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Schistosoma mansoni
cluster # 5676 cluster # 5676       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5676#0 length = 775 sequences # 3  

consensusID : consensus_5676#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 775
fasta sequence
                              [TAATTCATGTGTACGTTGTTTACGTAGTTCACCGATTGCATCTTTAGTTGGCTTCATTATTGTATTACTGGGCGGTGGGGCTTTTGGTGGAGCAATCATTTTTGCGAGACGTTATTTAATTACACTTTTAAATGCTCCTAATCTATTCCCTTACTTGGACTATGCTATTTATGGCTTAGTCGGAGCAATAGGATTATTTTCACTGTTAGCCTACTTACTATGTGCCCTGTCTTCTGGTTGGAATGCAAAACATTACTTTGAAAGTAGCCGAAAAGCATGCTGTGGAAGGTGTTGTAATATGACGCTTATCATACTTTTGGTAACGGCTGTCATATTATGGTCAGCTATTGCATGCCTAGTTAGTTACCCAGTCGTCAGTATTGCACTTTTGTTATACCGTAATGAAGGACCTAGTCGCTTACGACTAGCCTCTGTCGGACAAATGACTTCATTTAACCATGATGGTCAAGTAAATTTTCCTAGTTCAAGCAGTAGTTACATACGTGAAATGTTCAATTCCAATAGAAAAATAATAAAACGACGTGATACAGAAGAATGGTTCCCTGATGATCCTAATGATTTCAATACAGTTGAAAATACTGTTGCCGTACCAGATGATATTCCAGATAATCTTCATACAGATCCATCTAATTTAAGTAAAGACCTAACAGCTACGGTGACAAGTCCAAAAATGGTCGATCAGCCACCACCTGTGATAAGTTCATTTTCTGATAATAAATTATCATCATCATCAATACCATCAAAATCGTCTTTA]

[+] EMBL AI977027             [TAATTCATGTGTACGTTGTTTACGTAGTTCACCGATTGCATCTTTAGTTGGCTTCATTATTGTATTACTGGGCGGTGGGGCTTTTGGTGGAGCAATCATTTTTGCGAGACGTTATTTAATTACACTTTTAAATGCTCCTAATCTATTCCCTTACTTGGACTATGCTATTTATGGCTTAGTCGGAGCAATAGGATTATTTTCACTGTTAGCCTACTTACTATGTGCCCTGTCTTCTGGTTGGAATGCAAAACATTACTTTGAAAGTAGCCGAAAAGCATGCTGTGGAAGGTGTTGTAATATGACGCTTATCATACTTTTGGTAACGGCTGTCATATTATGGTCAGCTATTGCATGCCTAGTTAGTTACCCAGTCGTCAGTATTGCACTTTTGTTATACCGTAATGAAGGACCTAGTCGCTTACGACTAGCCTCTGTCGGACAAATGACTTCATTTAACCATGATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AW017367             [                                                                                                                TATTTAATTACACTTTTAAATGCTCCTAATCTATTCCCTTACTTGGACTATGCTATTTATGGCTTAGTCGGAGCAATAGGATTATTTTCACTGTTAGCCTACTTACTATGTGCCCTGTCTTCTGGTTGGAATGCAAAACATTACTTTGAAAGTAGCCGAAAAGCATGCTGTGGAAGGTGTTGTAATATGACGCTTATCATACTTTTGGTAACGGCTGTCATATTATGGTCAGCTATTGCATGCCTAGTTAGTTACCCAGTCGTCAGTATTGCACTTTTGTTATACCGTAATGAAGGACCTAGTCGCTTACGACTAGCCTCTGTCGGACAAATGACTTCATTTAACCATGATGGTCAAGTAAATTTTCCTAGTTCAAGCAGTAGTTACATACGTGAAATGTTCAATTCCAATAGAAAAATAATAAAACGACGTGATACAGAAGAATGGTTCCCTGATGATCCTAATGATTTCAATACAGTT                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD063682             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAGTATTGCACTTTTGTTATACCGTAATGAAGGACCTAGTCGCTTACGACTAGCCTCTGTCGGACAAATGACTTCATTTAACCACGATGGTCAAATAAATTTTCCTAGTTCAAGCAGTAGTTACATACGTGAAATGTTCAATTCCAATAGAAAAATAATAAAACGACGTGATACAGAAGAATGGTTCCCTGATGATCCTAATGATTTCAATACAGTTGAAAATACTGTTGCCGTACCAGATGATATTCCAGATAATCTTCATACAGATCCATCTAATTTAAGTAAAGACCTAACAGCTACGGTGACAAGTCCAAAAATGGTCGATCAGCCACCACCTGTGATAAGTTCATTTTCTGATAATAAATTATCATCATCATCAATACCATCAAAATCGTCTTTA]


>consensus_5676#0 TAATTCATGTGTACGTTGTTTACGTAGTTCACCGATTGCATCTTTAGTTGGCTTCATTAT TGTATTACTGGGCGGTGGGGCTTTTGGTGGAGCAATCATTTTTGCGAGACGTTATTTAAT TACACTTTTAAATGCTCCTAATCTATTCCCTTACTTGGACTATGCTATTTATGGCTTAGT CGGAGCAATAGGATTATTTTCACTGTTAGCCTACTTACTATGTGCCCTGTCTTCTGGTTG GAATGCAAAACATTACTTTGAAAGTAGCCGAAAAGCATGCTGTGGAAGGTGTTGTAATAT GACGCTTATCATACTTTTGGTAACGGCTGTCATATTATGGTCAGCTATTGCATGCCTAGT TAGTTACCCAGTCGTCAGTATTGCACTTTTGTTATACCGTAATGAAGGACCTAGTCGCTT ACGACTAGCCTCTGTCGGACAAATGACTTCATTTAACCATGATGGTCAAGTAAATTTTCC TAGTTCAAGCAGTAGTTACATACGTGAAATGTTCAATTCCAATAGAAAAATAATAAAACG ACGTGATACAGAAGAATGGTTCCCTGATGATCCTAATGATTTCAATACAGTTGAAAATAC TGTTGCCGTACCAGATGATATTCCAGATAATCTTCATACAGATCCATCTAATTTAAGTAA AGACCTAACAGCTACGGTGACAAGTCCAAAAATGGTCGATCAGCCACCACCTGTGATAAG TTCATTTTCTGATAATAAATTATCATCATCATCAATACCATCAAAATCGTCTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)