cluster # 5750

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Schistosoma mansoni
cluster # 5750 cluster # 5750 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5750#0 length = 804 sequences # 3

consensusID : consensus_5750#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 804
fasta sequence

                              [TTATTTTGGTCAGTCGAGCTTCGCTATTCTAAGAATCAGCTTAGTTGCTGTTCTCTGAACCTTTTCCGAAAGCTCACTGTCTTTTTTTAGGCAGGGGCTAGCCGCTTGAATGCAGTACTCATGTTTAGGACGTATGAACACTATACAAGGTCAAAAAAGTCTTTGCATCGATATGACTGAAGGCCCTACGTATTGACCATAGTGTTCTAAAACGTTTGGCGGCTATTGCACGGCAGTGTGCAGTAGTCTTTAAGTCTTGGCTAAAGATGGTTCCCAAGTCAATCTGTCTGGACAACAGGCAGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCGAGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCTACTAGCTAGCGTCTAAAGAGGATTATAAATTGGCGTGTGAAATTATAATTGGGACTTAGAATTATAAGTTCGGGTTAAATATTAAAGGGTTTTCATCGCGAACTGACATAGGCTATAATGCCAAAATGCTACCTAGCCACATATATGAATGAGTTTCGCCCCAAAATCCAAGACTCTCTACCTTAAACCTGATTGGTTCGTCCATAAATTGTAGTCTTGCCAAATATATTCGTATTTTTGTTTGTTTATTATTTATTTATTAAAACACTGGTACAAGGAGGCAGTGAATATGTATGCGTCACACAATTCATTCGATTTTTA-CGAGGACTGTAATACTGTCCGAGCGCCCAAACCGAAACAAGTGGTTTCCTCAGGAGGCCACTC]

[-] EMBL CD096694             [TTATTTTGGTCAGTCGAGCTTCGCTATTCTAAGAATCAGCTTAGTTGCTGTTCTCTGAACCTTTTCCGAAAGCTCACTGTCTTTTTTTAGGCAGGGGCTAGCCGCTTGAATGCAGTACTCATGTTTAGGACGTATGAACACTATACAAGGTCAAAAAAGTCTTTGCATCGATATGACTGAAGGCCCTACGTATTGACCATAGTGTTCTAAAACGTTTGGCGGCTATTGCACGGCAGTGTGCAGTAGTCTTTAAGTCTTGGCTAAAGATGGTTCCCAAGTCAATCTGTCTGGACAACAGGCAGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCGAGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCTACTAGCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD121158             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GACAACAGGCAGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCGAGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCTACTAGCTAGCGTCTAAAGAGGATTATAAATTGGCGTGTGAAATTATAATTGGGACTTAGAATTATAAGTTCGGGTTAAATATTAAAGGGTTTTCATCGCGAACTGACATAGGCTATAATGCCAAAATGCTACCTAGCCACATATATGAATGAGTTTCGCCCCAAAATCCAAGACTCTCTACCTTAAACCTGATTGGTTCGTCCATAAATTGTAGTCTTGCCAAATATATTCGTATTTTTGTTTGTTTATTATTTATTTATTAAAACACTGGTACAAGGAGGCAGTGAATATGTATGCGTCACACAATTCATTCGATTTTTA CGAGGACTGTAATACTGTCCGAGCGCCCAAACCGAAACAAGTGGTTTCCTCAGGAGGCCACTC]
[+] EMBL CD170816             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GACAACAGGCAGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCGAGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCTACTAGCTAGCGTCTAAAGAGGATTATAAATTGGCGTGTGAAATTATAATTGGGACTTAGAATTATAAGTTCGGGTTAAATATTAAAGGGTTTTCATCGCGAACTGACATAGGCTATAGTGCCAAAATGCTACCTAGCCACATATATGAATGAGTTTCGCCCCAAAATCCAAGACTCTCTACCTTAAACCTGATTGGTTCGTCCATAAATTGTAGTCTTGCCAAATATATTCGTATTTTTGTTTGTTTATTATTTATTTATTAAAACACTGGTACAAGGAGGCAGTGAATATGTATGCGTCACACAATTCATTCGATTTTTACCGAGGACT                                                       ]




>consensus_5750#0
TTATTTTGGTCAGTCGAGCTTCGCTATTCTAAGAATCAGCTTAGTTGCTGTTCTCTGAAC
CTTTTCCGAAAGCTCACTGTCTTTTTTTAGGCAGGGGCTAGCCGCTTGAATGCAGTACTC
ATGTTTAGGACGTATGAACACTATACAAGGTCAAAAAAGTCTTTGCATCGATATGACTGA
AGGCCCTACGTATTGACCATAGTGTTCTAAAACGTTTGGCGGCTATTGCACGGCAGTGTG
CAGTAGTCTTTAAGTCTTGGCTAAAGATGGTTCCCAAGTCAATCTGTCTGGACAACAGGC
AGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCG
AGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCT
ACTAGCTAGCGTCTAAAGAGGATTATAAATTGGCGTGTGAAATTATAATTGGGACTTAGA
ATTATAAGTTCGGGTTAAATATTAAAGGGTTTTCATCGCGAACTGACATAGGCTATAATG
CCAAAATGCTACCTAGCCACATATATGAATGAGTTTCGCCCCAAAATCCAAGACTCTCTA
CCTTAAACCTGATTGGTTCGTCCATAAATTGTAGTCTTGCCAAATATATTCGTATTTTTG
TTTGTTTATTATTTATTTATTAAAACACTGGTACAAGGAGGCAGTGAATATGTATGCGTC
ACACAATTCATTCGATTTTTACGAGGACTGTAATACTGTCCGAGCGCCCAAACCGAAACA
AGTGGTTTCCTCAGGAGGCCACTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case