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Schistosoma mansoni
cluster # 5790 cluster # 5790       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5790#0 length = 603 sequences # 3  

consensusID : consensus_5790#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 603
fasta sequence
                              [ATGCATTCAATACAAATTAGTTACACATACTACAAATGTCTTAAATTTGTCAATGCTTGGAGCGAGAACTACGGTACGGGGTAATTGGTCTAATTGAAGTTTTCATTCGTCTATAAGCTATCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATATTGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTTCCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGATAAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGTCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAATTCCAACTTATCAGTTAGTCATAATCAACTTTGAGGATGGTACAAATATGTGTTAGTCGAATTTGCTGTACTCTATCAGTACAACAAAATGACAAGTGGCGAGGTCAAAACAATGATAATGAAAAAGACTAAACATTGAGAATACGGAATGAAAAAAAGTATGTAAAAGAATATTGGGACTCAAGATCTACAGGGAGCGATAGTATGACCTATGAGCAACGTTATCTAATGTCTCCAATCGCTA]

[+] EMBL CD147059             [ATGCATTCAATACAAATTAGTTACACATACTACAAATGTCTTAAATTTGTCAATGCTTGGAGCGAGAACTACGGTACGGGGTAATTGGTCTAATTGAAGTTTTCATTCGTCTATAAGCTATCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATATTGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTTCCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGATAAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGTCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAATTCCAACTTATCA                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD147160             [                                                                                           AATTGAAGTTTTCATTCGTCTATAAGCTATCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATATTGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTTCCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGATAAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGGCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAATTCCAACTTATCAGTTAGTCATAATCAACTTTGAGGATGGTACAAATATGTGTTAGTCGAATTTGCTGTACTCTATCAGTACAACAAAATGACAAGTGGCGAGGTCAAAACAATGATAATGAAAAAGACTAAACATTGAGAATACGGAATGAAAAAAAGTATGTAAAAGAATATTGGGACTCAAGATCTACAGGGAGCGATAGTATGACCTATGAGCAACGTTATCTAATGTCTCCAATCGCT ]
[-] EMBL CD096348             [                                                                                            ATTGAAGTTTCCATTCGTCTATAAGCTATCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATATTGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTTCCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGATAAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGTCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAATTCCAACTTATCAGTTAGTCATAATCAACTTTGAGGATGGTACAAATATGTGTTAGTCGAATTTGCTGTACTCTATCAGTACAACAAAATGACAAGTGGCGAGGTCAAAACAATGATAATGAAAAAGACTAAACATTGAGAATACGGAATGAAAAAAAGTATGTAAAAGAATATTGGGACTCAAGATCTACAGGGAGCGATAGTATGACCTATGAGCAACGTTATCTAATGTCTCCAATCGCTA]


>consensus_5790#0 ATGCATTCAATACAAATTAGTTACACATACTACAAATGTCTTAAATTTGTCAATGCTTGG AGCGAGAACTACGGTACGGGGTAATTGGTCTAATTGAAGTTTTCATTCGTCTATAAGCTA TCGGTTTAACATATGATACGCAGATTAGAACTGTTTCCAGTTTACGCAGCTATGACATAT TGACAACGGCCTCAAATCACAACAAAAACGACATATTAATTGTGATTCATTTCCTCTTTT CCCAGTTACATAGCTTACATTTATCAAACGCAAAAATAAAATATGGACTGTGGCTGTGAT AAATTACTATTGTACTTGAGTCACATATGTATTGTCAAATGTATCCTTTGTGTAGTGAAT TCCAACTTATCAGTTAGTCATAATCAACTTTGAGGATGGTACAAATATGTGTTAGTCGAA TTTGCTGTACTCTATCAGTACAACAAAATGACAAGTGGCGAGGTCAAAACAATGATAATG AAAAAGACTAAACATTGAGAATACGGAATGAAAAAAAGTATGTAAAAGAATATTGGGACT CAAGATCTACAGGGAGCGATAGTATGACCTATGAGCAACGTTATCTAATGTCTCCAATCG CTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)