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Schistosoma mansoni
cluster # 5742 cluster # 5742       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5742#0 length = 467 sequences # 3  

consensusID : consensus_5742#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 467
fasta sequence
                              [TGAAGTTGATTTTTGGTTAGTAGGTAAACTATTTTGGTAAACGAGTCTTTTTATTAACACTATGTACACATTTACATACTTGCAAGGAAAATGAACATAATTGAGAATTTTAATGATAAATAACAAT-CTTACAGTTGTATTCCTAATTTTTAAGTGGACGAAACTTGAGTGGTAATCAGTAAAGTAAACCCGTCATGGATAAATAGATGACACTTTTATGACACGCTGGCCAACATTCAGGCCTCAATTTATTAGAGGGTGATTGACCTATAAACTGATTTCCTCCAGTTGTCCATGACATTTCATAATGTTAATTTTGCTTTGATATTTTGTATATAAGCATCTAATGTTATTAAATTTAAAAAAATCAATTTTTCCAGGGTCTCTACCAAGAAAACTTCTATACAAACTTGTATCTATCACTAGAAAGGAAGATGTGGATGGAAAATTCTCGTTCGTTGTACTAA]

[+] EMBL CD123176             [TGAAGTTGATTTTTGGTTAGTAGGTAAACTATTTTGGTAAACGAGTCTTTTTATTAACACTATGTACACATTTACATACTTGCAAGGAAAATGAACATAATTGAGAATTTTAATGATAAATAACAAT CTTACAGTTGTATTCCTAATTTTTAAGTGGACGAAACTTGAGTGGTAATCAGTAAAGTAAACCCGTCATGGATAAATAGATGACACTTTTATGACACGCTGGCCAACATTCAGGCCTCAATTTATTAGAGGGTGATTGACCTATAAACTGATTTCCTCCAGTTGTCCATGACATTTCATAATGTTAATTTTGCTTTGATATTTTGTATATAAGCATCTAATGTTATTAAATTTAAAAAAATCAATTTTTCCAGGGTCTCTACCAAGAAAACTTCTATACAAACTTGTATCTATCACTAGAAAGGAAGATGTGGATGGAAAATTCTCGTTCGTTGTACTAA]
[+] EMBL CD122885             [TGAAGTTGATTTTTGGTTAGTAGGTAAACTATTTTGGTAAACGAGTCTTTTTATTAACACTATGTACACATTTACATACTTGCAAGGAAAATGAACATAATTGAGAATTTTAATGATAAATAACAAT CTTACAGTTGTATTCCTAATTTTTAAGTGGACGAAACTTGAGTGGTAATCAGTAAAGTAAACCCGTCATGGATAAATAGATGACACTTTTATGACACGCTGGCCAACATTCAGGCCTCAATTTATTAGAGGGTGATTGACCTATAAACTGATTTCCTCCAGTTGTCCATGACATTTCATAATGTTAATTTTGCTTTGATATTTTGTATATAAGCATCTAATGTTATTAAATTTAAAAAAATCAATTTTTCCAGGGTCTCTACCAAGAAAACTTCTATACAAACTTGTATCTATCACTAGAAAGGAAGATGTGGATGGAAAA                   ]
[+] EMBL CD123184             [gGAAATTGATTTTTGGTTAATAGGTAAACTATTTTGGTAAACGAATCTTTTTATTAACACTATGTACACATTTACATACTTGCAAGGAAAATGAACATAATTGAGAATTTTAATGATAAATAACAATACTTACAGTTGTATTCCTAATTTTTAAGTGGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_5742#0 TGAAGTTGATTTTTGGTTAGTAGGTAAACTATTTTGGTAAACGAGTCTTTTTATTAACAC TATGTACACATTTACATACTTGCAAGGAAAATGAACATAATTGAGAATTTTAATGATAAA TAACAATCTTACAGTTGTATTCCTAATTTTTAAGTGGACGAAACTTGAGTGGTAATCAGT AAAGTAAACCCGTCATGGATAAATAGATGACACTTTTATGACACGCTGGCCAACATTCAG GCCTCAATTTATTAGAGGGTGATTGACCTATAAACTGATTTCCTCCAGTTGTCCATGACA TTTCATAATGTTAATTTTGCTTTGATATTTTGTATATAAGCATCTAATGTTATTAAATTT AAAAAAATCAATTTTTCCAGGGTCTCTACCAAGAAAACTTCTATACAAACTTGTATCTAT CACTAGAAAGGAAGATGTGGATGGAAAATTCTCGTTCGTTGTACTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)