cluster # 5645

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Schistosoma mansoni
cluster # 5645 cluster # 5645 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5645#0 length = 866 sequences # 3

consensusID : consensus_5645#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 866
fasta sequence

                              [GTTATGTGTTTAATGACTAAATAAAATAAACAATTTTATTGATTATTTTTAAAATTCATTACAGAATGGATAAGGGGAATTCTGATAAATAACACCGTACTCATTTACTTCGTAATATTGTAAAGAAATAAAGAAGTTTACATGGTAACGATTATCATTTTATTTTGATAAATATGAAATATAAAGTTATGTTGATTACTTTAATGATTATATTATGGTTTCATTTGGTTACTATTATAAATTGTTTACAACGTAAATATGATAAAAATACAGTTGCAAGTATACCAGGTGATATAATGCTTGGTGGATTATTCCCCGTACATACATCTGGTGCAACTACTTGTGAATCAATCAATCCTGAAAGAGGAATTCAGCGAGTTGAAGCAATGTTATTTACTTTAGATGAAATAAATAATAATTCAAAATTATTACCAGGTTTAACTTTGGGTACTACAATACGTGATACATGTTCAGATACAAATCATGCACTTGAACAAGCATTGAAATTTGTACAAGCAAGTACTGGAAGTAGTAGTCAATTGAATAAAATGAATGAACATTCAGAAAATTTAAATACACGTGGAGTTGTCGGTAGTTCATATAGTTCAGTAACAATACTTGTAGCAAATTTATTTCGTCTATTCTCTTTACCACAAATATCTTATGCATCGACAACTGCTATATTAAGTGATAAACGTGCATTTCCATTATTTGCACGAACTGTACCTTCGGATGTTGTTCAAGCTCAGGCAATGGCTACATTAGTCTCGGCTCATAACTGGACTTATGTTTCCACAGTACGTAGTGCAGGTGATTATGGTGATTCCGGTATGGATGCATTTTGGAAAGAAGCTGATAAACTTGGT]

[-] EMBL CD189573             [GTTATGTGTTTAATGACTAAATAAAATAAACAATTTTATTGATTATTTTTAAAATTCATTACAGAATGGATAAGGGGAATTCTGATAAATAACACCGTACTCATTTACTTCGTAATATTGTAAAGAAATAAAGAAGTTTACATGGTAACGATTATCATTTTATTTTGATAAATATGAAATATAAAGTTATGTTGATTACTTTAATGATTATATTATGGTTTCATTTGGTTACTATTATAAATTGTTTACAACGTAAATATGATAAAAATACAGTTGCAAGTATACCAGGTGATATAATGCTTGGTGGATTATTCCCCGTACATACATCTGGTGCAACTACTTGTGAATCAATCAATCCTGAAAGAGGAATTCAGCGAGTTGAAGCAATGTTATTTACTTTAGATGAAATAAATAATAATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD163278             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GAATTCAGCGAGTTGAAGCAATGTTATTTACTTTAGATGAAATAAATAATAATTCAAAATTATTACCAGGTTTAACTTTGGGTACTACAATACGTGATACATGTTCAGATACAAATCATGCACTTGAACAAGCATTGAAATTTGTACAAGCAAGTACTGGAAGTAGTAGTCAATTGAATAAAATGAATGAACATTCAGAAAATTTAAATACACGTGGAGTTGTCGGTAGTTCATATAGTTCAGTAACAATACTTGTAGCAAATTTATTTCGTCTATTCTCTTTACCACAAATATCTTATGCATCGACAACTGCTATATTAAGTGATAAACGTGCATTTCCATTATTTGCACGAACTGTACCTTCGGATGTTGTTCAAGCTCAGGCAATGGCTACATTAGTCTCGGCTCATAACTGGACTTATGTTTCCACAGTACGTAGTGCAGGTGATTATGGTGATTCCGGTATGGATGCATTTTGGAAAGAAGCTGATAAACTTGGT]
[-] EMBL CD154374             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACAAATCATGCACTTGAACAAGCATTGAAATTTGTACAAGCAAGTACTGGAAGTAGTAGTCAATTGAATAAAATGAATGAACATTCAGAAAATTTAAATACACGTGGAGTTGTCGGTAGTTCATATAGTTCAGTAACAATACTTGTAGCAAATTTATTTCGTCTATTCTCTTTACCACAAATATCTTATGCATCGACAACTGCTATATTAAGTGATAAACGTGCATTTCCATTATTTGCACGAACTGTACCTTCGGATGTTGTTCAAGCTCAGGCAATGGCTACATTAGTCTCGGCTCATA                                                                                         ]




>consensus_5645#0
GTTATGTGTTTAATGACTAAATAAAATAAACAATTTTATTGATTATTTTTAAAATTCATT
ACAGAATGGATAAGGGGAATTCTGATAAATAACACCGTACTCATTTACTTCGTAATATTG
TAAAGAAATAAAGAAGTTTACATGGTAACGATTATCATTTTATTTTGATAAATATGAAAT
ATAAAGTTATGTTGATTACTTTAATGATTATATTATGGTTTCATTTGGTTACTATTATAA
ATTGTTTACAACGTAAATATGATAAAAATACAGTTGCAAGTATACCAGGTGATATAATGC
TTGGTGGATTATTCCCCGTACATACATCTGGTGCAACTACTTGTGAATCAATCAATCCTG
AAAGAGGAATTCAGCGAGTTGAAGCAATGTTATTTACTTTAGATGAAATAAATAATAATT
CAAAATTATTACCAGGTTTAACTTTGGGTACTACAATACGTGATACATGTTCAGATACAA
ATCATGCACTTGAACAAGCATTGAAATTTGTACAAGCAAGTACTGGAAGTAGTAGTCAAT
TGAATAAAATGAATGAACATTCAGAAAATTTAAATACACGTGGAGTTGTCGGTAGTTCAT
ATAGTTCAGTAACAATACTTGTAGCAAATTTATTTCGTCTATTCTCTTTACCACAAATAT
CTTATGCATCGACAACTGCTATATTAAGTGATAAACGTGCATTTCCATTATTTGCACGAA
CTGTACCTTCGGATGTTGTTCAAGCTCAGGCAATGGCTACATTAGTCTCGGCTCATAACT
GGACTTATGTTTCCACAGTACGTAGTGCAGGTGATTATGGTGATTCCGGTATGGATGCAT
TTTGGAAAGAAGCTGATAAACTTGGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case