cluster # 5791

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Schistosoma mansoni
cluster # 5791 cluster # 5791 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5791#0 length = 715 sequences # 3

consensusID : consensus_5791#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 715
fasta sequence

                              [AAAATTAGCGGTTTATTGTCGTTGTTAAAGAAAATGAAACTGTTCTCTTCCTTTTTTCTCCTTTCATAAAAAGTTTCACAAAAAAGAAAAGGGAGAAAAGAAAATAATTTTTGTTTTGAAAGAGATTGGAATTATTGATTTTTTTTTTAAAAAATTATATTCAATAAATTGATTTAGTTGCTATCCTCATTAATTAATAAATGATGATTATCATAATTATACAATGAAAGTAATAAGCTAAAAATATTAAGGCGGAATAAACAAACAAAATAGTAAGGATAATAATAATAATAAATCAAAGGCTATTCATCTAATATATATATTAATAATAGTTTGTTTCACCAGAGTAATGACTCCATGCTCTATAATTTGTAAGTGATGTAAAACCATCAAAATTAGGTCGACAATCTAATGTATAAGAAGGTATATTATATTCTATATTACAATCATTATTATTATTACAGTTATTATTATTACAGTTATTACTATTATTAATATTGATCGATTTATCGATTGTAGATAATTCCTCATTATATGTCATTGGTAACATATCATCAGATGATTGTGACTGTTCTATATTTATCATATTCATAAAAATTGGACGAAGTTTTCGTTGTTCAATAATATAATTTTCATGATTATTATTATCCCAATATTCGATCTTATTATTATGATTATGATCATGATTTAATGCAGTAAAACAAATAGCAAATTC]

[+] EMBL CD153402             [AAAATTAGCGGTTTATTGTCGTTGTTAAAGAAAATGAAACTGTTCTCTTCCTTTTTTCTCCTTTCATAAAAAGTTTCACAAAAAAGAAAAGGGAGAAAAGAAAATAATTTTTGTTTTGAAAGAGATTGGAATTATTGATTTTTTTTTTAAAAAATTATATTCAATAAATTGATTTAGTTGCTATCCTCATTAATTAATAAATGATGATTATCATAATTATACAATGAAAGTAATAAGCTAAAAATATTAAGGCGGAATAAACAAACAAAATAGTAAGGATAATAATAATAATAAATCAAAGGCTATTCATCTAATATATATATTAATAATAGTTTGTTTCACCAGAGTAATGACTCCATGCTCTATAATTTGTAAGTGATGTAAAACCATCAAAATTAGGTCGACAATCTAATGTATAAGAAGGTATATTATATTCTATATTACAATCATTATTATTATTACAGTTATTATTATTACAGTTATTACTATTATTAATATTGATCGATTTATCGATTGTAGATAATTCCTCATTATATGTCATTGGTAACATATCATCAGATGATTGTGACTGTTCTATATTTATCATATTCA                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD153134             [                                                                                                                                            TTTTTTTTAAAAAATTATATTCAATAAATTGATTTAGNTGCTATCCTCATTAATTAATAAATGATGATTATCATAATTATACAATGAAAGTAATAAGCTAAAAATATTAAGGCGGAATAAACAAACAAAATAGTAAGGATAATAATAATAATAAATCAAAGGCTATTCATCTAATATATATATTAATAATAGTTTGTTTCACCAGAGTAATGACTCCATGCTCTATAATTTGTAAGTGATGTAAAACCATCAAAATTAGGTCGACAATCTAATGTATAAGAAGGTATATTATATTCTATATTACAATCATTATTATTATTACAGTTATTATTATTACAGTTATTACTATTATTAATATTGATCGATTTATCGATTGTAGATAATTCCTCATTATATGTCATTGGTAACATATCATCAGATGATTGTGACTGTTCTATATTTATCATATTCATAAAAATTGGACGAAGTTTTCGTTGTTCAATAATATAATTTTCATGATTATTATTATCCCAATATTCGATCTTATTATTATGATTATGATCATGATTTAATGCAGTAAAACAAATAGCAAATTC]
[-] EMBL SMAA69052            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATCTAATATATATATTAATAATAGTTTGTTTCACCAGAGTAATGACTCCATGCTCTATAATTTGTAAATGATGTAAAACCATCAAAATTAGGTCGACAATCTAATGTATAAGAAGGTATATTATATTCTATATTACAATCATTATTATTATTACAGTTATCATTA                                                                                                                                                                                                                                                  ]




>consensus_5791#0
AAAATTAGCGGTTTATTGTCGTTGTTAAAGAAAATGAAACTGTTCTCTTCCTTTTTTCTC
CTTTCATAAAAAGTTTCACAAAAAAGAAAAGGGAGAAAAGAAAATAATTTTTGTTTTGAA
AGAGATTGGAATTATTGATTTTTTTTTTAAAAAATTATATTCAATAAATTGATTTAGTTG
CTATCCTCATTAATTAATAAATGATGATTATCATAATTATACAATGAAAGTAATAAGCTA
AAAATATTAAGGCGGAATAAACAAACAAAATAGTAAGGATAATAATAATAATAAATCAAA
GGCTATTCATCTAATATATATATTAATAATAGTTTGTTTCACCAGAGTAATGACTCCATG
CTCTATAATTTGTAAGTGATGTAAAACCATCAAAATTAGGTCGACAATCTAATGTATAAG
AAGGTATATTATATTCTATATTACAATCATTATTATTATTACAGTTATTATTATTACAGT
TATTACTATTATTAATATTGATCGATTTATCGATTGTAGATAATTCCTCATTATATGTCA
TTGGTAACATATCATCAGATGATTGTGACTGTTCTATATTTATCATATTCATAAAAATTG
GACGAAGTTTTCGTTGTTCAATAATATAATTTTCATGATTATTATTATCCCAATATTCGA
TCTTATTATTATGATTATGATCATGATTTAATGCAGTAAAACAAATAGCAAATTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case