cluster # 5617

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Schistosoma mansoni
cluster # 5617 cluster # 5617 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5617#0 length = 1143 sequences # 3
consensusID : consensus_5617#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1143
fasta sequence
                              [GCCAGCTTTTGTCGAAATGGTTTTCTGAAAGTGCACCGTCTCGTAACAAAAATGTTTGATGGAATTAAAGAATATTTAGAGTCAAATGATCATCTTGTATGTTTATTAATTGATGAAGTTGAAAGTTTAACAGCTGTCCGAACTTCTTCTATGTCAGGCTGTGAACCAAGCGATGCTATTCGTGTTGTTAATTCTGTTTTAACTCAGATTGATCAAATTAAACGTTTCCCCAATGTTTTGATATTAGCCACTTCCAATGTAACAGGTGTTATAGATCCAGCATTTTTGGACAGAGCTGATATACGTCTGTTTATTGGTCCGCCGTCTCCACCAGCTATTTATTCAATCTATCGCACTTGTTTATATGAATTAATTAGGGTTGGATTAATAAATTCTACAGAGGATAGTCGATTATTAAGTTACCAAACGTTGGCATCTGTACAATTTATGGAAAATCAGGCCAATTCACTAAGTATAGAACTATGGCGTTTAGCGGAACATAGTCTTGGTTTAAATGGTCGTACATTGCGCAAATTACCTTTATTAGCGTATGCATTTTATTTGAATAAAGTAATCCCTGATATGCGATATAATTCTACCCTTCATAGTCGTCGAATTCATCTACCAGACTGTAATAAAAGTAATTCCTCTATTCTAAATGAATCTTCATCATTTTATAATGTTAGCACATCAACTATGTGTATGAATGAATCGATTCATTGTTCAACGATATCAACAACAGGAACAGCAGCGGTGGTGCCAGAAGTCGAATTATCATCATTATCATCGCCAATTCTTAATTATGTAAAATCGAATAATGTTTCATTGGTTATGTTTATTAAAGCATTAAAATTAACTGTCGATGCTCAGTTTACCGAGTTGAAATCACTTGATTTAGCATCATCGGGAAAAGGACGTTTAACTGGAGTTCAACGAACAGAATTAAAGTACACTTAACCTTCTTTGCTGTTTCTTTTGTATTTACTACCTCTTTTCTACTCCCGGTTTTTTGTATGTTTATGTACACATTTGTTTCTGAATGCATTTATGTTTTTTCTGCTAGTTTGATTGCTAACATTCTTCTCTACAGNTTATTTTTTATTATTGNTGCTATTTTTATATANATCAAATAAATACATTTGG]

[+] EMBL CD082569             [GCCAGCTTTTGTCGAAATGGTTTTCTGAAAGTGCACCGTCTCGTAACAAAAATGTTTGATGGAATTAAAGAATATTTAGAGTCAAATGATCATCTTGTATGTTTATTAATTGATGAAGTTGAAAGTTTAACAGCTGTCCGAACTTCTTCTATGTCAGGCTGTGAACCAAGCGATGCTATTCGTGTTGTTAATTCTGTTTTAACTCAGATTGATCAAATTAAACGTTTCCCCAATGTTTTGATATTAGCCACTTCCAATGTAACAGGTGTTATAGATCCAGCATTTTTGGACAGAGCTGATATACGTCTGTTTATTGGTCCGCCGTCTCCACCAGCTATTTATTCAATCTATCGCACTTGTTTATATGAATTAATTAGGGTTGGATTAATAAATTCTACAGAGGATAGTCGATTATTAAGTTACCAAACGTTGGCATCTGTACAATTTATGGAAAATCAGGCCAATTCACTAAGTATAGAACTATGGCGTTTAGCGGAACATAGTCTTGGTTTAAATGGTCGTACATTGCGCANATTACCTTTATTAGCGTATGCATTTTATTTGAATAAAGTAATCCCTGATATGCGATATAATTCTACCCTTCATAGTCGTCGAATTCATCTACCAGACTGGTATANAAGTAATTCCTCTATTCTAAATGAATCTTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD078406             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CGGAACATAGTCTTGGTTTAAATGGTCGTACATTGCGCAAATTACCTTTATTAGCGTATGCATTTTATTTGAATAAAGTAATCCCTGATATGCGATATAATTCTACCCTTCATAGTCGTCGAATTCATCTACCAGACTGTAATAAAAGTAATTCCTCTATTCTAAATGAATCTTCATCATTTTATAATGTTAGCACATCAACTATGTGTATGAATGAATCGATTCATTGTTCAACGATATCAACAACAGGAACAGCAGCGGTGGTGCCAGAAGTCGAATTATCATCATTATCATCGCCAATTCTTAATTATGTAAAATCGAATAATGTTTCATTGGTTATGTTTATTAAAGCATTAAAATTAACTGTCGATGCTCAGTTTACCGAGTTGAAATCACTTGATTTAGCATCATCGGGAAAAGGACGTTTAACTGGAGTTCAACGAACAGAATTAAAGTACACTTAACCTTCTTTGCTGTTTCTTTTGTATTTACTACCTCTTTTCTACTCCCGGTTTTTTGTATGTTTATGTACACATTTGTTTCTGAATGCATTTATGTTTTTTCTGCTAGTTTGATTGCTAACATTCTTCTCTACAGNTTATTTTTTATTATTGNTGCTATTTTTATATANATCAAATAAATACATTTGG]
[-] EMBL CD076167             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTGGTTTAAATGGTCGTACATTGCGCAAATACCCTTTATTAGCGTATGCATTTTATTTGAATAAAGTAATCCCTGATATGCGATATAATTCTACCCTTCATAGTCGTCGAATTCATCTACCAGACTGTAATAAAAGTAATTCCTCTATTCTAAATGAATCTTCATCATTTTATAATGTTAGCACATCAACTATGTGTATGAATGAATCGATTCATTGTTCAACGATATCAACAACAGGAACAGCAGCGGTGGTGCCAGAAGTCGAATTATCATCATTATCATCGCCAATTCTTAATTATGTAAAATCGAATAATGTTTCATTGGTTATGTTTATTAAAGCATTAAAATTAACTGTCGATGCTCAGTTTACCGAGTTGAAATCACTTGATTTAGCATCATCGGGAAAAGGACGTTTAACTGGAGTTCAACGAACAGAATTAAAGTACACTTAACCTTCTTTGCTGTTTCTTTTGTATTTACTACCTCTTTTCTACTCCCGGTTTTTTGTATGTTTATGTACACATTTGTTTCTGAATGCATTTATGTTTTTTCTGCTAGTTTGATTGCTAACATTCTTCTCTACAGTTTATTTTTTATTATTGTTGCTATTTTTATATAAATCAAATAAATca      ]




>consensus_5617#0
GCCAGCTTTTGTCGAAATGGTTTTCTGAAAGTGCACCGTCTCGTAACAAAAATGTTTGAT
GGAATTAAAGAATATTTAGAGTCAAATGATCATCTTGTATGTTTATTAATTGATGAAGTT
GAAAGTTTAACAGCTGTCCGAACTTCTTCTATGTCAGGCTGTGAACCAAGCGATGCTATT
CGTGTTGTTAATTCTGTTTTAACTCAGATTGATCAAATTAAACGTTTCCCCAATGTTTTG
ATATTAGCCACTTCCAATGTAACAGGTGTTATAGATCCAGCATTTTTGGACAGAGCTGAT
ATACGTCTGTTTATTGGTCCGCCGTCTCCACCAGCTATTTATTCAATCTATCGCACTTGT
TTATATGAATTAATTAGGGTTGGATTAATAAATTCTACAGAGGATAGTCGATTATTAAGT
TACCAAACGTTGGCATCTGTACAATTTATGGAAAATCAGGCCAATTCACTAAGTATAGAA
CTATGGCGTTTAGCGGAACATAGTCTTGGTTTAAATGGTCGTACATTGCGCAAATTACCT
TTATTAGCGTATGCATTTTATTTGAATAAAGTAATCCCTGATATGCGATATAATTCTACC
CTTCATAGTCGTCGAATTCATCTACCAGACTGTAATAAAAGTAATTCCTCTATTCTAAAT
GAATCTTCATCATTTTATAATGTTAGCACATCAACTATGTGTATGAATGAATCGATTCAT
TGTTCAACGATATCAACAACAGGAACAGCAGCGGTGGTGCCAGAAGTCGAATTATCATCA
TTATCATCGCCAATTCTTAATTATGTAAAATCGAATAATGTTTCATTGGTTATGTTTATT
AAAGCATTAAAATTAACTGTCGATGCTCAGTTTACCGAGTTGAAATCACTTGATTTAGCA
TCATCGGGAAAAGGACGTTTAACTGGAGTTCAACGAACAGAATTAAAGTACACTTAACCT
TCTTTGCTGTTTCTTTTGTATTTACTACCTCTTTTCTACTCCCGGTTTTTTGTATGTTTA
TGTACACATTTGTTTCTGAATGCATTTATGTTTTTTCTGCTAGTTTGATTGCTAACATTC
TTCTCTACAGNTTATTTTTTATTATTGNTGCTATTTTTATATANATCAAATAAATACATT
TGG
clustalw multiple alignements is not computed in this case