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Schistosoma mansoni
cluster # 5587 cluster # 5587       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5587#0 length = 1185 sequences # 3  

consensusID : consensus_5587#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1185
fasta sequence
                              [CCAGAATTTGCNACGAGGANACAATACAAATTCAGTTTATATGGCTATTTTGTGGTTATGTAGATGGTTGAATTTTGTCAGAGAATTTATTCATCATTTATTTTGTTCACCGGATCCATCTTCACTTACGAATAATACATTGAATTCAGCTGATACAAGCCTTGTGACCATTGCAAATGAAGCGTATACACGATGTTTACGACCTTTTCATTCATGGTCTGTACGAGGTATGGCTATGGTTATTATCCAATCACTTCCTTCACGTTTATACTTATTTGATTTATTATTAATGGATAATCCAGAAACAATAACATCTTCAATAACTTCAACAACTGGATTACCTCCTGGATCTTTCAATGAAACTAAATTATTATTAGCACGTTATCCAGAAGCATATATTCAATTAAAATCAGATGCTACACGTTATTCTGAAGCATTAGGTCGTTTTTTAACATTAATTGAAGGTCTTTTAGCTAGTTTAGATTTAAATCGTATATTCACCGGGTCGGAAAGTTATTAAGAGAGAGAGAGGGGGCAGTTTCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAACACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAATAACGATAATAAACATAATTATTTTTCTAATGTATAGTCTATTTTTTTTGTTCATATATGTTGTCTTTCTCTGTATGTGTTTGTTTTCCTTTTCTTTTATTTATGTGCTTTTTTACTCGATGAATTATTTATTGGTTACTTTCTCATAAGAATATTTAAACTACAGATGAGAAAAGTAAGTAGATGGAATCAATGATTTCATGTTTTCCTTGTTTGTGTTCGTATATGTATAACTGACAGAAAGAGAGAGAGAGGGGGAAAGAGGGGGGGTGT-TTTTTTTTACCCCGCTTTCCATTTTGTGTGTTTTATTTGCCCACGATCTATACCTACACACACACACACACATACATACACAAATACATACATACATAATTATTGTTATTTTCATGATATGATTTCTGGTATTTAATATATTCAATGCAAAATTTGTTACGTAAGAGTTTATTCTATCTGTTATGTCAATGAAATTTTATGTAATTTTTATTTACACTATATTAATATATACAGATTTTATGTCCACGCAAAAAAAAAGTTA]

[+] EMBL CD079605             [CCAGAATTTGCNACGAGGANACAATACAAATTCAGTTTATATGGCTATTTTGTGGTTATGTAGATGGTTGAATTTTGTCAGAGAATTTATTCATCATTTATTTTGTTCACCGGATCCATCTTCACTTACGAATAATACATTGAATTCAGCTGATACAAGCCTTGTGACCATTGCAAATGAAGCGTATACACGATGTTTACGACCTTTTCATTCATGGTCTGTACGAGGTATGGCTATGGTTATTATCCAATCACTTCCTTCACGTTTATACTTATTTGATTTATTATTAATGGATAATCCAGAAACAATAACATCTTCAATAACTTCAACAACTGGATTACCTCCTGGATCTTTCAATGAAACTAAATTATTATTAGCACGTTATCCAGAAGCATATATTCAATTAAAATCAGATGCTACACGTTATTCTGAAGCATTAGGTCGTTTTTTAACATTAATTGAAGGTCTTTTAGCTAGTTTAGATTTAAATCGTATATTCACCGGGTCGGAAAGTTATTAAGAGAGAGAGAGGGGGCAGTTTCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAACACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAAT ACGAT ATAAACATAATTATTTNTCTAATGTATAGNCTATTn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL AW017314             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTAGATTTAAATCGTATATTCACCGGGTCGGAAAGTTATTAAGAGAGAGAGAGGGGGCAGTTTCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAACACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAATAACGATAATAAACATAATTATTTTTCTAATGTATAGTCTATTTTTTTTGTTCATATATGTTGTCTTTCTCTGTATGTGTTTGTTTTCCTTTTCTTTTATTTATGTGCTTTTTTACTCGATGAATTATTTATTGGTTACTTTCTCATAAGAATATTTAAACTACAGATGAGAAAAGTAAGTAGATGGAATCAATGATTTCATGTTTTCCTTGTTTGTGTTCGTATATGTATAACTGACAGAAAGAGAGAGAGAGGGGGAAAGAGGGGGGGTGT TTTTTTTTACCCCGCTTTCCATTTTGTGTGTTTTATTTGCCCACGATCTATACCTACACACACACACACACATACATACACAAATACATACATACATAATTATTGTTATTTTCATGATATGATTTCTGGTATTTAATATATTCAATGCAAAATTTGTTACGTAAGAGTTTATTCTATCTGTTATGTCAATGAAATTTTATGTAATTTTTATTTACACTATATTAATATATACAGATTTTA                      ]
[-] EMBL CD073867             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGAGAGAGGGGGCAGTTTCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAACACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAATAACGATAATAAACATAATTATTTTTCTAATGTATAGTCTATTTTTTTTGTTCATATATGTTGTCTTTCTCTGTATGTGTTTGTTTTCCTTTTCTTTTATTTTTGTGCTTTTTTACTCGATGAATTATTTATTGGTTACTTTCTCATAAGAATATTTAAACTACAGATGAGAAAAGTAAGTAGATGGAATCAATGATTTCATGTTTTCCTTGTTTGTGTTCGTATATGTATAACTGACAGAAAGAGAGAGAGAGGGGGAAAGAGGGGGGGGGTGTTTTTTTTACCCCGCTTTCCATTTTGTGTGTTTTATTTGCCCACGATCTATACCT  ACACACACACACACATACATACACAAATACATACATACATAATTATTGTTATTTTCATGATATGATTTCTGGTATTTAATATATTCAATGCAAAATTTGTTACGTAAGAGTTTATGCTATCTGTTATGTCAATGAAATTTTATGTAATTTTGATTTACACTATATTAAAAAATACAGATTTTATGTCCACGCAAAAAAAAAGTTA]


>consensus_5587#0 CCAGAATTTGCNACGAGGANACAATACAAATTCAGTTTATATGGCTATTTTGTGGTTATG TAGATGGTTGAATTTTGTCAGAGAATTTATTCATCATTTATTTTGTTCACCGGATCCATC TTCACTTACGAATAATACATTGAATTCAGCTGATACAAGCCTTGTGACCATTGCAAATGA AGCGTATACACGATGTTTACGACCTTTTCATTCATGGTCTGTACGAGGTATGGCTATGGT TATTATCCAATCACTTCCTTCACGTTTATACTTATTTGATTTATTATTAATGGATAATCC AGAAACAATAACATCTTCAATAACTTCAACAACTGGATTACCTCCTGGATCTTTCAATGA AACTAAATTATTATTAGCACGTTATCCAGAAGCATATATTCAATTAAAATCAGATGCTAC ACGTTATTCTGAAGCATTAGGTCGTTTTTTAACATTAATTGAAGGTCTTTTAGCTAGTTT AGATTTAAATCGTATATTCACCGGGTCGGAAAGTTATTAAGAGAGAGAGAGGGGGCAGTT TCGTAACTTTGTCTCCTTTAATCTTCATCATATCAGTGGGATTTCACTGGTTACCTTGAA CACATTCCTCATTTTTTTCTTTTTTCTATGGCTGTTATGGTTGTTTCTAATAACGATAAT AAACATAATTATTTTTCTAATGTATAGTCTATTTTTTTTGTTCATATATGTTGTCTTTCT CTGTATGTGTTTGTTTTCCTTTTCTTTTATTTATGTGCTTTTTTACTCGATGAATTATTT ATTGGTTACTTTCTCATAAGAATATTTAAACTACAGATGAGAAAAGTAAGTAGATGGAAT CAATGATTTCATGTTTTCCTTGTTTGTGTTCGTATATGTATAACTGACAGAAAGAGAGAG AGAGGGGGAAAGAGGGGGGGTGTTTTTTTTTACCCCGCTTTCCATTTTGTGTGTTTTATT TGCCCACGATCTATACCTACACACACACACACACATACATACACAAATACATACATACAT AATTATTGTTATTTTCATGATATGATTTCTGGTATTTAATATATTCAATGCAAAATTTGT TACGTAAGAGTTTATTCTATCTGTTATGTCAATGAAATTTTATGTAATTTTTATTTACAC TATATTAATATATACAGATTTTATGTCCACGCAAAAAAAAAGTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)