cluster # 5587

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5587 cluster # 5587 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5587#0 length = 1185 sequences # 3
consensusID : consensus_5587#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1185
fasta sequence
                              [CCAGAATTTGCNACGAGGANACAATACAAATTCAGTTTATATGGCTATTTTGTGGTTATGTAGATGGTTGAATTTTGTCAGAGAATTTATTCATCATTTATTTTGTTCACCGGATCCATCTTCACTTACGAATAATACATTGAATTCAGCTGATACAAGCCTTGTGACCATTGCAAATGAAGCGTATACACGATGTTTACGACCTTTTCATTCATGGTCTGTACGAGGTATGGCTATGGTTATTATCCAATCACTTCCTTCACGTTTATACTTATTTGATTTATTATTAATGGATAATCCAGAAACAATAACATCTTCAATAACTTCAACAACTGGATTACCTCCTGGATCTTTCAATGAAACTAAATTATTATTAGCACGTTATCCAGAAGCATATATTCAATTAAAATCAGATGCTACACGTTATTCTGAAGCATTAGGTCGTTTTTTAACATTAATTGAAGGTCTTTTAGCTAGTTTAGATTTAAATCGTATATTCACCGGGTCGGAAAGTTATTAAGAGAGAGAGAGGGGGCAGTTTCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAACACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAATAACGATAATAAACATAATTATTTTTCTAATGTATAGTCTATTTTTTTTGTTCATATATGTTGTCTTTCTCTGTATGTGTTTGTTTTCCTTTTCTTTTATTTATGTGCTTTTTTACTCGATGAATTATTTATTGGTTACTTTCTCATAAGAATATTTAAACTACAGATGAGAAAAGTAAGTAGATGGAATCAATGATTTCATGTTTTCCTTGTTTGTGTTCGTATATGTATAACTGACAGAAAGAGAGAGAGAGGGGGAAAGAGGGGGGGTGT-TTTTTTTTACCCCGCTTTCCATTTTGTGTGTTTTATTTGCCCACGATCTATACCTACACACACACACACACATACATACACAAATACATACATACATAATTATTGTTATTTTCATGATATGATTTCTGGTATTTAATATATTCAATGCAAAATTTGTTACGTAAGAGTTTATTCTATCTGTTATGTCAATGAAATTTTATGTAATTTTTATTTACACTATATTAATATATACAGATTTTATGTCCACGCAAAAAAAAAGTTA]

[+] EMBL CD079605             [CCAGAATTTGCNACGAGGANACAATACAAATTCAGTTTATATGGCTATTTTGTGGTTATGTAGATGGTTGAATTTTGTCAGAGAATTTATTCATCATTTATTTTGTTCACCGGATCCATCTTCACTTACGAATAATACATTGAATTCAGCTGATACAAGCCTTGTGACCATTGCAAATGAAGCGTATACACGATGTTTACGACCTTTTCATTCATGGTCTGTACGAGGTATGGCTATGGTTATTATCCAATCACTTCCTTCACGTTTATACTTATTTGATTTATTATTAATGGATAATCCAGAAACAATAACATCTTCAATAACTTCAACAACTGGATTACCTCCTGGATCTTTCAATGAAACTAAATTATTATTAGCACGTTATCCAGAAGCATATATTCAATTAAAATCAGATGCTACACGTTATTCTGAAGCATTAGGTCGTTTTTTAACATTAATTGAAGGTCTTTTAGCTAGTTTAGATTTAAATCGTATATTCACCGGGTCGGAAAGTTATTAAGAGAGAGAGAGGGGGCAGTTTCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAACACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAAT ACGAT ATAAACATAATTATTTNTCTAATGTATAGNCTATTn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL AW017314             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTAGATTTAAATCGTATATTCACCGGGTCGGAAAGTTATTAAGAGAGAGAGAGGGGGCAGTTTCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAACACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAATAACGATAATAAACATAATTATTTTTCTAATGTATAGTCTATTTTTTTTGTTCATATATGTTGTCTTTCTCTGTATGTGTTTGTTTTCCTTTTCTTTTATTTATGTGCTTTTTTACTCGATGAATTATTTATTGGTTACTTTCTCATAAGAATATTTAAACTACAGATGAGAAAAGTAAGTAGATGGAATCAATGATTTCATGTTTTCCTTGTTTGTGTTCGTATATGTATAACTGACAGAAAGAGAGAGAGAGGGGGAAAGAGGGGGGGTGT TTTTTTTTACCCCGCTTTCCATTTTGTGTGTTTTATTTGCCCACGATCTATACCTACACACACACACACACATACATACACAAATACATACATACATAATTATTGTTATTTTCATGATATGATTTCTGGTATTTAATATATTCAATGCAAAATTTGTTACGTAAGAGTTTATTCTATCTGTTATGTCAATGAAATTTTATGTAATTTTTATTTACACTATATTAATATATACAGATTTTA                      ]
[-] EMBL CD073867             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGAGAGAGGGGGCAGTTTCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAACACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAATAACGATAATAAACATAATTATTTTTCTAATGTATAGTCTATTTTTTTTGTTCATATATGTTGTCTTTCTCTGTATGTGTTTGTTTTCCTTTTCTTTTATTTTTGTGCTTTTTTACTCGATGAATTATTTATTGGTTACTTTCTCATAAGAATATTTAAACTACAGATGAGAAAAGTAAGTAGATGGAATCAATGATTTCATGTTTTCCTTGTTTGTGTTCGTATATGTATAACTGACAGAAAGAGAGAGAGAGGGGGAAAGAGGGGGGGGGTGTTTTTTTTACCCCGCTTTCCATTTTGTGTGTTTTATTTGCCCACGATCTATACCT  ACACACACACACACATACATACACAAATACATACATACATAATTATTGTTATTTTCATGATATGATTTCTGGTATTTAATATATTCAATGCAAAATTTGTTACGTAAGAGTTTATGCTATCTGTTATGTCAATGAAATTTTATGTAATTTTGATTTACACTATATTAAAAAATACAGATTTTATGTCCACGCAAAAAAAAAGTTA]




>consensus_5587#0
CCAGAATTTGCNACGAGGANACAATACAAATTCAGTTTATATGGCTATTTTGTGGTTATG
TAGATGGTTGAATTTTGTCAGAGAATTTATTCATCATTTATTTTGTTCACCGGATCCATC
TTCACTTACGAATAATACATTGAATTCAGCTGATACAAGCCTTGTGACCATTGCAAATGA
AGCGTATACACGATGTTTACGACCTTTTCATTCATGGTCTGTACGAGGTATGGCTATGGT
TATTATCCAATCACTTCCTTCACGTTTATACTTATTTGATTTATTATTAATGGATAATCC
AGAAACAATAACATCTTCAATAACTTCAACAACTGGATTACCTCCTGGATCTTTCAATGA
AACTAAATTATTATTAGCACGTTATCCAGAAGCATATATTCAATTAAAATCAGATGCTAC
ACGTTATTCTGAAGCATTAGGTCGTTTTTTAACATTAATTGAAGGTCTTTTAGCTAGTTT
AGATTTAAATCGTATATTCACCGGGTCGGAAAGTTATTAAGAGAGAGAGAGGGGGCAGTT
TCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAA
CACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAATAACGATAAT
AAACATAATTATTTTTCTAATGTATAGTCTATTTTTTTTGTTCATATATGTTGTCTTTCT
CTGTATGTGTTTGTTTTCCTTTTCTTTTATTTATGTGCTTTTTTACTCGATGAATTATTT
ATTGGTTACTTTCTCATAAGAATATTTAAACTACAGATGAGAAAAGTAAGTAGATGGAAT
CAATGATTTCATGTTTTCCTTGTTTGTGTTCGTATATGTATAACTGACAGAAAGAGAGAG
AGAGGGGGAAAGAGGGGGGGTGTTTTTTTTTACCCCGCTTTCCATTTTGTGTGTTTTATT
TGCCCACGATCTATACCTACACACACACACACACATACATACACAAATACATACATACAT
AATTATTGTTATTTTCATGATATGATTTCTGGTATTTAATATATTCAATGCAAAATTTGT
TACGTAAGAGTTTATTCTATCTGTTATGTCAATGAAATTTTATGTAATTTTTATTTACAC
TATATTAATATATACAGATTTTATGTCCACGCAAAAAAAAAGTTA
clustalw multiple alignements is not computed in this case