cluster # 5513

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Schistosoma mansoni
cluster # 5513 cluster # 5513 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5513#0 length = 623 sequences # 3

consensusID : consensus_5513#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 623
fasta sequence

                              [CGCATTTGACGTTATCCGTCGTGTGTTGATGGATTATTTTAATTTTAAGGTTACTTATGTTTTAAATATTACTGATATCGATGACAAGATTATTAAGCGTGCTCGACAAAATCACTTGATCAGTGATTATCAGCTCAAAAATCCCGATCTAGCCACAGTAATCGGTGATATTACCAAAGGAATCCAGCGAATTAAGTCCAAAATTCCATCTGAGACGGATCCAGATAAAAAAAGCACACCTAAACAGTGAAGTAGATCGTCTAACATCCCTCCTATCCACTGTGCCTCTTGATG-AAGAGAATCCAGCTAATTACTTGATTCTGAATGCTCGTGATGCTATTGCCGATACCTTGGACGCAGCCTACGGTGCTTCTATCAGTGACCACCAAATATTCGAAGCGTTAGCTAGACATTTTGAAAAAGAATATCTTGTTGACATGGAGTGTTTAAACATCATTCCTCCATCAGTACTTGTTCGAGTTACGGAGTATATAGATCCAATAATAAAATACGTGAAACAAATTATAGATAATGTCTTCGCATATGTTGTTCCATCTGGATCGGTGTATTTTGATACAAATCGATTTGCAAGTTCTCCTATGCATTTCTATGCTAAGCTTGTG]

[+] EMBL CD187493             [CGCATTTGACGTTATCCGTCGTGTGTTGATGGATTATTTTAATTTTAAGGTTACTTATGTTTTAAATATTACTGATATCGATGACAAGATTATTAAGCGTGCTCGACAAAATCACTTGATCAGTGATTATCAGCTCAAAAATCCCGATCTAGCCACAGTAATCGGTGATATTACCAAAGGAATCCAGCGAATTAAGTCCAAAATTCCATCTGAGACGGATCCAGATAAAAAAAGCACACCTAAACAGTGAAGTAGATCGTCTAGCATCCCTCCTATCCACTGTGCCTCTTGATG AAGAGAATCCAGCTAATTACTTGATTCTGAATGCTCGTGATGCTATTGCCGATACCTTGGACGCAGCCTACGG                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD196703             [                                                                                          TATTAAGCGTGCTCGACAAAATCACTTGATCAGTGATTATCAGCTCAAAAATCCCGATCTAGCCACAGTAATCGGTGATATTACCAAAGGAATCCAGCGAATTAAGTCCAAAATTCCATCTGAGACGGATCCAGAT AAAAAAGCACACCTAAACAGTGAAGTAGATCGTCTAACATCCCTCCTATCCACTGTGCCTCTTGATG AAGAGAATCCAGCTAATTACTTGATTCTGAATGCTCGTGATGCTATTGCCGATACCTTGGACGCAGCCTACGGTGCTTCTATCAGTGACCACCAAATATTCGAAGCGTTAGCTAGACATTTTGAAAAAGAATATCTTGTTGACATGGAGTGTTTAAACATCATTCCTCCATCAGTACTTGTTCGAGTTACGGAGTATATAGATCCAATAATAAAATACGT                                                                                                             ]
[-] EMBL CD120263             [                                                                                                                                                                                                                                                                    CTAACATCCCTCCTATCCACTGTGCCTC TGATGAAAGAGAATCCAGCTAATTACTTGATTCTGAATGCTCGTGATGCTATTGCCGATACCTTGGACGCAGCCTACGGTGCTTCTATCAGTGACCACCAAATATTCGAAGCGTTAGCTAGACATTTTGAAAAAGAATATCTTGTTGACATGGAGTGTTTAAACATCATTCCTCCATCAGTACTTGTTCGAGTTACGGAGTATATAGATCCAATAATAAAATACGTGAAACAAATTATAGATAATGTCTTCGCATATGTTGTTCCATCTGGATCGGTGTATTTTGATACAAATCGATTTGCAAGTTCTCCTATGCATTTCTATGCTAAGCTTGTG]




>consensus_5513#0
CGCATTTGACGTTATCCGTCGTGTGTTGATGGATTATTTTAATTTTAAGGTTACTTATGT
TTTAAATATTACTGATATCGATGACAAGATTATTAAGCGTGCTCGACAAAATCACTTGAT
CAGTGATTATCAGCTCAAAAATCCCGATCTAGCCACAGTAATCGGTGATATTACCAAAGG
AATCCAGCGAATTAAGTCCAAAATTCCATCTGAGACGGATCCAGATAAAAAAAGCACACC
TAAACAGTGAAGTAGATCGTCTAACATCCCTCCTATCCACTGTGCCTCTTGATGAAGAGA
ATCCAGCTAATTACTTGATTCTGAATGCTCGTGATGCTATTGCCGATACCTTGGACGCAG
CCTACGGTGCTTCTATCAGTGACCACCAAATATTCGAAGCGTTAGCTAGACATTTTGAAA
AAGAATATCTTGTTGACATGGAGTGTTTAAACATCATTCCTCCATCAGTACTTGTTCGAG
TTACGGAGTATATAGATCCAATAATAAAATACGTGAAACAAATTATAGATAATGTCTTCG
CATATGTTGTTCCATCTGGATCGGTGTATTTTGATACAAATCGATTTGCAAGTTCTCCTA
TGCATTTCTATGCTAAGCTTGTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case