Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5689 cluster # 5689       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5689#0 length = 896 sequences # 3  

consensusID : consensus_5689#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 896
fasta sequence
                              [TTGATCGGTACATTCAATTGGGCATTTGGAGTTAGTTAAAAGCTTATTGAGCCGAGAATGCACACGCATTTCATTGGGGAATTTACGTTGAAGGTAATTCCAGCAAACTGATCGAGTTGTTGGTTACACGTAGCGACAAGCTGTCGGTGACTGAGAATGAAATCAATTAAAGTTAAGAGCTGTTAATTATTAATAATACGTTAAAAGCATAAACAGTCAGCCAAATACGTCAACCCAAACGTGTTATTTCGTGCTTCTTGATAGTGTCCCCAAATAAAGTTGAGAGGTATTAGTGACGGTGTAGAACGAAGTCAGATGTTCTATATATTTTTTCGACGGCATGCCAGGAGGGTGCTTAAAAAAAGGTAAGGGAGAGAAGCAGAAGAGAGTGTGTTAGTGACTAGCGAAGTTTATAAATATATGGTTGCAGGTAGCTGATAAAAACAACGAAATATAATGAATTCATATTATTTTACATCAGTGTCAGTTCTCACTCTATTTAAAGTAATAAAGGGGGACAATTCCGTAAAAGGAAGCCGGATAGACATATTCGAAGAGTGAAAGATTAACCCGTTGTTATCATGCTCACTTCTCTGTAGACTAAAATTCACCGATCGACAGGTCATGTTTCGCTTGCCGTATGAAGCCATTTGGTATTGTAAGGATGGTCCACAGGTGAAGTCAAGG-AGCTCTAAGAAGCCCAGAAGGAGCCGGACATATTCCAACCAATCAGCTTTGCGAAGAATATTCTAGAATCACGACCTGTGGCTTCGCTATTAGACAATGCTGATAACTCCCTGTGTGCCGATTGGATAACTATAATGATGCTTTCGTTTCTATTAAAAACTATAAATTCCTGACAATTTTGTACCATAATCGACACTGTATGGAATAAT]

[+] EMBL CD079898             [TTGATCGGTACATTCAATTGGGCATTTGGAGTTAGTTAAAAGCTTATTGAGCCGAGAATGCACACGCATTTCATTGGGGAATTTACGTTGAAGGTAATTCCAGCAAACTGATCGAGTTGTTGGTTACACGTAGCGACAAGCTGTCGGTGACTGAGAATGAAATCAATTAAAGTTAAGAGCTGTTAATTATTAATAATACGTTAAAAGCATAAACAGTCAGCCAAATACGTCAACCCAAACGTGTTATTTCGTGCTTCTTGATAGTGTCCCCAAATAAAGTTGAGAGGTATTAGTGACGGTGTAGAACGAAGTCAGATGTTCTATATATTTTTTCGACGGCATGCCAGGAGGGTGCTTAAAAAAAGGTAAGGGAGAGAAGCAGAAGAGAGTGTGTTAGTGACTAGCGAAGTTTATAAATATATGGTTGCAGGTAGCTGATAAAAACAACGAAATATAATGAATTCATATTATTTTACATCAGTGTCAGTTCTCACTCTATTTAAAGTAATAAAGGGGGACAATTCCGTAAAAGGAAGCCGGATAGACATATTCGAAGAGTGAAAGATTAACCCGTTGTTATCATGCTCACTTCTCTGTAGACTAAAATTCACCGATCGACAGGTCATGTTTCGCTTGCCGTATGAAGCCATTTGGTATTGTAAGGATGGTCCACAGGTGAAGTCAAGG AGCTCT                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD133487             [                   GGGCATTTGGAGTTAGTTAAAAGCTTATTGAGCCGAGAATGCACACGCATTTCATTGGGGAATTTACGTTGAAGGTAATTCCAGCAAACTGATCGAGTTGTTGGTTACACGTAGCGACAAGCTGTCGGTGACTGAGAATGAAATCAATTAAAGTTAAGAGCTGTTAATTATTAATAATACGTTAAAAGCATAAACAGTCAGCCAAATACGTCAACCCAAACGTGTTATTTCGTGCTTCTTGATAGTGTCCCCAAATAAAGTTGAGAGGTATTAGTGACGGTGTAGAACGAAGTCAGATGTTCTATATATTTTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074095             [                                                                                                                                                                                                                                                           TGCTTCTTGATAGTGTCCCCAAATANAGTTGAGAGGTATTAGTGACGGTGTAGAACGAAGTCAGATGTTCTATATATTTTTTCGACGGCATGCCAGGAGGGTGCTTAAAAAAAGGTAAGGGAGAGAAGCAGAAGAGAGTGTGTTAGTGACTAGCGAAGTTTATAAATATATGGTTGCAGGTAGCTGATAAAAACAACGAAATATAATGAATTCATATTATTTTACATCAGTGTCAGTTCTCACTCTATTTAAAGTAATAAAGGGGGACAATTCCGTAAAAGGAAGCCGGATAGACATATTCGAAGAGTGAAAGATTAACCCGTTGTTATCATGCTCACTTCTCTGTAGACTAAAATTCACCGATCGACAGGTCATGTTTCGCTTGCCGTATGAAGCCATTTGGTATTGTAAGGATGGTCCACAGGTGAAGTCAAGGAAGCTCTAAGAAGCCCAGAAGGAGCCGGACATATTCCAACCAATCAGCTTTGCGAAGAATATTCTAGAATCACGACCTGTGGCTTCGCTATTAGACAATGCTGATAACTCCCTGTGTGCCGATTGGATAACTATAATGATGCTTTCGTTTCTATTAAAAACTATAAATTCCTGACAATTTTGTACCATAATCGACACTGTATGGAATAAT]


>consensus_5689#0 TTGATCGGTACATTCAATTGGGCATTTGGAGTTAGTTAAAAGCTTATTGAGCCGAGAATG CACACGCATTTCATTGGGGAATTTACGTTGAAGGTAATTCCAGCAAACTGATCGAGTTGT TGGTTACACGTAGCGACAAGCTGTCGGTGACTGAGAATGAAATCAATTAAAGTTAAGAGC TGTTAATTATTAATAATACGTTAAAAGCATAAACAGTCAGCCAAATACGTCAACCCAAAC GTGTTATTTCGTGCTTCTTGATAGTGTCCCCAAATAAAGTTGAGAGGTATTAGTGACGGT GTAGAACGAAGTCAGATGTTCTATATATTTTTTCGACGGCATGCCAGGAGGGTGCTTAAA AAAAGGTAAGGGAGAGAAGCAGAAGAGAGTGTGTTAGTGACTAGCGAAGTTTATAAATAT ATGGTTGCAGGTAGCTGATAAAAACAACGAAATATAATGAATTCATATTATTTTACATCA GTGTCAGTTCTCACTCTATTTAAAGTAATAAAGGGGGACAATTCCGTAAAAGGAAGCCGG ATAGACATATTCGAAGAGTGAAAGATTAACCCGTTGTTATCATGCTCACTTCTCTGTAGA CTAAAATTCACCGATCGACAGGTCATGTTTCGCTTGCCGTATGAAGCCATTTGGTATTGT AAGGATGGTCCACAGGTGAAGTCAAGGAGCTCTAAGAAGCCCAGAAGGAGCCGGACATAT TCCAACCAATCAGCTTTGCGAAGAATATTCTAGAATCACGACCTGTGGCTTCGCTATTAG ACAATGCTGATAACTCCCTGTGTGCCGATTGGATAACTATAATGATGCTTTCGTTTCTAT TAAAAACTATAAATTCCTGACAATTTTGTACCATAATCGACACTGTATGGAATAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)