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Schistosoma mansoni
cluster # 5574 cluster # 5574       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5574#0 length = 470 sequences # 3  

consensusID : consensus_5574#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 470
fasta sequence
                              [ATTGGAGAAGGTAGTTCCAGGAATAGTATTATTATCACCATCATTATTAATACATGGTTCTAATATACGTGCTAATTCTGTTTGTACAGCATTTGTTGTACGAATTAATGATTCTGTCAATGTAGAACTTAATTGTGTTGGACATAGATTTGATAATAATTTAGCTGTAGTACTATTAATTTCAGCTAATTTATTTGCTAATGCTAAACGTTCTGCTTCAATTTTAGATGTATGTAATGCAATAGTTTTAGCTTCATTATATAAATCCAACAATGCCTTTTCATCAATTCCAGTAAATGAAGATGAATGATGAAGAGTTTGGGATTCTGAATATTCAGCTATGGAAGACGAGATAGTATTTGATGATAATGTTGAGATATGTGATGCTATTGAATCATTATTGATTGTTACCTGAGTTTGATCAAATGTGTGAATTGTGATGAATATGGAAAAGAGTTGACCATGTTGAT]

[+] EMBL CD148519             [ATTGGAGAAGGTAGTTCCAGGAATAGTATTATTATCACCATCATTATTAATACATGGTTCTAATATACGTGCTAATTCTGTTTGTACAGCATTTGTTGTACGAATTAATGATTCTGTCAATGTAGAACTTAATTGTGTTGGACATAGATTTGATAATAATTTAGCTGTAGTACTATTAATTTCAGCTAATTTATTTGCTAATGCTAAACGTTCTGCTTCAATTTTAGATGTATGTAATGCAATAGTTTTAGCTTCATTATATAAATCCAACAATGCCTTTTCATCAATTCCAGTAAATGAAGATGAATGATGAAGAGTTTGGGATTCTGAATATTCAGCTATGGAAGACGAGATAGTATTTGATGATAATGTTGAGATATGTGATGCTATTGAATCATTATTGATTGTTACCTGAGTTTGATCAAATGTGTGAATTGTGATGAATATGGAAAAGAGTTGACCATGTTGAT]
[-] EMBL CD098315             [ TTGGAGAAGGTAGTTCCAGGAATAGTGTTATTATCACCATCATTATTAATACATGGTTCTAATATACGTGCTAATTCTGTTTGTACAGCATTTGTTGTACGAATTAATGATTCTGTCAATGTAGAACTTAATTGTGTTGGACATAGATTTGATAATAATTTAGCTGTAGTACTATTAATTTCAGCTAATTTATTTGCTAATGCTAAACGTTCTGCTTCAATTTTAGATGTATGTAATGCAATAGTTTTAGCTTCATTATATAAATCCAACAATGCCTTTTCATCAATTCCAGTAAATGAAGATGAATGATGAAGAGTTTGGGATTCTGAATATTCAGCTATGGAAGACGAGATAGTATTTGATGATAATGTTGAGATATGTGATGTTATTGAATCATTATTGA                                                                  ]
[+] EMBL CD119637             [                                                                                                                                                                                                                                       ATGTAATGCAATAGTTTTAGCTTCATTATATAAATCCAACAATGCCTTTTCATCAATTCCAGTAAATGAAGATGAATGATGAAGAGTTTGGGATTCTGAATATTCAGCTATGGAAGACGAGATAGTATT                                                                                                              ]


>consensus_5574#0 ATTGGAGAAGGTAGTTCCAGGAATAGTATTATTATCACCATCATTATTAATACATGGTTC TAATATACGTGCTAATTCTGTTTGTACAGCATTTGTTGTACGAATTAATGATTCTGTCAA TGTAGAACTTAATTGTGTTGGACATAGATTTGATAATAATTTAGCTGTAGTACTATTAAT TTCAGCTAATTTATTTGCTAATGCTAAACGTTCTGCTTCAATTTTAGATGTATGTAATGC AATAGTTTTAGCTTCATTATATAAATCCAACAATGCCTTTTCATCAATTCCAGTAAATGA AGATGAATGATGAAGAGTTTGGGATTCTGAATATTCAGCTATGGAAGACGAGATAGTATT TGATGATAATGTTGAGATATGTGATGCTATTGAATCATTATTGATTGTTACCTGAGTTTG ATCAAATGTGTGAATTGTGATGAATATGGAAAAGAGTTGACCATGTTGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)