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Schistosoma mansoni
cluster # 5679 cluster # 5679       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5679#0 length = 631 sequences # 3  

consensusID : consensus_5679#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 631
fasta sequence
                              [TGGACTGGAAAATTTTGTATTTGACCGACTTGATCGAGATGGGCTAGCAATAGCACTTCGTAGACATTTTCTTACCGTAATACGAGAAGTTGAATTCGATCTAGGTGTAGTACTAGTTTGATTTAATTCTTTTGGCTTGGTGGTAGAAATATTGATTGTTTTAATGTAACCATCAGTAGGCTTATTAACATCTACAGATTCTTTCAATTTTGGTTCGACTGATTTTGTACGACTTATTGGTATGATACGTATTGGTTTTTTCGATGGTGATGTTGAACTACAGCGAATTTTTTGTC-TTTCATTCCCTTCACATTGTATTGGAATTGTAGACGATTGTGATGATATATTGTTAGTTTTATTTTGTTTTTGTTGTGTTAAATCATTTACACCATCAGAACATTTTGAACGTTTAACTTTAGTGTCAATAGTAACTGTTGGATTCTTAGCAATAATTCGATTTATGCTGTTTGTTGTAGTTGTAATTGTTTCTGTCTGTGATGAAATAGTTTCTTCACGAGTTATTTTATGCATTTTTGTACGAATTTCATTATTTGATTTACCAGATGTTGATGATGTAACTACTAGTGGTGTTGATAAAATTGTTGTTATTGGAATTGTTGATGGGTGTTGT]

[-] EMBL AW017140             [TGGACTGGAAAATTTTGTATTTGACCGACTTGATCGAGATGGGCTAGCAATAGCACTTCGTAGACATTTTCTTACCGTAATACGAGAAGTTGAATTCGATCTAGGTGTAGTACTAGTTTGATTTAATTCTTTTGGCTTGGTGGTAGAAATATTGATTGTTTTAATGTAACCATCAGTAGGCTTATTAACATCAACAGATTCTTTCAATTTTGGTTCGACTGATTTTGTACGACTTATTGGTATGATACGTATTGGTTTTTTCGATGGTGATGTTGAACTACAGCGAATTTTTTGTC TTTCATTCCCTTCACATTGTATTGGAATTGTAGACGATTGTGATGATATATTGTTAGTTTTATTTTGTTTTTGTTGTGTTAAATCATTTACACCATCAGAACATTTTGAGCGTTTAACTTTAGTGTCAATAG                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD077092             [   ACTGGAAAATTTTGTATTTGACCGACTTGATCGAGATGGGCTAGCAATAGCACTTCGTAGACATTTTCTTACCGTAATACGAGAAGTTGAATTCGATCTAGGTGTAGTACTAGTTTGATTTAATTCTTTTGGCTTGGTGGTAGAAATATTGATTGTTTTAATGTAACCATCAGTAGGCTTATTAACATCTACAGATTCTTTCAATTTTGGTTCGACTGATTTTGTACGACTTATTGGTATGATACGTATTGGTTTTTTCGATGGTGATGTTGAACTACAGCGAATTTTTTGTC TTTCATTCCCTTCACATTGTATTGGAATTGTAGACGATTGTGATGATATATTGTTAGTTTTATTTTGTTTTTGTTGTGTTAAATCATTTACACCATCAGAACATTTTGAACGTTTAACTTTAGTGTCAATAGTAACTGTTGGATTCTTAGCAATAATTCGATTTATGCTGTTTGTTGTAGTTGTAATTGTTTCTGTCTGTGATGAAATAGTTTCTTCACGAGTTATTTTATGCATTTTTGTACGAATTTCATTATTTGATTTACCAGATGTTGATGATGTAACTACTAGTGGTGTTGATAAAATTGTTGTTATTGGAATTGTTGATGGGTGTTGT]
[+] EMBL CD191270             [                                                                                                                                                            TGTTTTATTGTAACCATCAGTAGGCTTATTAACATCTACAGATTCTTTCAACTTTGGTTCGACTGATTTTGTACGACTTATTGGTATGATACGTATTGGTTTTTTCGATGGTGATGTTGAACTACAGCGAATTTTTTGGCGTTTCATTCCCTTCACATTGTATTGGAATTGTAGACGATTGTGATGATATATTGTTAGTTTTATTTTGTTTTTGTTGTGTTAAATCATTTACACCATCAGAACATTTTGAACGTTTAACTTTAGTGTTAATAGTAACTGTTGGATTCTTAGCAATAATTCGATTTATGCTGTTAGTTGTAGTTGTAATTGTTTCTGTCTGTGATGAAATAGTTTCTTCACGAGTTATTTTATGCATTTTTGTACGAATTTC                                                                                     ]


>consensus_5679#0 TGGACTGGAAAATTTTGTATTTGACCGACTTGATCGAGATGGGCTAGCAATAGCACTTCG TAGACATTTTCTTACCGTAATACGAGAAGTTGAATTCGATCTAGGTGTAGTACTAGTTTG ATTTAATTCTTTTGGCTTGGTGGTAGAAATATTGATTGTTTTAATGTAACCATCAGTAGG CTTATTAACATCTACAGATTCTTTCAATTTTGGTTCGACTGATTTTGTACGACTTATTGG TATGATACGTATTGGTTTTTTCGATGGTGATGTTGAACTACAGCGAATTTTTTGTCTTTC ATTCCCTTCACATTGTATTGGAATTGTAGACGATTGTGATGATATATTGTTAGTTTTATT TTGTTTTTGTTGTGTTAAATCATTTACACCATCAGAACATTTTGAACGTTTAACTTTAGT GTCAATAGTAACTGTTGGATTCTTAGCAATAATTCGATTTATGCTGTTTGTTGTAGTTGT AATTGTTTCTGTCTGTGATGAAATAGTTTCTTCACGAGTTATTTTATGCATTTTTGTACG AATTTCATTATTTGATTTACCAGATGTTGATGATGTAACTACTAGTGGTGTTGATAAAAT TGTTGTTATTGGAATTGTTGATGGGTGTTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)