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Schistosoma mansoni
cluster # 5750 cluster # 5750       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5750#0 length = 804 sequences # 3  

consensusID : consensus_5750#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 804
fasta sequence
                              [TTATTTTGGTCAGTCGAGCTTCGCTATTCTAAGAATCAGCTTAGTTGCTGTTCTCTGAACCTTTTCCGAAAGCTCACTGTCTTTTTTTAGGCAGGGGCTAGCCGCTTGAATGCAGTACTCATGTTTAGGACGTATGAACACTATACAAGGTCAAAAAAGTCTTTGCATCGATATGACTGAAGGCCCTACGTATTGACCATAGTGTTCTAAAACGTTTGGCGGCTATTGCACGGCAGTGTGCAGTAGTCTTTAAGTCTTGGCTAAAGATGGTTCCCAAGTCAATCTGTCTGGACAACAGGCAGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCGAGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCTACTAGCTAGCGTCTAAAGAGGATTATAAATTGGCGTGTGAAATTATAATTGGGACTTAGAATTATAAGTTCGGGTTAAATATTAAAGGGTTTTCATCGCGAACTGACATAGGCTATAATGCCAAAATGCTACCTAGCCACATATATGAATGAGTTTCGCCCCAAAATCCAAGACTCTCTACCTTAAACCTGATTGGTTCGTCCATAAATTGTAGTCTTGCCAAATATATTCGTATTTTTGTTTGTTTATTATTTATTTATTAAAACACTGGTACAAGGAGGCAGTGAATATGTATGCGTCACACAATTCATTCGATTTTTA-CGAGGACTGTAATACTGTCCGAGCGCCCAAACCGAAACAAGTGGTTTCCTCAGGAGGCCACTC]

[-] EMBL CD096694             [TTATTTTGGTCAGTCGAGCTTCGCTATTCTAAGAATCAGCTTAGTTGCTGTTCTCTGAACCTTTTCCGAAAGCTCACTGTCTTTTTTTAGGCAGGGGCTAGCCGCTTGAATGCAGTACTCATGTTTAGGACGTATGAACACTATACAAGGTCAAAAAAGTCTTTGCATCGATATGACTGAAGGCCCTACGTATTGACCATAGTGTTCTAAAACGTTTGGCGGCTATTGCACGGCAGTGTGCAGTAGTCTTTAAGTCTTGGCTAAAGATGGTTCCCAAGTCAATCTGTCTGGACAACAGGCAGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCGAGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCTACTAGCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD121158             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GACAACAGGCAGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCGAGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCTACTAGCTAGCGTCTAAAGAGGATTATAAATTGGCGTGTGAAATTATAATTGGGACTTAGAATTATAAGTTCGGGTTAAATATTAAAGGGTTTTCATCGCGAACTGACATAGGCTATAATGCCAAAATGCTACCTAGCCACATATATGAATGAGTTTCGCCCCAAAATCCAAGACTCTCTACCTTAAACCTGATTGGTTCGTCCATAAATTGTAGTCTTGCCAAATATATTCGTATTTTTGTTTGTTTATTATTTATTTATTAAAACACTGGTACAAGGAGGCAGTGAATATGTATGCGTCACACAATTCATTCGATTTTTA CGAGGACTGTAATACTGTCCGAGCGCCCAAACCGAAACAAGTGGTTTCCTCAGGAGGCCACTC]
[+] EMBL CD170816             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GACAACAGGCAGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCGAGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCTACTAGCTAGCGTCTAAAGAGGATTATAAATTGGCGTGTGAAATTATAATTGGGACTTAGAATTATAAGTTCGGGTTAAATATTAAAGGGTTTTCATCGCGAACTGACATAGGCTATAGTGCCAAAATGCTACCTAGCCACATATATGAATGAGTTTCGCCCCAAAATCCAAGACTCTCTACCTTAAACCTGATTGGTTCGTCCATAAATTGTAGTCTTGCCAAATATATTCGTATTTTTGTTTGTTTATTATTTATTTATTAAAACACTGGTACAAGGAGGCAGTGAATATGTATGCGTCACACAATTCATTCGATTTTTACCGAGGACT                                                       ]


>consensus_5750#0 TTATTTTGGTCAGTCGAGCTTCGCTATTCTAAGAATCAGCTTAGTTGCTGTTCTCTGAAC CTTTTCCGAAAGCTCACTGTCTTTTTTTAGGCAGGGGCTAGCCGCTTGAATGCAGTACTC ATGTTTAGGACGTATGAACACTATACAAGGTCAAAAAAGTCTTTGCATCGATATGACTGA AGGCCCTACGTATTGACCATAGTGTTCTAAAACGTTTGGCGGCTATTGCACGGCAGTGTG CAGTAGTCTTTAAGTCTTGGCTAAAGATGGTTCCCAAGTCAATCTGTCTGGACAACAGGC AGCTCAGTGTTGTTCATCATGTATGCATATGTAACCTGACTCAAAATGAAGATTAATGCG AGACTTTAATTTGTGGATAGCGTTTGAGCAATGTCAAGGTGAACTTAAGATAGTCCACCT ACTAGCTAGCGTCTAAAGAGGATTATAAATTGGCGTGTGAAATTATAATTGGGACTTAGA ATTATAAGTTCGGGTTAAATATTAAAGGGTTTTCATCGCGAACTGACATAGGCTATAATG CCAAAATGCTACCTAGCCACATATATGAATGAGTTTCGCCCCAAAATCCAAGACTCTCTA CCTTAAACCTGATTGGTTCGTCCATAAATTGTAGTCTTGCCAAATATATTCGTATTTTTG TTTGTTTATTATTTATTTATTAAAACACTGGTACAAGGAGGCAGTGAATATGTATGCGTC ACACAATTCATTCGATTTTTACGAGGACTGTAATACTGTCCGAGCGCCCAAACCGAAACA AGTGGTTTCCTCAGGAGGCCACTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)