cluster # 5684

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5684 cluster # 5684 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5684#0 length = 563 sequences # 3

consensusID : consensus_5684#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 563
fasta sequence

                              [TTATAAAAATGATTCGAAAATAGTTGATGATTAATTTTGTTTGCAGATGATGTAAAACAATCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGATGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCAAGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGACGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCATTTGATATAAGTGGATGATCACTTATTGCACAAACACCATGTTTACTCCACTCATGTTTCCAAAAATCTTCGGGATTGTCAAAATCAATCAGATTTGCCCATTGTTTCTGTAAATCATTATAAATAGGCTTGATTAATTCGATTCTAAAAGGTGTTCTGTTTGAACAGTTTTTCGGTTCTGTATGTGGCCATATACTTGGCCATAGTCCATGAATATTGAAATCGTTGATGCTGTAAGGAATTTTACACGTCTGAATAAAACA]

[+] EMBL CD097412             [TTATAAAAATGATTCGAAAATAGTTGATGATTAATTTTGTTTGCAGATGATGTAAAACAATCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGATGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCAAGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGACGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCATTTGATATAAGTGGATGATCACTTATTGCACAAACACCATGTTTACTCCACTCATGTTTCCAAAAATCTTCGGGATTGTCAAAATCAATCAGATTTGCCCATTGTTTCTGTAAATCATTATAAATAGGCTTGATTAATTCGATTCTAAAAGGTGTTCTGTTTGAACAGTTTTTCGGTTCTGTATGTGGCCATATACTTGGCCATAGTCCATGAATATTGAAATCGTTGATGCTGTAAGGAATTT                   ]
[+] EMBL CD197496             [ TATAAAAATGATTCGAAAATAGTTGATGATTAATTTTGTTTGCTGATGATGTAAAACAATCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGATGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCAAGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGACGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD097315             [                                                        ACAATCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGATGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCAAGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGACGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCATTTGATATAAGTGGATGATCACTTATTGCACAAACACCATGTTTACTCCACTCATGTTTCCAAAAATCTTCGGGATTGTCAAAATCAATCAGATTTGCCCATTGTTTCTGTAAATCATTATAAATAGGCTTGATTAATTCGATTCTAAAAGGTGTTCTGTTTGAACAGTTTTTCGGTTCTGTATGTGGCCATATACTTGGCCATAGTCCATGAATATTGAAATCGTTGATGCTGTAAGGAATTTTACACGTCTGAATAAAACA]




>consensus_5684#0
TTATAAAAATGATTCGAAAATAGTTGATGATTAATTTTGTTTGCAGATGATGTAAAACAA
TCAATGAATTCTAATGATGGATTTAAACAAATTCGAATTTCAGACAATCTGCCTGGTTGA
TGCTTTCGCATAGAACAATATATTAACACATTCACACTGAATAAATTTTTCAATTGATCA
AGCAACATATCACGCTTTAAGGTAACCAAATTATTTGGTGTAATGCTGACTGACTCAAGA
CGACTTAATAAATTCACTCTCGATTTTATTGCAAGTGATATATTGAAATAATCCAATTCA
TTTGATATAAGTGGATGATCACTTATTGCACAAACACCATGTTTACTCCACTCATGTTTC
CAAAAATCTTCGGGATTGTCAAAATCAATCAGATTTGCCCATTGTTTCTGTAAATCATTA
TAAATAGGCTTGATTAATTCGATTCTAAAAGGTGTTCTGTTTGAACAGTTTTTCGGTTCT
GTATGTGGCCATATACTTGGCCATAGTCCATGAATATTGAAATCGTTGATGCTGTAAGGA
ATTTTACACGTCTGAATAAAACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case