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Schistosoma mansoni
cluster # 5567 cluster # 5567       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5567#0 length = 1651 sequences # 3  

consensusID : consensus_5567#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1651
fasta sequence
                              [AGGAACCATCCTAAAACATACTCTCAAATCATTACCTAAGGAGAACAAGCTAATTTATTTCTTATGGTGGTTACGATTATATCACCAACTAAATGGCACTTTACCCCAAGAGAACCTATTTTCTACTGCCAATTCACCATGCTTCTCCAAAACAGTCCTTCTGTCTAACCTGGAAATTATTGAAATGGCAGCCACTGAAACTGGTATTTCTAAAAATTTATCTCAGTTACTGGAATCATTTGAAAATATTAAGACTGATATTAGCTTCACTTGCTTCCTGTATATCACTCATTTATACATCCAAACTCTTAATGCAGATTCCAAATTTAAAACTGCAGCAGATATAGCACTGACAGTAGCATTACATTCCCCTGAGTTTGTAGATGATTTATTTTTCCCATCTGCAGTATATTCTCTATTTTCCTTAGATTCATCTCTTGACTGGACAAGCTTGATAAGTAATGTACCTGACAATTTACGAGTTAACCTTAATTTGGCCCATCGGATTGAATTTGGATTCTTGATAACATGTTTAAATCGGCGTAGAAAAACTTTAAATTCTACGGAATTCCATCTTATCGAGTGTTTAGGCAACTTAATCTTCCTTCCAAAAGATGATTGCGAAAGCGTTATTTCAGCGTATGAAAATTTGTTGAATATAAAGTCCAGTAATAGCAGTCTTGTTAACTTTAAAGTGTGTCCACGAAGTTCCACATATTTATGGCTCAGTTATTGTCTGTATACCATTATTCATTGCCTAAATTATGGTGAAGTTTTAGACCACTTGATTAGTCACTATAAGTCATGCATCATGAGTTGTGCAAACGAAGATCCAAATTATGTTTTCATTCGTCTTCTAGCCCTAATGAGTATCTTATTAGCAAGTCATGTGAATCAGTTAGACAATTCAACTTATCCTACTATCATAAAGTTACTGTTCATCGATAACCCTTTCAAGTTGGATCGTAAGTTACTTCCAGCGTACTTTCTTGAATCAATTCAACAAATTAATTTAGGGCTTCTTCCTCCCGGGATTCGTCACGATATATGTGTGCAACTTGTTGAAATATATGGTGCTTCTCTGGTTCCTTCTTTGTGTCGGACTTTATGTGCTCTAGGTGACCACTTTTTAGCTCAAAGTCTGTGTGCAATCGGATGTTTAGATAGACCCGATAATGAAGACTTCTGGCTTTTGTATGCTTCTACAACATTTAAAACCCTCTCACATATACGATCATCTGAACAGTTATCAACTCTTCTAGAAATTCTAATAAATGCAACTTCTGTGGTGACCTCAAGTTCTCGACTTTGGAAATATTATGCACTTGCTGTTCGCATTGCCAAGGTATCAGTAGAGCAAATAACGAGCCGTGCGAAGTCTGTTGGAATGTATGATCTCATTTCTAGTAGTCTGAACGATGACAACCCTACAAAATTTTTATCGGAACTTGGACTCCTCTGTGATGAAAGATCTATGGACAGAAAAAGTTAGGATTGAACCATTAAAGAGAGTTACATACACAAATTTTAATGCTGGGAACATTTTGGTTTGTTAAGTGCTATATGTAGAGTCCAATAGACCGGTATGAAGATCGCTTTCGGTCATGAACTGTACAGTAATTTATATATGTAAATAAAATTCCATTTGTAA]

[+] EMBL CD079555             [AGGAACCATCCTAAAACATACTCTCAAATCATTACCTAAGGAGAACAAGCTAATTTATTTCTTATGGTGGTTACGATTATATCACCAACTAAATGGCACTTTACCCCAAGAGAACCTATTTTCTACTGCCAATTCACCATGCTTCTCCAAAACAGTCCTTCTGTCTAACCTGGAAATTATTGAAATGGCAGCCACTGAAACTGGTATTTCTAAAAATTTATCTCAGTTACTGGAATCATTTGAAAATATTAAGACTGATATTAGCTTCACTTGCTTCCTGTATATCACTCATTTATACATCCAAACTCTTAATGCAGATTCCAAATTTAAAACTGCAGCAGATATAGCACTGACAGTAGCATTACATTCCCCTGAGTTTGTAGATGATTTATTTTTCCCATCTGCAGTATATTCTCTATTTTCCTTAGATTCATCTCTTGACTGGACAAGCTTGATAAGTAATGTACCTGACAATTTACGAGTTAACCTTAATTTGGCCCATCGGATTGAATTTGGATTCTTGATAACATGTTTAAATCGGCGTAGAAAAACTTTAAATTCTACGGAATTCCATCTTATCGAGTGTTTAGGCAACTTAATCTTCCTTCCAAAAGATGATTGCGAAAGCGTTATTTCAGCGTATGAAAATTTGTTGAATATAAAGTCCAGTAATAGCAGTCTTGTTAACTTTAAAGTGTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD156901             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACCTTAATTTGGCCCATCGGATTGAATTTGGATTCTTGATAACATG TTAAATCGGCGTAGAAAAACTNTAAATTCTACGGAATTCCATCTTATCGAGTGTTTAGGCAACTTAATCTTCCTTCCAAAAGATGATTGCGAAAGCGTTATTTCAGCGTATGAAAATTTGTTGAATATAAAGTCCAGTAATAGCAGTCTTGTTAACTTTAAAGTGTGTCCACGAAGTTCCACATATTTATGGCTCAGTTATTGTCTGTATACCATTATTCATTGCCTAAATTATGGTGAAGTTTTAGACCACTTGATTAGTCACTATAAGTCATGCATCATGAGTTGTGCAAACGAAGATCCAAATTATGTTTTCATTCGTCTTCTAGCCCTAATGAGTATCTTATTAGCAAGTCATGTGAATCAGTTAGACAATTCAACTTATCCTACTATCATAAAGTTACTGTTCATCGATAACCCTTTCAAGTTGGATCGTAAGTTACTTCCAGCGTACTTTCTTGAATCAATTCAACAAATTAATTTAGGGCTTCTTCCTCCCGGGATTCGTCACGATATATGTGTGCAACTTGTTGAAATATATGGTGCTTCTCTGGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD073822             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCCAGCGTACTTTCTTGAATCAATTCAACAAATTAATTTAGGGCTTCTTCCTCCCGGGATTCGTCACGATATATGTGTGCAACTTGTTGAAATATATGGTGCTTCTCTGGTTCCTTCTTTGTGTCGGACTTTATGTGCTCTAGGTGACCACTTTTTAGCTCAAAGTCTGTGTGCAATCGGATGTTTAGATAGACCCGATAATGAAGACTTCTGGCTTTTGTATGCTTCTACAACATTTAAAACCCTCTCACATATACGATCATCTGAACAGTTATCAACTCTTCTAGAAATTCTAATAAATGCAACTTCTGTGGTGACCTCAAGTTCTCGACTTTGGAAATATTATGCACTTGCTGTTCGCATTGCCAAGGTATCAGTAGAGCAAATAACGAGCCGTGCGAAGTCTGTTGGAATGTATGATCTCATTTCTAGTAGTCTGAACGATGACAACCCTACAAAATTTTTATCGGAACTTGGACTCCTCTGTGATGAAAGATCTATGGACAGAAAAAGTTAGGATTGAACCATTAAAGAGAGTTACATACACAAATTTTAATGCTGGGAACATTTTGGTTTGTTAAGTGCTATATGTAGAGTCCAATAGACCGGTATGAAGATCGCTTTCGGTCATGAACTGTACAGTAATTTATATATGTAAATAAAATTCCATTTGTAA]


>consensus_5567#0 AGGAACCATCCTAAAACATACTCTCAAATCATTACCTAAGGAGAACAAGCTAATTTATTT CTTATGGTGGTTACGATTATATCACCAACTAAATGGCACTTTACCCCAAGAGAACCTATT TTCTACTGCCAATTCACCATGCTTCTCCAAAACAGTCCTTCTGTCTAACCTGGAAATTAT TGAAATGGCAGCCACTGAAACTGGTATTTCTAAAAATTTATCTCAGTTACTGGAATCATT TGAAAATATTAAGACTGATATTAGCTTCACTTGCTTCCTGTATATCACTCATTTATACAT CCAAACTCTTAATGCAGATTCCAAATTTAAAACTGCAGCAGATATAGCACTGACAGTAGC ATTACATTCCCCTGAGTTTGTAGATGATTTATTTTTCCCATCTGCAGTATATTCTCTATT TTCCTTAGATTCATCTCTTGACTGGACAAGCTTGATAAGTAATGTACCTGACAATTTACG AGTTAACCTTAATTTGGCCCATCGGATTGAATTTGGATTCTTGATAACATGTTTAAATCG GCGTAGAAAAACTTTAAATTCTACGGAATTCCATCTTATCGAGTGTTTAGGCAACTTAAT CTTCCTTCCAAAAGATGATTGCGAAAGCGTTATTTCAGCGTATGAAAATTTGTTGAATAT AAAGTCCAGTAATAGCAGTCTTGTTAACTTTAAAGTGTGTCCACGAAGTTCCACATATTT ATGGCTCAGTTATTGTCTGTATACCATTATTCATTGCCTAAATTATGGTGAAGTTTTAGA CCACTTGATTAGTCACTATAAGTCATGCATCATGAGTTGTGCAAACGAAGATCCAAATTA TGTTTTCATTCGTCTTCTAGCCCTAATGAGTATCTTATTAGCAAGTCATGTGAATCAGTT AGACAATTCAACTTATCCTACTATCATAAAGTTACTGTTCATCGATAACCCTTTCAAGTT GGATCGTAAGTTACTTCCAGCGTACTTTCTTGAATCAATTCAACAAATTAATTTAGGGCT TCTTCCTCCCGGGATTCGTCACGATATATGTGTGCAACTTGTTGAAATATATGGTGCTTC TCTGGTTCCTTCTTTGTGTCGGACTTTATGTGCTCTAGGTGACCACTTTTTAGCTCAAAG TCTGTGTGCAATCGGATGTTTAGATAGACCCGATAATGAAGACTTCTGGCTTTTGTATGC TTCTACAACATTTAAAACCCTCTCACATATACGATCATCTGAACAGTTATCAACTCTTCT AGAAATTCTAATAAATGCAACTTCTGTGGTGACCTCAAGTTCTCGACTTTGGAAATATTA TGCACTTGCTGTTCGCATTGCCAAGGTATCAGTAGAGCAAATAACGAGCCGTGCGAAGTC TGTTGGAATGTATGATCTCATTTCTAGTAGTCTGAACGATGACAACCCTACAAAATTTTT ATCGGAACTTGGACTCCTCTGTGATGAAAGATCTATGGACAGAAAAAGTTAGGATTGAAC CATTAAAGAGAGTTACATACACAAATTTTAATGCTGGGAACATTTTGGTTTGTTAAGTGC TATATGTAGAGTCCAATAGACCGGTATGAAGATCGCTTTCGGTCATGAACTGTACAGTAA TTTATATATGTAAATAAAATTCCATTTGTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)