cluster # 5541

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Schistosoma mansoni
cluster # 5541 cluster # 5541 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5541#0 length = 645 sequences # 3

consensusID : consensus_5541#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 645
fasta sequence

                              [AAGCTCATTTACTTGGACCTTTATCATACAATGATGTTTGTCTATTACAAGGGAGTGTTGAATCAATCCTTCCCAGAAAATCACAACACAATATTCAATTACGTAAACAACAACAACAACCAATAGATGTTAGTGCTAAAAATTGGGAGGCTCGTTTACGTCCCGTATTTAAAATTTTATTGAAACTATCCAGTGGTAATATTAGTATTCATAACAATGCTAATAATACCTCTAATCCATCCGTTCCTGTTGTGCAAAATATTTTGTTACCACTTGTGGAATTATTGTATGAGCTAGTTTCATATCAACCTAGTCCAAATAGTTTAGTATTTACAAAACGATCACTTGTAACAATTTTTGCCACTAATAAACAATCAAATATCGTCAACAATAATATTTCTTCATCACTACCTATTACGCAACAAATTGGAACAGACGTTGAAAGTTTTGGTCATCATCAGTTCAATCCAACTACCTCACCGGATAATGATGTTCATTGTTCACCAGGTTCAACTCCTTTATCATTATTTAGCAATGTTTCTCGTTCAATATCATTCCATCATTTCAGTCATGGTTGACTAATCAACCTTACGCATCATTTATGGCTTGGAGAGAACGTATGTCGATACAAACGTATGCAGCATC]

[-] EMBL CD110912             [AAGCTCATTTACTTGGACCTTTATCATACAATGATGTTTGTCTATTACAAGGGAGTGTTGAATCAATCCTTCCCAGAAAATCACAACACAATATTCAATTACGTAAACAACAACAACAACCAATAGATGTTAGTGCTAAAAATTGGGAGGCTCGTTTACGTCCCGTATTTAAAATTTTATTGAAACTATCCAGTGGTAATATTAGTATTCATAACAATGCTAATAATACCTCTAATCCATCCGTTCCTGTTGTGCAAAATATTTTGTTACCACTTGTGGAATTATTGTATGAGCTAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD202554             [                                                                     TTCCCAGAAAATCACAACACAATATTCAATTACGTAAACAACAACAACAACCAATAGATGTTAGTGCTAAAAATTGGGAGGCTCGTTTACGTCCCGTATTTAAAATTTTATTGAAACTATCCAGTGGTAATATTAGTATTCATAACAATGCTAATAATACCTCTAATCCATCCGTTCCTGTTGTGCAAAATATTTTGTTACCACTTGTGGAATTATTGTATGAGCTAGTTTCATATCAACCTAGTCCAAATAGTTTAGTATTTACAAAACGATCACTTGTAACAATTTTTGCCACTAATAAACAATCAAATATCGTCAACAATAATATTTCTTCATCACTACCTATTACGCAACAAATTGGAACAGACGTTGAAAGTTTTGGTCATCATCAGTTCAATCCAACTACCTCACCGGATAATGATGTTCATTGTTCACCAGGTTCAACTCCTTTATCATTATTTAGCAATGTTTCTCGTTCAATATCATTCCATCATTTCAGTCATGGTTGACTAATCAACCTTACGCATCATTTATGGCTTGGAGAGAACGTATGTCGATACAAACGTATGCAGCATC]
[-] EMBL CD202455             [                                                                      TCCCAGAAAATCACAACACAATATTCAATTACGTAAACCACCACAACAACCCATAGATGTTAGTGCTAAAAATTGGGAGGCTCGTTTACGTCCCGTATTTAAAATTTTATTGAAACTATCCAGTGGTAATATTAGTATTCATAACAATGGTAATAATACCTCTAATCCATCCGTTCCTGTTGTGCAAAATATTTTGTTACCACTTGTGGAATTATTGTATGAGCTAGTTTCACATCACCCTAGTGCAAATAGTTTAGTGCTTACAAAACGATCTCTTGTGACAATTTTTGCCACTAATAATCACTCTCATATCGTCGTCAATAATATTTCTTCTTCACTACCT                                                                                                                                                                                                                                        ]




>consensus_5541#0
AAGCTCATTTACTTGGACCTTTATCATACAATGATGTTTGTCTATTACAAGGGAGTGTTG
AATCAATCCTTCCCAGAAAATCACAACACAATATTCAATTACGTAAACAACAACAACAAC
CAATAGATGTTAGTGCTAAAAATTGGGAGGCTCGTTTACGTCCCGTATTTAAAATTTTAT
TGAAACTATCCAGTGGTAATATTAGTATTCATAACAATGCTAATAATACCTCTAATCCAT
CCGTTCCTGTTGTGCAAAATATTTTGTTACCACTTGTGGAATTATTGTATGAGCTAGTTT
CATATCAACCTAGTCCAAATAGTTTAGTATTTACAAAACGATCACTTGTAACAATTTTTG
CCACTAATAAACAATCAAATATCGTCAACAATAATATTTCTTCATCACTACCTATTACGC
AACAAATTGGAACAGACGTTGAAAGTTTTGGTCATCATCAGTTCAATCCAACTACCTCAC
CGGATAATGATGTTCATTGTTCACCAGGTTCAACTCCTTTATCATTATTTAGCAATGTTT
CTCGTTCAATATCATTCCATCATTTCAGTCATGGTTGACTAATCAACCTTACGCATCATT
TATGGCTTGGAGAGAACGTATGTCGATACAAACGTATGCAGCATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case