cluster # 5671

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Schistosoma mansoni
cluster # 5671 cluster # 5671 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5671#0 length = 499 sequences # 3

consensusID : consensus_5671#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 499
fasta sequence

                              [TCATCTATTCTTACCAACAAAATTGCCCATGGACTATTTTCCTTCACACCAAATTACACAATTTTTGACAAAAAGCTAATTAACAATGTTTAAATGATTCAATATTCTAAAAATCCGTACAGTAAAAGATTTTGAAGAGTTCCCACCCCCTCCCCCACAAAAAAGTAAACAAACAACTCACTAACAACAGTCACAATTGTAATGTCAACAGTGTGAGTTTTGAGAAGAAAAAAAAGCATGAATACGAAAGGAATGTTAGATATACCTGGTTGGTAAAAGAGACAAATAGTTGAATAATAAACATAATTAAGTGTATATACAGTAATAATTTATGATACATGTTCGTTTGTTTATTCATGTGACCATCATTTAACCATCAAATACAATATGTTTTACTTCTGTAGTTGAATCTTTACATAGTTCCATAACTTTCACTTTTTCTAATCGTTTTGCTTGCCATGATGGATGTAAACCAAGTTTAGATAATTCAGATATAACA]

[+] EMBL AI975813             [TCATCTATTCTTACCAACAAAATTGCCCATGGACTATTTTCCTTCACACCAAATTACACAATTTTTGACAAAAAGCTAATTAACAATGTTTAAATGATTCAATATTCTAAAAATCCGTACAGTAAAAGATTTTGAAGAGTTCCCACCCCCTCCCCCACAAAAAAGTAAACAAACAACTCACTAACAACAGTCACAATTGTAATGTCAACAGTGTGAGTTTTGAGAAGAAAAAAAAGCATGAATACGAAAGGAATGTTAGATATACCTGGTTGGTAAAAGAGACAAATAGTTGAATAATAAACATAATTAAGTGTATATACAGTAATAATTTATGATACATGTTCGTTTGTTTATTCATGTGACCATCATTTAACCATCAAATACAATATGTTTTACTTCTGTAGTTGAATCTTTACATAGTTCCATAACTTTCACTTTTTCTAATCGTTTTGCTTGCCATGATGGATGTAAACCAAGTTTAGATAATTCAGATATAACA]
[+] EMBL AI975578             [TCATCTATTCTTACCAACAAAATTGCCCATGGACTATTTTCCTTCACACCAAATTACACAATTTTTGACAAAAAGCTAATTAACAATGTTTAAATGATTCAATATTCTAAAAATCCCTCCAGTAAAAGATTTTGAAGAGTTCCCACCCCCTCCCCCACAAAAAAGTAAACAAACAACTCACTAACAACAGTCACAATTGTTATGTCTACAGTGTGAGTTTTGAGAAGAAAAAAAAGCATGAATACGAAAGGAATGTTAGATATACCTGGTTGGTGAAAGAGACAAATAGTTGAATAATAAACATAATTAAGTGTGTATACGGTGATAATTTATGATACATGT                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD136470             [                                                                                                                                                                                                                                                               TTAGATATACCTGGTTGGTAAAAGAGACAAATAGTTGAATAATAAACATAATTAAGTGTATATACAGTAATAATTTATGATACATGTTCGTTTGTTTATTCATGTGACCATCATTTAACCATCAAATACAATATGTTTTACTTCTGTAGTTGAATCTTTACATAGTTCCATAACTTTCACTTTTTCTAATCGTTTTGCTTGCCATGATGGATGTAAACCAGGTTTAGATAAT            ]




>consensus_5671#0
TCATCTATTCTTACCAACAAAATTGCCCATGGACTATTTTCCTTCACACCAAATTACACA
ATTTTTGACAAAAAGCTAATTAACAATGTTTAAATGATTCAATATTCTAAAAATCCGTAC
AGTAAAAGATTTTGAAGAGTTCCCACCCCCTCCCCCACAAAAAAGTAAACAAACAACTCA
CTAACAACAGTCACAATTGTAATGTCAACAGTGTGAGTTTTGAGAAGAAAAAAAAGCATG
AATACGAAAGGAATGTTAGATATACCTGGTTGGTAAAAGAGACAAATAGTTGAATAATAA
ACATAATTAAGTGTATATACAGTAATAATTTATGATACATGTTCGTTTGTTTATTCATGT
GACCATCATTTAACCATCAAATACAATATGTTTTACTTCTGTAGTTGAATCTTTACATAG
TTCCATAACTTTCACTTTTTCTAATCGTTTTGCTTGCCATGATGGATGTAAACCAAGTTT
AGATAATTCAGATATAACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case