTACATGCGCACAAATTTCCTCAATCATTTGAGTTCCAGGTGAAATTATAAGGTTGATCAGTTAATATGAACATTTATTTGTTCATTTGTATAATTTTATTCTGAGATCTGTTTATTTTCCCTTAATTTATCCTGCTATCCGTGTATTTTATTTGTTCCCACTATAATCCTGTATCATTGTTGGTGCGTATTTTGATTACTTACTTTAGATTCTCTGTCCTGTTACATGGTATCTTCCTGCTTATTCTTTATTATTCACCCCCTCCCCCACCTATAATCCCTGCCTAACTGTGATCTCTGTGAAAAAATAATTACCATATTTATAGTACCGTATTACCCTATTTTGTTCTTAACAGCTTACTACTTCTCTTCATCCTTCCTGTTTTTCTAATCCTTCACTCCATGTATTTGTTTTCTATGGAGTGTTATGGATCTGGTCATATTCATGATGCAATTAAGA]

[+] EMBL CD118592             [AGAATAGACAAATCAGTCAACCTTTAACACAACTCTTTAACCCACGCTGCTATTCATCTGGAATACATGTACTTCGCTCCTTCCTTTGATTTCTTTACTATCTAAGTGAATATATATGTACTTATTTCAGCGCACATCTTAATTTATACCGTTGTAAATAAAATGTTTTGCATTGTTTTTTTCGTTCTTTCAATGTTCAGTCATTAATTTTATTACTATCATTATTTAATTTTCCCTTCTTTGTAGTATTCTTCACCAATGTTCCAATAATATTCTGTAGTATATCCCTTGCGATTTGGTATCAAAAATGATTATTTTTTCAATAGAAAGCAATGTTTTTTTCTTGCTCCGTCAGAAATAAAAAGTTTTGTGTCTGTTCCCATATTCAACTACATGCGCACAAATTTCCTCAATCATTTGAGTTCCAGGTGAAATTATAAGGTTGATCAGTTAATATGAACATTTATTTGTTCATTTGTATAATTTTATTCTGAGATCTGTTTATTTTCCCTTAATTTATCCTGCTATCCGTGTATTNTATTTGTTCCCACTATAATCCTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD118645             [                                                                                                                          TATTTCAGCGCACATCTTAATTGATACCGTGNTAAATANAATGTTTTGCATTGTTTTNTTCGTTCTTTCAATGTTCAGTCATTAATTTTATTACTATCATTATTTAATTTTCCCTTCTTTGTAGTATTCTTCACCAATGTTCCAATAATATTCTGTAGTATATCCCTTGCGATTTGGTATCAAAAATGATTATTTTTTCAATAGAAAGCAATGTTTTTTTCTTGCTCCGTCAGGAATAAAAAGTTTTGTGTCTGTTCCCATATTCAACTACATGCGCACAAATTTCCTCAATCATTTGAGTTCCAGGTGAAATTATAAGGTTGATCAGTTAATATGAACATTTATTTGTTCATTTGTATAATTTTATTCTGAGATCTGTTTATTTTCCCTTAATTTATCCTGCTATCCGTGTATTTTATTTGTTCCCACTATAATCCTGTATCATTGTTGGTGCGTATTTTGATTACTTACTTTAGATTCTCTGTCCTGTTACATGGTATCTTCCTGCTTATTCTTTATTATTCACCCCCTCCCCCACCTATAATCCCTGCCTAACTGTGATCTCTGTGAAAAAATAATTACCATAT                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI976489             [                                                                                                                                                                                                                                               TTTGTAGTATTCTTCACCAATGTTCCAATAATATTCTGTAGTATATCCCTTGCGATTTGGTATCAAAAATGATTATTTTTTCAATAGAAAGCAATGTTTTTTTCTTGCTCCGTCAGAAATAAAAAGTTTTGTGTCTGTTCCCATATTCAACTACATGCGCACAAATTTCCTCAATCATTTGAGTTCCAGGTGAAATTATAAGGTTGATCAGTTAATATGAACATTTATTTGTTCATTTGTATAATTTTATTCTGAGATCTGTTTATTTTCCCTTAATTTATCCTGCTATCCGTGTATTTTATTTGTTCCCACTATAATCCTGTATCATTGTTGGTGCGTATTTTGATTACTTACTTTAGATTCTCTGTCCTGTTACATGGTATCTTCCTGCTTATTCTTTATTATTCACCCCCTCCCCCACCTATAATCCCTGCCTAACTGTGATCTCTGTGAAAAAATAATTACCATATTTATAGTACCGTATTACCCTATTTTGTTCTTAACAGCTTACTACTTCTCTTCATCCTTCCTGTTTTTCTAATCCTTCACTCCATGTATTTGTTTTCTATGGAGTGTTATGGATCTGGTCATATTCATGATGCAATTAAGA]


>consensus_5509#0 AGAATAGACAAATCAGTCAACCTTTAACACAACTCTTTAACCCACGCTGCTATTCATCTG GAATACATGTACTTCGCTCCTTCCTTTGATTTCTTTACTATCTAAGTGAATATATATGTA CTTATTTCAGCGCACATCTTAATTTATACCGTTGTAAATAAAATGTTTTGCATTGTTTTT TTCGTTCTTTCAATGTTCAGTCATTAATTTTATTACTATCATTATTTAATTTTCCCTTCT TTGTAGTATTCTTCACCAATGTTCCAATAATATTCTGTAGTATATCCCTTGCGATTTGGT ATCAAAAATGATTATTTTTTCAATAGAAAGCAATGTTTTTTTCTTGCTCCGTCAGAAATA AAAAGTTTTGTGTCTGTTCCCATATTCAACTACATGCGCACAAATTTCCTCAATCATTTG AGTTCCAGGTGAAATTATAAGGTTGATCAGTTAATATGAACATTTATTTGTTCATTTGTA TAATTTTATTCTGAGATCTGTTTATTTTCCCTTAATTTATCCTGCTATCCGTGTATTTTA TTTGTTCCCACTATAATCCTGTATCATTGTTGGTGCGTATTTTGATTACTTACTTTAGAT TCTCTGTCCTGTTACATGGTATCTTCCTGCTTATTCTTTATTATTCACCCCCTCCCCCAC CTATAATCCCTGCCTAACTGTGATCTCTGTGAAAAAATAATTACCATATTTATAGTACCG TATTACCCTATTTTGTTCTTAACAGCTTACTACTTCTCTTCATCCTTCCTGTTTTTCTAA TCCTTCACTCCATGTATTTGTTTTCTATGGAGTGTTATGGATCTGGTCATATTCATGATG CAATTAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)