Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5684 cluster # 5684       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5684#0 length = 563 sequences # 3  

consensusID : consensus_5684#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 563
fasta sequence
                              [TTATAAAAATGATTCGAAAATAGTTGATGATTAATTTTGTTTGCAGATGATGTAAAACAATCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGATGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCAAGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGACGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCATTTGATATAAGTGGATGATCACTTATTGCACAAACACCATGTTTACTCCACTCATGTTTCCAAAAATCTTCGGGATTGTCAAAATCAATCAGATTTGCCCATTGTTTCTGTAAATCATTATAAATAGGCTTGATTAATTCGATTCTAAAAGGTGTTCTGTTTGAACAGTTTTTCGGTTCTGTATGTGGCCATATACTTGGCCATAGTCCATGAATATTGAAATCGTTGATGCTGTAAGGAATTTTACACGTCTGAATAAAACA]

[+] EMBL CD097412             [TTATAAAAATGATTCGAAAATAGTTGATGATTAATTTTGTTTGCAGATGATGTAAAACAATCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGATGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCAAGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGACGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCATTTGATATAAGTGGATGATCACTTATTGCACAAACACCATGTTTACTCCACTCATGTTTCCAAAAATCTTCGGGATTGTCAAAATCAATCAGATTTGCCCATTGTTTCTGTAAATCATTATAAATAGGCTTGATTAATTCGATTCTAAAAGGTGTTCTGTTTGAACAGTTTTTCGGTTCTGTATGTGGCCATATACTTGGCCATAGTCCATGAATATTGAAATCGTTGATGCTGTAAGGAATTT                   ]
[+] EMBL CD197496             [ TATAAAAATGATTCGAAAATAGTTGATGATTAATTTTGTTTGCTGATGATGTAAAACAATCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGATGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCAAGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGACGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD097315             [                                                        ACAATCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGATGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCAAGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGACGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCATTTGATATAAGTGGATGATCACTTATTGCACAAACACCATGTTTACTCCACTCATGTTTCCAAAAATCTTCGGGATTGTCAAAATCAATCAGATTTGCCCATTGTTTCTGTAAATCATTATAAATAGGCTTGATTAATTCGATTCTAAAAGGTGTTCTGTTTGAACAGTTTTTCGGTTCTGTATGTGGCCATATACTTGGCCATAGTCCATGAATATTGAAATCGTTGATGCTGTAAGGAATTTTACACGTCTGAATAAAACA]


>consensus_5684#0 TTATAAAAATGATTCGAAAATAGTTGATGATTAATTTTGTTTGCAGATGATGTAAAACAA TCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGA TGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCA AGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGA CGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCA TTTGATATAAGTGGATGATCACTTATTGCACAAACACCATGTTTACTCCACTCATGTTTC CAAAAATCTTCGGGATTGTCAAAATCAATCAGATTTGCCCATTGTTTCTGTAAATCATTA TAAATAGGCTTGATTAATTCGATTCTAAAAGGTGTTCTGTTTGAACAGTTTTTCGGTTCT GTATGTGGCCATATACTTGGCCATAGTCCATGAATATTGAAATCGTTGATGCTGTAAGGA ATTTTACACGTCTGAATAAAACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)