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Schistosoma mansoni
cluster # 5523 cluster # 5523       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5523#0 length = 957 sequences # 3  

consensusID : consensus_5523#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 957
fasta sequence
                              [NAAATAACACATCAGTCTCAGAAAATAATACTACCAACAACAATAGTAATGGTACTAATCAAACCAATAAAACCCGTCGAAGAAATAATTCCATGAATGTAAATTTTGAACGTGTTTTTGTTGAAATTGGTGGAATAACTGAATCACAGCCACATGGTACGGATCAGGTTGCTTTTTATCGTTTACGTCCTGACTATACAGTATTTTGTACCGCGGATTACATAAAACTCCCACAACAAGTTCGATATGTGAACTGTTGTGCGCATCAAGATACCAACCTGGTGTACATATTTTGGGAATCAACAAGTGAATTATCAGTTTTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCTTGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGGTTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCCCTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCATTAAAGTTCTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGTGATACACCAATATTGGGGTTGTACGAACTTTCATATCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAATTATGTTTATTTTAATGTGATACTTCCTAATCGTAGGACCTAAATATAAGAAGGATGTTTTCTGCCCACTTATTTTCATGTGATTTTTTAAAAATTTTTAACTGTGTCCATTATGCGAAGACATATATTTGCTCTTTAACTTGCCAAATTATTTCATTTTAATTGTCCCGCTGGTTCGGGTCGTACATTTGTTTTATGAGATATCACCTAGGCATTATAATCATGCAGAGTGTTATCCACAAAAATGCATTTATACTGT]

[+] EMBL CD079439             [NAAATAACACATCAGTCTCAGAAAATAATACTACCAACAACAATAGTAATGGTACTAATCAAACCAATAAAACCCGTCGAAGAAATAATTCCATGAATGTAAATTTTGAACGTGTTTTTGTTGAAATTGGTGGAATAACTGAATCACAGCCACATGGTACGGATCAGGTTGCTTTTTATCGTTTACGTCCTGACTATACAGTATTTTGTACCGCGGATTACATAAAACTCCCACAACAAGTTCGATATGTGAACTGTTGTGCGCATCAAGATACCAACCTGGTGTACATATTTTGGGAATCAACAAGTGAATTATCAGTTTTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCTTGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGGTTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCCCTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCATTAAAGTTCTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGTGATACACCAATATTGNGGTTGTACGAACTTTCATATCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAA TATGTTTATTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD073710             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACAAGTGAATTATCAGTTTTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCTTGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGGTTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCCCTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCATTAAAGTTTTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGTGATACACCAATATTGGGGTTGTACGAACTTTCATATCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAATTATGTTTATTTTAATGTGATACTTCCTAATCGTAGGACCTAAATATAAGAAGGATGTTTTCTGCCCACTTATTTTCATGTGATTTTTTAAAAATTTTTAACTGTGTCCATTATGCGAAGACATATATTTGCTCTTTAACTTGCCAAATTATTTCATTTTAATTGTCCCGCTGGTTCGGGTCGTACATTTGTTTTATGAGATATCACCTAGGCATTATAATCATGCAGAGTGTTATCCACAAAAATGCATTTATACTGT]
[-] EMBL CD074410             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTGAATANTCAGTTNTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCTTGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGGTTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCCCTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCATTAAAGTTCTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGTGATACACCAATATTGGGGTTGTACGAACTTTCATATCC    TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAATTATGTTTATTTTAATGTGATACTTCCTAATCGTAGGACCTAAATAT ATAAGGATGTTTTCTGCCCACTTATTTTCATGTGATTTTTTAAAAATTTTTAACTGTGTCCATTATGCGAAGACATATATTTGCTCTTTAACTTGCCAAATTATTTCATTTTAATTGTCCCGCTGGTTCGGGTCGTACATTTGTTTTATGAGATATCACCTAGGCATTATAATCAT CAGAGTGTTATCCACAAAAATGCATTTAT     ]


>consensus_5523#0 NAAATAACACATCAGTCTCAGAAAATAATACTACCAACAACAATAGTAATGGTACTAATC AAACCAATAAAACCCGTCGAAGAAATAATTCCATGAATGTAAATTTTGAACGTGTTTTTG TTGAAATTGGTGGAATAACTGAATCACAGCCACATGGTACGGATCAGGTTGCTTTTTATC GTTTACGTCCTGACTATACAGTATTTTGTACCGCGGATTACATAAAACTCCCACAACAAG TTCGATATGTGAACTGTTGTGCGCATCAAGATACCAACCTGGTGTACATATTTTGGGAAT CAACAAGTGAATTATCAGTTTTGGATCTTCATCGTCACACACTACGCTCACTAGCTCCCT TGGTTTCTTCCTCTACTTCATCTCCAAACGAAGCACGGATTCATGCTGGGTTATCGTGGG TTGGAGAGCATTTGTATGTAATTGGAGGATTTAGTGAGTTTGTTGGTGATGATCGACGCC CTACTGGTCCACGAGATGATGTCCACTGCTATGATCCGACAACGAATACATGGTCTTGCA TTAAAGTTCTAAATACAACAGTCCCTCGAGCTATCTTCGGTTGTGTTTGTCTCAATATGT GATACACCAATATTGGGGTTGTACGAACTTTCATATCCTATATATATATATATATATATA TATATATATATATATATATATATATATCATAGCAAAAATTATGTTTATTTTAATGTGATA CTTCCTAATCGTAGGACCTAAATATAAGAAGGATGTTTTCTGCCCACTTATTTTCATGTG ATTTTTTAAAAATTTTTAACTGTGTCCATTATGCGAAGACATATATTTGCTCTTTAACTT GCCAAATTATTTCATTTTAATTGTCCCGCTGGTTCGGGTCGTACATTTGTTTTATGAGAT ATCACCTAGGCATTATAATCATGCAGAGTGTTATCCACAAAAATGCATTTATACTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)