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Schistosoma mansoni
cluster # 5754 cluster # 5754       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5754#0 length = 1057 sequences # 3  

consensusID : consensus_5754#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1057
fasta sequence
                              [AAAAAATACTTTATTTTTCATTTGAATAAGATTATATAACATCTAGTATATCGGCAAAACAGCTTATTTATGTACA-TATAATTCGTTTGATTGTTGGTGCTATATCTGCAGGCCACCATGATGGTATATATGGAATGATTTCTAATTGTATTGCACTATTGTTATCATAGTCAGTATGTAGAGGAATATTCACTATTAGTTTATATTGTTGTTCACTTGCTTCTGTTAAACGTATCAATGCTATCCCACTAATTGGACCATTATCAATAATGAAACTATGATCATCATTATCATTGTTATTAATCATAATGAAATTATTCATATTGACATTACGAATCCATCCAATTGGTTTTAACTTTGATTGAAGTAGTTCATGATTGTTATCCACTTGATATATTGGTGCATTATATATACTATTTAAACTAATTGATGTTTTTAAAGCATCAATATTCCCCATCGACACTATTTTAATTGGTACATATCTTCGCCGAATAACTCCTGTAAAGTGTGTACGTGCTGTCAACTCTTGACCAATATAACATCCTTTGGAAAAGCTAACTCCACCGGACAAATCAGCATTCGCTTCGAACGGTAGTGTATCACTGGTAATGAACTCTTTAATACCTTCTGGTAAG-CCAATTCCC-ACGTGCATTATGATACAGGTTTATATCAAGTGGTTTTGTGTTGCATGATGGGAAAATACTAGTGACATTTGTATTCGATGTTGATAGTATGCGTCCAGACCAACCAGATATACCCCTAGGATCTGAAGCGAAAAATATCAATTGTTTTTGATCACTAATATCAAGTGAATTCACTGGCGACCATGCTTCATAATTATTCAGTTGATTCGAGTGTCTTGATGTCGGCATAGCGACCCAAGGATACACTGATAAGTCGGCGTCTATCTTAACTTTTCCACGTAAATTATACTGCTTTAAGTGTTTAACCAGATTAGGTACGCAACTGACGTCAACTTCAACAAGGTAATCAGACTGATTAGCTGATAAACGATTAGTATGATAGATGAACCTCGTGCCGAATTTTTGGCCTCGAG]

[+] EMBL CD074243             [AAAAAATACTTTATTTTTCATTTGAATAAGATTATATAACATCTAGTATATCGGCAAAACAGCTTATTTATGTACA TATAATTCGTTTGATTGTTGGTGCTATATCTGCAGGCCACCATGATGGTATATATGGAATGATTTCTAATTGTATTGCACTATTGTTATCATAGTCAGTATGTAGAGGAATATTCACTATTAGTTTATATTGTTGTTCACTTGCTTCTGTTAAACGTATCAATGCTATCCCACTAATTGGACCATTATCAATAATGAAACTATGATCATCATTATCATTGTTATTAATCATAATGAAATTATTCATATTGACATTACGAATCCATCCAATTGGTTTTAACTTTGATTGAAGTAGTTCATGATTGTTATCCACTTGATATATTGGTGCATTATATATACTATTTAAACTAATTGATGTTTTTAAAGCATCAATATTCCCCATCGACACTATTTTAATTGGTACATATCTTCGCCGAATAACTCCTGTAAAGTGTGTACGTGCTGTCAACTCTTGACCAATATAACATCCTTTGGAAAAGCTAACTCCACCGGACAAATCAGCATTCGCTTCGAACGGTAGTGTATCACTGGTAATGAACTCTTTAATACCTTCTGGTAAG CCAATTCCC ACGTGCATTATGATACAGGTTTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD076925             [AAAAAATACTTTATTATTCATTTGAATAAGATTATATAACATCTAGTATATCGGCAAAACAGCTTATTTATGTACACTATAAATCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD080323             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTCCACCGGACAAATCAGCATTCGCTTCGAACGGTAGTGTATCACTGGTAATGAACTCTTTAATACCTTCTGGTAAGCCCAATTCCCAACGTGCATTATGATACAGGTTTATATCAAGTGGTTTTGTGTTGCATGATGGGAAAATACTAGTGACATTTGTATTCGATGTTGATAGTATGCGTCCAGACCAACCAGATATACCCCTAGGATCTGAAGCGAAAAATATCAATTGTTTTTGATCACTAATATCAAGTGAATTCACTGGCGACCATGCTTCATAATTATTCAGTTGATTCGAGTGTCTTGATGTCGGCATAGCGACCCAAGGATACACTGATAAGTCGGCGTCTATCTTAACTTTTCCACGTAAATTATACTGCTTTAAGTGTTTAACCAGATTAGGTACGCAACTGACGTCAACTTCAACAAGGTAATCAGACTGATTAGCTGATAAACGATTAGTATGATAGATGAACCTCGTGCCGAATTTTTGGCCTCGAG]


>consensus_5754#0 AAAAAATACTTTATTTTTCATTTGAATAAGATTATATAACATCTAGTATATCGGCAAAAC AGCTTATTTATGTACATATAATTCGTTTGATTGTTGGTGCTATATCTGCAGGCCACCATG ATGGTATATATGGAATGATTTCTAATTGTATTGCACTATTGTTATCATAGTCAGTATGTA GAGGAATATTCACTATTAGTTTATATTGTTGTTCACTTGCTTCTGTTAAACGTATCAATG CTATCCCACTAATTGGACCATTATCAATAATGAAACTATGATCATCATTATCATTGTTAT TAATCATAATGAAATTATTCATATTGACATTACGAATCCATCCAATTGGTTTTAACTTTG ATTGAAGTAGTTCATGATTGTTATCCACTTGATATATTGGTGCATTATATATACTATTTA AACTAATTGATGTTTTTAAAGCATCAATATTCCCCATCGACACTATTTTAATTGGTACAT ATCTTCGCCGAATAACTCCTGTAAAGTGTGTACGTGCTGTCAACTCTTGACCAATATAAC ATCCTTTGGAAAAGCTAACTCCACCGGACAAATCAGCATTCGCTTCGAACGGTAGTGTAT CACTGGTAATGAACTCTTTAATACCTTCTGGTAAGCCAATTCCCACGTGCATTATGATAC AGGTTTATATCAAGTGGTTTTGTGTTGCATGATGGGAAAATACTAGTGACATTTGTATTC GATGTTGATAGTATGCGTCCAGACCAACCAGATATACCCCTAGGATCTGAAGCGAAAAAT ATCAATTGTTTTTGATCACTAATATCAAGTGAATTCACTGGCGACCATGCTTCATAATTA TTCAGTTGATTCGAGTGTCTTGATGTCGGCATAGCGACCCAAGGATACACTGATAAGTCG GCGTCTATCTTAACTTTTCCACGTAAATTATACTGCTTTAAGTGTTTAACCAGATTAGGT ACGCAACTGACGTCAACTTCAACAAGGTAATCAGACTGATTAGCTGATAAACGATTAGTA TGATAGATGAACCTCGTGCCGAATTTTTGGCCTCGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)