cluster # 5555

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Schistosoma mansoni
cluster # 5555 cluster # 5555 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5555#0 length = 642 sequences # 3

consensusID : consensus_5555#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 642
fasta sequence

                              [CAAAATTTGGCACGAGGGTGGAGCTCAAAAACACTCATCCGGTTTAAAACCAAGTTAGGGATTAAGATTATTAGTTAGCTAACCCTACGGTCTGGTTGACACTGGTAATAGTTTTCAAAGCTAAAGTGACACTTTGCTAAATAAGCTATTAAAGTATGCTTCAGAAACATTCTGGTCCGCCTCTTGGCTTAGAACGGATTCATCGATATTTTTGTTACGTTTGTGGAACTCTTCTTCCACATAAGTTGGAAGTTAATGATTTATTAGTATGCCGTAAATGTAAAACTTCTACATGTATGCATTGGTTCAGTAATATGGATGCAACTTTCAATACTG-AAGCCAAATCTAGCAAAATAGGCCAATTTAATAACGATGAGTATGAATCTACATCTTTATTCTTTCCATCGATGATTAGAGGGGCTAAAAAGATCTTAAGATCAGAAATTGCTTTAAAAGAGGCTTTGGAGTCACAATTTGAAAACAGTACATCACAATCAACATTTGATGGACCATCTATTAGAAAAGAATGTGCCTATTGCGGTAATGATAGAATGACTTATGTTACACTTCAAACTCGCTCAGCAGATGAAGGACAAACTGTAATATATACCTGTACCCAATGTTCTAAAAAAGAAATTGANA]

[+] EMBL CD079517             [CAAAATTTGGCACGAGGGTGCAGCTCAAAAACACTCATCCGGTTTAAAACCAAGTTAGGGATTAAGATTATTAGTTAGCTAACCCTACGGTCTGGTTGACACTGGTAATAGTTTTCAAAGCTAAAGTGACACTTTGCTAAATAAGCTATTAAAGTATGCTTCAGAAACATTCTGGTCCGCCTCTTGGCTTAGAACGGATTCATCGATATTTTTGTTACGTTTGTGGAACTCTTCTTCCACATAAGTTGGAAGTTAATGATTTATTAGTATGCCGTAAATGTAAAACTTCTACATGTATGCATTGGTTCAGTAATATGGATGCAACTTTCAATACTG AAGCCAAATCTAGCAAAATAGGCCAATTTAATAACGATGAGTATGAATCTACATCTTTATTCTTTCCATCGATGATTAGAGGGGCTAAAAAGATCTTAAGATCAGAAATTGCTTTAAAAGAGGCTTTGGAGTCACAATTTGAAAACAGTACATCACAATCAACATTTGATGGACCATCTATTAGAAAAGAATGTGCCTATTGCGGTAATGATAGAATGACTTATGTTACACTTCAAACTCGCTCAGCAGATGAAGGACAAACTGTAATATATACCTGTACCCAATGTTCTAAAAAAGAAATTGANA]
[-] EMBL CD073784             [                    GAGCTCAAAAACACTCATCCGGTTTAAAACCAAGTTAGGGATTAAGATTATTAGTTAGCTAACCCTACGGTCTGGTTGACACTGGTAATAGTTTTCAAAGCTAAAGTGACACTTTGCTAAATAAGCTATTAAAGTATGCTTCAGAAACATTTTGGTCCGCCTCTTGGCTTAGAACGGATTCATCGATATTTTTGTTACGTTTGTGGAACTCTTCTTCCACATAAGTTGGAAGTTAATGATTTATTAGTATGCCGTAAATGTAAAACTTCTACATGTATGCATTGGTTCAGTAATATGGATGCAACTTTCAATACTG AAGCCAAATCTAGCAAAATAGGCCAATTTAATAACGATGAGTATGAATCTACATCTTTATTCTTTCCATCGATGATTAGAGGGGCTAAAAAGATTTTAAGATCAGAAATTGCTTTAAAAAAGGCTTTGGAGTCACAATTTGAAAACAGTACATCACAATCAACATTTGATGGACCATTTATTAGAAAAGAATGTGCCTATTGCGGTAATGATAGAATGACTTATGTTACACTTCAAACTCGCTCAGCAGATGAAGGACAAACTGTAATATATACCTGGGCCCAATGTTCTAAAAAAGAAATTGAa ]
[+] EMBL AI975605             [                    GAGCTCAAAAACACTCATCCGGTTTAAAACCAAGTTAGGGATTAAGATTATTAGTTAGCTAACCCTACGGTCTGGTTGACACTGGTAATAGTTTTCAAAGCTAAAGTGACACTTTGCTAAATAAGCTATTAAAGTATGCTTCAGAAACATTCTGGTCCGCCTCTTGGCTTAGAACGGATTCATCGATATTTTTGCTACGTTTGTGGAACTCTTCTTCCACATAAGTTGGAAGTTAATGATTTATTAGTATGCCGTAAATGTAAAACTTCTACATGTATGCATTGGTTCAGTAATATGGATGCAACTGTCAATACTGAAAGCCAAATCTAGCATAATAGGCCAATTTAATAACGATGAGTATGAATCTACATCTCTATTCTTTCCATCGATGATTAGAGGGGCTAAATAGATCTTAAGATCAGACATTGCTTTAAAAGAGGCTTTGGAGTCACAATTTG AAACAGTACATCACAATCAACATTTGATGGA                                                                                                                                     ]




>consensus_5555#0
CAAAATTTGGCACGAGGGTGGAGCTCAAAAACACTCATCCGGTTTAAAACCAAGTTAGGG
ATTAAGATTATTAGTTAGCTAACCCTACGGTCTGGTTGACACTGGTAATAGTTTTCAAAG
CTAAAGTGACACTTTGCTAAATAAGCTATTAAAGTATGCTTCAGAAACATTCTGGTCCGC
CTCTTGGCTTAGAACGGATTCATCGATATTTTTGTTACGTTTGTGGAACTCTTCTTCCAC
ATAAGTTGGAAGTTAATGATTTATTAGTATGCCGTAAATGTAAAACTTCTACATGTATGC
ATTGGTTCAGTAATATGGATGCAACTTTCAATACTGAAGCCAAATCTAGCAAAATAGGCC
AATTTAATAACGATGAGTATGAATCTACATCTTTATTCTTTCCATCGATGATTAGAGGGG
CTAAAAAGATCTTAAGATCAGAAATTGCTTTAAAAGAGGCTTTGGAGTCACAATTTGAAA
ACAGTACATCACAATCAACATTTGATGGACCATCTATTAGAAAAGAATGTGCCTATTGCG
GTAATGATAGAATGACTTATGTTACACTTCAAACTCGCTCAGCAGATGAAGGACAAACTG
TAATATATACCTGTACCCAATGTTCTAAAAAAGAAATTGANA

clustalw multiple alignements is not computed in this case