cluster # 5572

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Schistosoma mansoni
cluster # 5572 cluster # 5572 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5572#0 length = 661 sequences # 3

consensusID : consensus_5572#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 661
fasta sequence

                              [ACAGCCAGAATTTTGCACGAGGGGACTATTAGTTGAATATAGATAATCTTCAAAGGGATAAAATTATCCTTTTCCCCTTTTTTTGGAATGAATACCAAAATTTCAAACTTACTGGTTATTTGATATTTGACCTCTACTCTTTCGCGAAACGTCGACTGAAGCAAATTTCGAGTATTTAGAACTGTCTAGTTATTCTTAATACGCTGTTCTGTGGACCACGGTGGGATCAAATAGAGTAATTGGTATCCCAGCTCAACTTATGGAGCAACTGTTAACAATCTAGCCAACGTGTCCACTACAAAACGGAAAAATTGAATAGTGTTTTTTGCTTTGAGTTTGCGATTTTACTGCATTAAAAGGCTACTGAAATATGGGAACACTTCAAATTTATGCAAGTAATAAATTAACGGTAATTGAAATATGGACTGACCGCCCCTTGTGTAATTCCGTCGATCTAGACGCTACATGAAATACAGGCTGAATGCAGTCGCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGGTATAAATGATGTTAAATTCTTACCTTTATCATGTGTATTGAATAATGTCAGCAGTAACACTGAACTGGGTAAATTACTTTTAAAATGCCTGTCATTTTCATTGG-CTTGTAAAAATAAATGCTTCT]

[+] EMBL CD079566             [ACAGCCAGAATTTTGCACGAGGGGACTATTAGTTGAATATAGATAATCTTCAAAGGGATAAAATTATCCTTTTCCCCTTTTTTTGGAATGAATACCAAAATTTCAAACTTACTGGTTATTTGATATTTGACCTCTACTCTTTCGCGAAACGTCGACTGAAGCAAATTTCGAGTATTTAGAACTGTCTAGTTATTCTTAATACGCTGTTCTGTGGACCACGGTGGGATCAAATAGAGTAATTGGTATCCCAGCTCAACTTATGGAGCAACTGTTAACAATCTAGCCAACGTGTCCACTACAAAACGGAAAAATTGAATAGTGTTTTTTGCTTTGAGTTTGCGATTTTACTGCATTAAAAGGCTACTGAAATATGGGAACACTTCAAATTTATGCAAGTAATAAATTAACGGTAATTGAAATATGGACTGACCGCCCCTTGTGTAATTCCGTCGATCTAGACGCTACATGAAATACAGGCTGAATGCAGTCGCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGGTATAAATGATGTTAAATTCTTACCTTTATCATGTGTATTGAATAATGTCAGCAGTAACACTGAACTGGGTAAATTACTTTTAAAATGCCTGTCATTTTCATTGG CTTGTAAAAATAAAT      ]
[-] EMBL CD073832             [                       GATTATTAGTTGAATATAGATAATCTTCAAAGGGATAAAATTATCCTTTTCCCCTTTTTTTGGAATGAATACCAAAATTTCAAACTTACTGGTTATTTGATATTTGACCTCTACTCTTTCGCGAAACGTCGACTGAAGCAAATTTCGAGTATTTAGAACTGTCTAGTTATTCTTAATACGCTGTTCTGTGGACCACGGTGGGATCAAATAGAGTAATTGGTATCCCAGCTCAACTTATGGAGCAACTGTTAACAATCTAGCCAACGTGTCCACTACAAAACGGAAAAATTGAATAGTGTTTTTTGCTTTGAGTTTGCGATTTTACTGCATTAAAAGGCTACTGAAATATGGGAACACTTCAAATTTATGCAAGTAATAAATTAACGGTAATTGAAATATGGACTGACCGCCCCTTGTGTAATTCCGTCGATCTAGACGCTACATGAAATACAGGCTGAATGCAGTCGCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGGTATAAATGATGTTAAATTCTTACCTTTATCATGTGTATTGAATAATGTCAGCAGTAACACTGAACTGGGTAAATTACTTTTAAAATGCCTGTCATTTTCATTGGACTTGTAAAAATAAATG     ]
[-] EMBL CD074984             [                                                                                                                                                                                                                                         GAGTAATTGGTATCCCAGCTCAACTTATGGAGCAACTGTTAACAATTTAGCCAACGTGTCCCCTCCAAAACGGAAAAATTGAATAGTGTTTTTTGCTTGGAGTTTGCGATTTTCCTCCATTAAAAGGCTACTGAAATATGGGACCCCTTCAAATTTATGCAAGTAATAAATTACCGGTAATTGAAATATGGACTGCCCCCCCCTTGTGTAATTCCGTCGATTTAGACGCTCCATGAAATACAGGCTGAATGCAGTCGCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGGGTATAAATGATGTTAAATTTTTCCCTTTATCATGTGTATTGAATAATGTCACCAGTACCACTGAACTGGGTAAATTCCTTTTAAAATGGGGGTCATTTTCATTGG CTTGTAAAAATATTTCCTTCT]




>consensus_5572#0
ACAGCCAGAATTTTGCACGAGGGGACTATTAGTTGAATATAGATAATCTTCAAAGGGATA
AAATTATCCTTTTCCCCTTTTTTTGGAATGAATACCAAAATTTCAAACTTACTGGTTATT
TGATATTTGACCTCTACTCTTTCGCGAAACGTCGACTGAAGCAAATTTCGAGTATTTAGA
ACTGTCTAGTTATTCTTAATACGCTGTTCTGTGGACCACGGTGGGATCAAATAGAGTAAT
TGGTATCCCAGCTCAACTTATGGAGCAACTGTTAACAATCTAGCCAACGTGTCCACTACA
AAACGGAAAAATTGAATAGTGTTTTTTGCTTTGAGTTTGCGATTTTACTGCATTAAAAGG
CTACTGAAATATGGGAACACTTCAAATTTATGCAAGTAATAAATTAACGGTAATTGAAAT
ATGGACTGACCGCCCCTTGTGTAATTCCGTCGATCTAGACGCTACATGAAATACAGGCTG
AATGCAGTCGCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGGTATA
AATGATGTTAAATTCTTACCTTTATCATGTGTATTGAATAATGTCAGCAGTAACACTGAA
CTGGGTAAATTACTTTTAAAATGCCTGTCATTTTCATTGGCTTGTAAAAATAAATGCTTC
T

clustalw multiple alignements is not computed in this case