Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5654 cluster # 5654       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5654#0 length = 326 sequences # 3  

consensusID : consensus_5654#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 326
fasta sequence
                              [CAGGACAGGGTTGGATAAAGAATGCTGCTGAGTGGTCTATGCTCCCCGATGAGGGGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTTGAATGTCTTTTAGTGAAAAGTTGTTATTAGTGAAGTTCAATCGTGTTAGAAGTGAATGAGTTACTCATTGATGGTATTCAACAATACTTGAGGTCGATGTGAACGAATGGAGACTGAAACAATTGATCTATTGTTAAGTCATATATGATAAAGATACCAACTATAAATCCTGTTGAAGTCATGATGATGCTCTATGGTTGTCAATGGATTGCCATTTGATATCCATTCCTTGACAAAAA]

[+] EMBL CD088323             [CAGGACAGGGTTGGATAAAGAATGCTGCTGAGTGGTCTATGCTCCCCGATGAGGGGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTTGAATGTCTTTTAGTGAAAAGTTGTTATTAGTGAAGTTCAATCGTGTTAGAAGTGAATGAGTTACTCATTGATGGTATTCAACAATACTTGAGGTCGATGTGAACGAATGGAGACTGAAACAATTGATCTATTGTTAAGTCATATATGATAAAGATACCAACTATAAATCCTGTTGAAGTCATGATGATGCTCTATGGTTGTCAATGGATTGCCATTTGATATCCATTCCTTGACAAAAg]
[+] EMBL CD088392             [CAGGACAGGGTTGGATAAAGAATGCTGCTGAGTGGTCTATGCTCCCCGATGAGGGGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTTGAATGTCTTTTAGTGAAAAGTTGTTATTAGTGAAGTTCAATCGTGTTAGAAGTGAATGAGTTACCCATTGATGGTATTCAACAATACTTGAGGTCGATGTGAACGAATGGAGACTGAAACAATTGATCTATTGTTAAGTCATATATGATAAAGATACCAACTATAAATCCTGTTGAAGTCATGATGATGCTCTATGGTTGTCAATGGATTGCCATTTGATATCCATTCCTTGACAAAAA]
[+] EMBL CD088256             [CAGGACAGGGTTGGACAAAGAATGCTGCTGAGTGGTCTATGCTCCCCGATGAGGGGTAACAGGCGTAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTTGAATGTCTTTTAGTGAAAAGTTGTTATTAGTGAAGTTCAATCGTGTTAGAAGTGAATGAGTTACTCATTGATGGTATTCAACAATACTTGAGGTCGATGTGAACGAATGGAGACTGAAACAATTGATCTATTGTTAAGTCATATATGATAAAGATACCAACTATAAATCCTGTTGAAGTCATGATGATGCTCTATGGTTGTCAATGGATTGCCATTTGATATCCATTCCTTGACAAAAA]


>consensus_5654#0 CAGGACAGGGTTGGATAAAGAATGCTGCTGAGTGGTCTATGCTCCCCGATGAGGGGTAAC AGGCGTAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTTGAATGTCTTTTAGTGAAAAGTTGTTATTAGTGA AGTTCAATCGTGTTAGAAGTGAATGAGTTACTCATTGATGGTATTCAACAATACTTGAGG TCGATGTGAACGAATGGAGACTGAAACAATTGATCTATTGTTAAGTCATATATGATAAAG ATACCAACTATAAATCCTGTTGAAGTCATGATGATGCTCTATGGTTGTCAATGGATTGCC ATTTGATATCCATTCCTTGACAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)