cluster # 5549

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Schistosoma mansoni
cluster # 5549 cluster # 5549 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5549#0 length = 1065 sequences # 3
consensusID : consensus_5549#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1065
fasta sequence
                              [CTACTGTGTCCAGATATCCCTGAATAGGGCAGAACTCACATCCTGGATTACACTTCGAGCCACCCTCAATTTGTGCTTTAAAAATTATTAACAGTTGTTTGAATATCATATGGACATTATGATGATAAGTTTTGTACGCGGATTTAAGAACGTTTGTTGTAACTATAGTCAATCAATCACTCGATGCTCACATTGTTTACTGTCTACAATGTTAGTTTTAGTTACTGTATGTCATTCTGCTTTTCTTAAATCATGAAGTCCGTCTCATGCAAATCTTCCAAGGTTTTCTCTTTCTGGGGATTCTTTATAAATTTTCATTTAGCAACCAATACTTGTGAATGACTAACTACTTTTCGTATGTCAAAACCGGACAATTATGAAAATGGAAAACATTGTTTTAAAAGAGATTTGTTGATATTGTTTGACTACATTGGCGCTATATCCCTGCATAATAAGCTTAATATTTTTAGTTACTCAGATTATTTACAGCGGTTATTTTACTTTTCATAACCTTTAAAGAATGATATTTCACCGTCTGTGGTATGAGCTACTTTCCTATTGATCTATTC-AAATTCCATACTGAATTANATCAAGTTCTTTTTTGAAAGGATTCATTTTNTGCTACGTAATATTTAAATACCATATTCAAATAAAAAAATAAGCTGTTTTACTTCGTTGAAAAGTACCAATATGCATAAATTATTAGTTAATTACCATAAAAATGAGAAGATATCTCTGACATGTGTCTAATTGTTTTGTACAAAAATATCTAACAAGCATAACGCCACATAGAACAGATGGGATGTAGTTAGCGATAGAATCTAGGACACACATATCGTCCTATTTATCTAAATTACTTACCAGACAAATGAAATCATTTTGTCTACTTCTCATCAATAAACTAATTTCAAGTTATTTAAGCATGGTCTATGATTTGAAAAAGAAGTAGTTCAAAGTTTATGGCGATCATGATATTTCTGAGTTTTTCGTAGTCCTTCATTTGTTTATATGTCTGTTTGTTTATTTACTGATTTATTCGTCGCTTTAACTACCGTATAACGGACT]

[+] EMBL CD085097             [CTACTGTGTCCAGATATCCCTGAATAGGGCAGAACTCACATCCTGGATTACACTTCGAGCCACCCTCAATTTGTGCTTTAAAAATTATTAACAGTTGTTTGAATATCATATGGACATTATGATGATAAGTTTTGTACGCGGATTTAAGAACGTTTGTTGTAACTATAGTCAATCAATCACTCGATGCTCACATTGTTTACTGTCTACAATGTTAGTTTTAGTTACTGTATGTCATTCTGCTTTTCTTAAATCATGAAGTCCGTCTCATGCAAATCTTCCAAGGTTTTCTCTTTCTGGGGATTCTTTATAAATTTTCATTTAGCAACCAATACTTGTGAATGACTAACTACTTTTCGTATGTCAAAACCGGACAATTATGAAAATGGAAAACATTGTTTTAAAAGAGATTTGTTGATATTGTTTGACTACATTGGCGCTATATCCCTGCATAATAAGCTTAATATTTTTAGTTACTCAGATTATTTACAGCGGTTATTTTACTTTTCATAACCTTTAAAGAATGATATTTCACCGTCTGTGGTATGAGCTACTTTCCTATTGATCTATTC AAATTCCATACTGAATTANATCAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD085323             [CTACTGTGTCCAGATATCCCTGAATAGGGCAGAACTCACATCCTGGATTACACTTCGAGCCACCCTCAATTTGTGCTTTAAAAATTATTAACAGTTGTTTGAATATCATATGGACATTATGATGATAAGTTTTGTACGCGGATTTAAGAACGTTTGTTGTAACTATAGTCAATCAATCACTCGATGCTCACATTGTTTACTGTCTACAATGTTAGTTTTAGTTACTGTATGTCATTCTGCTTTTCTTAAATCATGAAGCCCGTCTCATGCAAATCTTCCAAGGTTTTCTCTTTCTGGGGATTCTTTATAAATTTTCATTTAGCAACCAATACTTGTGAATGACTAACTACTTTTCGTATGTCAAAACCGGACAATTATGAAAATGGAAAACATTGTTTTAAAAGAGATTTGTTGATATTGTTTGACTACATTGGCGCTATATCCCTGCATAATAAGCTTAATATTTTTAGTTACTCAGATTATTTACAGCGGTTATTTTCCTCTTCATAACCTATAAAGAATGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD085113             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCATANCCTTTAAAGAATGATATTTCACCGTCTGTGGTATGAGCTACTTTCCTATTGATCTATTCAAAATTCCATACTGAATTAAATCAAGTTCTTTTTTGAAAGGATTCATTTTNTGCTACGTAATATTTAAATACCATATTCAAATAAAAAAATAAGCTGTTTTACTTCGTTGAAAAGTACCAATATGCATAAATTATTAGTTAATTACCATAAAAATGAGAAGATATCTCTGACATGTGTCTAATTGTTTTGTACAAAAATATCTAACAAGCATAACGCCACATAGAACAGATGGGATGTAGTTAGCGATAGAATCTAGGACACACATATCGTCCTATTTATCTAAATTACTTACCAGACAAATGAAATCATTTTGTCTACTTCTCATCAATAAACTAATTTCAAGTTATTTAAGCATGGTCTATGATTTGAAAAAGAAGTAGTTCAAAGTTTATGGCGATCATGATATTTCTGAGTTTTTCGTAGTCCTTCATTTGTTTATATGTCTGTTTGTTTATTTACTGATTTATTCGTCGCTTTAACTACCGTATAACGGACT]




>consensus_5549#0
CTACTGTGTCCAGATATCCCTGAATAGGGCAGAACTCACATCCTGGATTACACTTCGAGC
CACCCTCAATTTGTGCTTTAAAAATTATTAACAGTTGTTTGAATATCATATGGACATTAT
GATGATAAGTTTTGTACGCGGATTTAAGAACGTTTGTTGTAACTATAGTCAATCAATCAC
TCGATGCTCACATTGTTTACTGTCTACAATGTTAGTTTTAGTTACTGTATGTCATTCTGC
TTTTCTTAAATCATGAAGTCCGTCTCATGCAAATCTTCCAAGGTTTTCTCTTTCTGGGGA
TTCTTTATAAATTTTCATTTAGCAACCAATACTTGTGAATGACTAACTACTTTTCGTATG
TCAAAACCGGACAATTATGAAAATGGAAAACATTGTTTTAAAAGAGATTTGTTGATATTG
TTTGACTACATTGGCGCTATATCCCTGCATAATAAGCTTAATATTTTTAGTTACTCAGAT
TATTTACAGCGGTTATTTTACTTTTCATAACCTTTAAAGAATGATATTTCACCGTCTGTG
GTATGAGCTACTTTCCTATTGATCTATTCAAATTCCATACTGAATTANATCAAGTTCTTT
TTTGAAAGGATTCATTTTNTGCTACGTAATATTTAAATACCATATTCAAATAAAAAAATA
AGCTGTTTTACTTCGTTGAAAAGTACCAATATGCATAAATTATTAGTTAATTACCATAAA
AATGAGAAGATATCTCTGACATGTGTCTAATTGTTTTGTACAAAAATATCTAACAAGCAT
AACGCCACATAGAACAGATGGGATGTAGTTAGCGATAGAATCTAGGACACACATATCGTC
CTATTTATCTAAATTACTTACCAGACAAATGAAATCATTTTGTCTACTTCTCATCAATAA
ACTAATTTCAAGTTATTTAAGCATGGTCTATGATTTGAAAAAGAAGTAGTTCAAAGTTTA
TGGCGATCATGATATTTCTGAGTTTTTCGTAGTCCTTCATTTGTTTATATGTCTGTTTGT
TTATTTACTGATTTATTCGTCGCTTTAACTACCGTATAACGGACT
clustalw multiple alignements is not computed in this case