cluster # 5737

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Schistosoma mansoni
cluster # 5737 cluster # 5737 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5737#0 length = 507 sequences # 3

consensusID : consensus_5737#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 507
fasta sequence

                              [GATTCGACAACAACACCAACAACATCATCTCATCCTTCTGGACATTTAATATCAACTATGGATTGGGATTTTTATGCAATACCATTTTTAACAGGATTATTATTGTTATTCTTGTTTTATATTAGACATAGAAGGGTTTAAAATTATTGTTTCTGTGTGTAATTTTTTCTGTAATGTATTTATATATGTAATTTGGAGCAATAAATGAAGTCGGTAAACTTTGGAATATTTATTTATTCTTCAGATTTTCCTGTTGTGTGATAAACTATTAACCTACCTTCTTTTCTTTCCAATGGCCTTCGTTAACCTTCCCTGTCCCTCTGCTATCTTAATTTTCAATTCATTTTTTAGTTCTACTTTTGCTTTCCTTTTGTTTTGTAGAAATTAATGTCTATAGATTGTAAAGTTCATTCTTTCTTTACAACTACTAATTACCAACACTACTGCATATATATGTGTGATAAAAACTGGGTCGAACTTTACGTTGCTATTCTTTAAAAAAAAGGG]

[+] EMBL CD128096             [GATTCGACAACAACACCAACAACATCATCTCATCCTTCTGGACATTTAATATCAACTATGGATTGGGATTTTTATGCAATACCATTTTTAACAGGATTATTATTGTTATTCTTGTTTTATATTAGACATAGAAGGGTTTAAAATTATTGTTTCTGTGTGTAATTTTTTCTGTAATGTATTTATATATGTAATTTGGAGCAATAAATGAAGTCGGTAAACTTTGGAATATTTATTTATTCTTCAGATTTTCCTGTTGTGTGATAAACTATTAACCTACCT                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI618808             [                                   TTCTGGACGTTTAATATCAACTATGGATTGGGATTTTTATGCACAACCATTTTTAACAGGATTATTATTGTTATTCTTGTTTTATATTAGACATAGAAGGGTTTAAAATTATTGTTTCTGTGTGTAATTTTTTCTGTAATGTATTTATATATGTAATTTGGAGCAATAAATGAAGTCGGTAAACTTTGGAATATTTATTTATTCTTCAGATTTTCCTGTTGTGTGATAAACTAATTACCTACTATCTTTTCTTTCCAATGGCCTTCGTTAACCTTCCCTGTCCCTCTGCTATCTTAATTTTCAATTCATTTTTTAGTTCTACTTTTGCTTTCCTTTTGTTTTGTAGAAATTAATGTCTATAGATTGTAAAGTTCATTCTTTCTTTACAACTACTAATTACCAACACTACTGCATATATATGTGTGATAAAAACTGGGTCGAACTTTACGTTGCTATTCTTTAAAAAAAAGGG]
[+] EMBL SM045                [                                                                     TTTTATGCAATACCATTTTTAACAGGATTATTATTGTTATTCTTGTTTTATATTAGACATAGAAGGGTTTAAAATTATTGTTTCTGTGTGTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]




>consensus_5737#0
GATTCGACAACAACACCAACAACATCATCTCATCCTTCTGGACATTTAATATCAACTATG
GATTGGGATTTTTATGCAATACCATTTTTAACAGGATTATTATTGTTATTCTTGTTTTAT
ATTAGACATAGAAGGGTTTAAAATTATTGTTTCTGTGTGTAATTTTTTCTGTAATGTATT
TATATATGTAATTTGGAGCAATAAATGAAGTCGGTAAACTTTGGAATATTTATTTATTCT
TCAGATTTTCCTGTTGTGTGATAAACTATTAACCTACCTTCTTTTCTTTCCAATGGCCTT
CGTTAACCTTCCCTGTCCCTCTGCTATCTTAATTTTCAATTCATTTTTTAGTTCTACTTT
TGCTTTCCTTTTGTTTTGTAGAAATTAATGTCTATAGATTGTAAAGTTCATTCTTTCTTT
ACAACTACTAATTACCAACACTACTGCATATATATGTGTGATAAAAACTGGGTCGAACTT
TACGTTGCTATTCTTTAAAAAAAAGGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case