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Schistosoma mansoni
cluster # 5605 cluster # 5605       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5605#0 length = 496 sequences # 3  

consensusID : consensus_5605#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 496
fasta sequence
                              [GTAGGTGTGATATCAATTTATTCCAAAAGAAATTTATAGGCTATCAAACGAGGATATAATTTCAGTTCATAGAGTAATTGACTATTTAAATAAATCATCCTGGTGGCAGGGGTTTAATTTAAGGTAGAAAATCTGTCCGATAATTGTAATCTATGGTTAGAGAAATTTGATGACATGGCTCAAGATCGGTTTCCAACCATGCGTAGTTGTATTTTTACTTAATCCCCTCTGTATCTTGAGTTTAGCGTCATTCTGTTCTTCAATCTCAGTAAACCTCTATTTAGTCAAACTCCTTAGTGTGTTTAGCATTTCTGTTTATTGTTTCTCATTTTTTTGATTTTCATCTAGCTAAATTTCCTTTCTTATCATGTTGACGACAAAAGTAAATTATACGACCAAAATAAATTCGATTTGAGGTAATGCCCTTTGAACTTTTCGCGTTAAAATCAAAAGGCAATGACATATAGCTTGTAACTTGTTGAAAGCTGTCTAAGAG]

[+] EMBL CD127886             [GTAGGTGTGATATCAATTTATTCCAAAAGAAATTTATAGGCTATCAAACGAGGATATAATTTCAGTTCATAGAGTAATTGACTATTTAAATAAATCATCCTGGTGGCAGGGGTTTAATTTAAGGTAGAAAATCTGTCCGATAATTGTAATCTATGGTTAGAGAAATTTGATGACATGGCTCAAGATCGGTTTCCAACCATGCGTAGTTGTATTTTTACTTAATCCCCTCTGTATCTTGAGTTTAGCGTCATTCTGTTCTTCAATCTCAGTAAACCTCTATTTAGTCAAACTCCTTAGTGTGTTTAGCATTTCTGTTTATTGTTTCTCATTTTTTTGATTTTCATCTAGCTAAATTTCCTTTCTTATCATGTTGACGACAAAAGTAAATTATACGACCAAAATAAATTCGATTTGAGGTAATGCCCTTTGAACTTTTCGCGTTAAAATCAAAAGGCAATGACATATAGCTTGTAACTTGTTGAAAGCTGTCTAAGA ]
[-] EMBL CD128098             [                 TTAAACCAAAAGAAATTTATAGGCTATCAAGGGAGGATATAATTTCAGTTCATAGAGTAATTGACTATTTAAATAAATCATCCTGGTGGCAGGGGTTTAATTTAAGGTAGAAAATCTGTCCGATAATTGTAATCTATGGTTAGAGAAATTTGATGACATGGCTCAAGATCGGTTTCCAACCATGCGTAGTTGTATTTTTACTTAATCCCCTCTGTATCTTGAGTTTAGCGTCATTCTGTTCTTCAATCTCAGTAAACCTCTATTTAGTCAAACTCCTTAGTGTGTTTAGCATTTCTGTTTATTGTTTCTCATTTTTTTGATTTTCATCTAGCTAAATTTCCTTTCTTATCATGTTGACGACAAAAGTAAATTATACGACCAAAATAAATTCGATTTGAGGTAATGCCCTTTGAACTTTTCGCGTTAAAATCAAAAGGCAATGACATATAGCTTGTAACTTGTTGAAAGCTGTCTAAGAG]
[-] EMBL CD063286             [                                                              CAGTTCATAGAGTAATTGACTATTTAAATAAATCATCCTGGTGGCAGGGGTTTAATTTAAGGTAGAAAATCTGTCCGATAATTGTAATCTATGGTCAGAGAAATTTGATGACATGGCTCAAGATCGGTTTCCAACCATGCGTAGTTGTATTTTTACTTAATCCCCTCTGTATCTTGAGTTAAGCGTCATTCTGTTCTTCAATCTCAGTAAACCTCTATTTAGTCAAACTCCTTAGTGTGTTTAGCATTTCTGT                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_5605#0 GTAGGTGTGATATCAATTTATTCCAAAAGAAATTTATAGGCTATCAAACGAGGATATAAT TTCAGTTCATAGAGTAATTGACTATTTAAATAAATCATCCTGGTGGCAGGGGTTTAATTT AAGGTAGAAAATCTGTCCGATAATTGTAATCTATGGTTAGAGAAATTTGATGACATGGCT CAAGATCGGTTTCCAACCATGCGTAGTTGTATTTTTACTTAATCCCCTCTGTATCTTGAG TTTAGCGTCATTCTGTTCTTCAATCTCAGTAAACCTCTATTTAGTCAAACTCCTTAGTGT GTTTAGCATTTCTGTTTATTGTTTCTCATTTTTTTGATTTTCATCTAGCTAAATTTCCTT TCTTATCATGTTGACGACAAAAGTAAATTATACGACCAAAATAAATTCGATTTGAGGTAA TGCCCTTTGAACTTTTCGCGTTAAAATCAAAAGGCAATGACATATAGCTTGTAACTTGTT GAAAGCTGTCTAAGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)