Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5703 cluster # 5703       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5703#0 length = 733 sequences # 3  
consensusID : consensus_5703#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 733
fasta sequence 
                              [GTTGATCCTGAGCGACTAAAATCAATGGTGTTAAAGATGACAACGGTTTCGAACGTCGTACAATAAAAGGATGCTTAAGTAGTTCAAATGCAGATGCACGTAAATCTACATTAACTTCAAGGCATCGATCTAAGAAATCTAGAAATTCTGCACTTAATTTATCACGTTCTTTAATCTCTGGTTTACCATTTGTACCAATTAAATAAAGTGCACGAACAGGATTTTCATTTAAATACGGTGGTTCACCATCAATCATTTCAATAGCCATAATACCAAGTGACCATATATCAACTTTTGGTCCATATTGTTTTCTTGTTACAACTTCTGGTGCCATCCAATATGGTGTACCAACCATTGTAGAACGTTTTGTTTGTTCTGCACTAAGTTGTGCACAAAAGCCAAAATCAGTTAATTTAACTGAACCATCTAATCCTAATAAAATATTATCTGATTTAATATCACGATGAATCACTTGATTTTTATGTAGAAATTCCAATGCTTGTAAACACTCTCTACATACAGCTGCAATTTGTCCTTCATCCATTAATGTTTCCGTAACAACTTCTGTTAATGAACCACCATCTAAATATTCCATAACAACCCATAATTCATCACCAACAAGATAACTATCTAAATAATTAACAACATTTTGATGTTTTTTCACTTTCATAACATAAATTTCATTAACAATTAAATTCTTTGTTAGGGTGGTTTTTTTAAATTCATTTGTTTG]

[+] EMBL CD096969             [GTTGATCCTGAGCGACTAAAATCAATGGTGTTAAAGATGACAACGGTTTCGAACGTCGTACAATAAAAGGATGCTTAAGTAGTTCAAATGCAGATGCACGTAAATCTACATTAACTTCAAGGCATCGATCTAAGAAATCTAGAAATTCTGCACTTAATTTATCACGTTCTTTAATCTCTGGTTTACCATTTGTACCAATTGAATAAAGTGCACGAACAGGATTTTCATTTAAATACGGTGGTTCACCATCAATCATTTCAATAGCCATAATACCAAGTGACCATATATCAACTTTTGGTCCATATTGTTTTCTTGTTACAACTTCTGGTGCCATCCAATATGGTGTACCAACCATTGTAGAACGTTTTGTTTGTTCTGCACTAAGTTGTGCACAAAAGCCAAAATCAGTTAATTTAACTGAACCATCTAATCCTAATAAAATATTATCTGATTTAATATCACGATGAATCACTTGATTTTTATGTAGAAATTCCAATGCTTGaggatcaa                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD117633             [                                                                                          CAGATGCACGTAAATCTACATTAACTTCAAGGCATCGATCTAAGAAATCTAGAAATTCTGCACTTAATTTATCACGTTCTTTAATCTCTGGTTTACCATTTGTACCAATTAAATAAAGTGCACGAACAGGATTTTCATTTAAATACGGTGGTTCACCATCAATCATTTCAATAGCCATAATACCAAGTGACCATATATCAACTTTTGGTCCATATTGTTTTCTTGTTACAACTTCTGGTGCCATCCAATATGGTGTACCAACCATTGTAGAACGTTTTGTTTGTTCTGCACTAAGTTGTGCACAAAAGCCAAAATCAGTTAATTTAACTGAACCATCTAATCCTAATAAAATATTATCTGATTTAATATCACGATGAATCACTTGATTTTTATGTAGAAATTCCAATGCTCGTAAACACTCTCTACATACAGCTGCAATTTGTCCTTCATCCATTAATGTTTCCGTAACAACTTCTGTTAATGAACCACCATCTAAATAT                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD115710             [                                                                                                                                                                                 CTGGTTTACCATTTGTACCAATTAAATAAAGTGCACGAACAGGATTTTCATTTAAATACGGTGGTTCACCATCAATCATTTCAATAGCCATAATACCAAGTGACCATATATCAACTTTTGGTCCATATTGTTTTCTTGTTACAACTTCTGGTGCCATCCAATATGGTGTACCAACCATTGTAGAACGTTTTGTTTGTTCTGCACTAAGTTGTGCACAAAAGCCAAAATCAGTTAATTTAACTGAACCATCTAATCCTAATAAAATATTATCTGATTTAATATCACGACGAATCACTTGATTTTTATGTAGAAATTCCAATGCTTGTAAACACTCTCTACATACAGCTGCAATTTGTCCTTCATCCATTAATGTTTCCGTAACAACTTCTGTTAATGAACCACCATCTAAATATTCCATAACAACCCATAATTCATCACCAACAAGATAACTATCTAAATAATTAACAACATTTTGATGTTTTTTCACTTTCATAACATAAATTTCATTAACAATTAAATTCTTTGTTAGGGTGGTTTTTTTAAATTCATTTGTTTG]




>consensus_5703#0
GTTGATCCTGAGCGACTAAAATCAATGGTGTTAAAGATGACAACGGTTTCGAACGTCGTA
CAATAAAAGGATGCTTAAGTAGTTCAAATGCAGATGCACGTAAATCTACATTAACTTCAA
GGCATCGATCTAAGAAATCTAGAAATTCTGCACTTAATTTATCACGTTCTTTAATCTCTG
GTTTACCATTTGTACCAATTAAATAAAGTGCACGAACAGGATTTTCATTTAAATACGGTG
GTTCACCATCAATCATTTCAATAGCCATAATACCAAGTGACCATATATCAACTTTTGGTC
CATATTGTTTTCTTGTTACAACTTCTGGTGCCATCCAATATGGTGTACCAACCATTGTAG
AACGTTTTGTTTGTTCTGCACTAAGTTGTGCACAAAAGCCAAAATCAGTTAATTTAACTG
AACCATCTAATCCTAATAAAATATTATCTGATTTAATATCACGATGAATCACTTGATTTT
TATGTAGAAATTCCAATGCTTGTAAACACTCTCTACATACAGCTGCAATTTGTCCTTCAT
CCATTAATGTTTCCGTAACAACTTCTGTTAATGAACCACCATCTAAATATTCCATAACAA
CCCATAATTCATCACCAACAAGATAACTATCTAAATAATTAACAACATTTTGATGTTTTT
TCACTTTCATAACATAAATTTCATTAACAATTAAATTCTTTGTTAGGGTGGTTTTTTTAA
ATTCATTTGTTTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)