These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5792#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 827 fasta sequence [ATTTTGTGTAAATTAGAAGTTGAGGAGTTGGATAAACAACTTAAAGTCTGGCGCAAACGGTGTGAAGAACAGGAGTGTAGTTTATCCGAAATGGCTGCTGTTGTGAATTCGAGTAAGCTTGAAGCTGAAAGTTTGCGTGAGTCACATAGTGCATTCAGTGATGCTCAATGGGCAAATGATTCTGAAAATCCAAACTGTTTTCTTTGTCAGAGTCCGTTCAATGTTAGTCGTCGTCGGCACCACTGCCGAAATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTACCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGCTATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATACAGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTGAGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTCATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTTCACACATTTCTTGATTTTTTGGTGTAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTTTTAATTCTTTTAAATAGATGAAATCGTAAACTTAGATTTTTTACTACTCCTATGCTTCATTAGTTTTTTTTTAACCCATCTTAGTCATTTCACCTTTCATACTATTTTGATGTGAAATAATTTTCGAGTATAATTTTCCCTCCATCACCC-TATT-TAGAACAAGTTAATG] [+] EMBL CD080388 [ATTTTGTGTAAATTAGAAGTTGAGGAGTTGGATAAACAACTTAAAGTCTGGCGCAAACGGTGTGAAGAACAGGAGTGTAGTTTATCCGAAATGGCTGCTGTTGTGAATTCGAGTAAGCTTGAAGCTGAAAGTTTGCGTGAGTCACATAGTGCATTCAGTGATGCTCAATGGGCAAATGATTCTGAAAATCCAAACTGTTTTCTTTGTCAGAGTCCGTTCAATGTTAGTCGTCGTCGGCACCACTGCCGAAATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTACCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGCTATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATACAGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTGAGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTCATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTT ACACATTTCTTGATTNTTTGGTGTAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTNTTAATTCTTTTAAATAGATGAAATCGT AACTTAGA TTTNTACTACT CTATGCTTCATTAGTTNTTTTTTAA CCATCTTAGTCATTTCA CTTTCATACTATNTTGATGTG AATAATTTTCGAGTATAA TTTNCCTTCATCACCCNTATTNNAG AC AGNTNATG] [-] EMBL CD074482 [ CTGTTTTC TTGTCAGAGTCCGTTCAATGTTAGTCGTCGTCGGCACCACTGCCGAAATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTACCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGCTATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATACAGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTGAGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTCATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTTCACACATTTCTTGATTTTTTGGTGTAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTTTTAATTCTTTTAAATAGATGAAATCGTAAACTTAGATTTTTTACTACTCCTATGCTTCATTAGTTTTTTTTTAACCCATCTTAGTCATTTCACCTTTCATACTATTTTGATGTGAAATAATTTTCGAGTATAATTTTCCCTCCATCACCC TATT TAGAACAAGTTAATG] [-] EMBL CD074303 [ ATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTACCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGCTATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATACAGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTGAGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTCATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTTCACACATTTCTTGATTTTTTGGTGTAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTTTTAATTCTTTTAAATAGATGAAATCGTAAACTTAGATTTTTTACTACTCCTATGCTTCATTAGTTTTTTTTTAACCCATCTTAGTCATTTCACCTTTCATACTATTTTGATGTGAAATAATTTTCGAGTATAATTTTCCCTCCATCACCC TATT TAGAACAAGTTAATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||