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Schistosoma mansoni
cluster # 5792 cluster # 5792       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5792#0 length = 827 sequences # 3  

consensusID : consensus_5792#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 827
fasta sequence
                              [ATTTTGTGTAAATTAGAAGTTGAGGAGTTGGATAAACAACTTAAAGTCTGGCGCAAACGGTGTGAAGAACAGGAGTGTAGTTTATCCGAAATGGCTGCTGTTGTGAATTCGAGTAAGCTTGAAGCTGAAAGTTTGCGTGAGTCACATAGTGCATTCAGTGATGCTCAATGGGCAAATGATTCTGAAAATCCAAACTGTTTTCTTTGTCAGAGTCCGTTCAATGTTAGTCGTCGTCGGCACCACTGCCGAAATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTACCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGCTATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATACAGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTGAGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTCATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTTCACACATTTCTTGATTTTTTGGTGTAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTTTTAATTCTTTTAAATAGATGAAATCGTAAACTTAGATTTTTTACTACTCCTATGCTTCATTAGTTTTTTTTTAACCCATCTTAGTCATTTCACCTTTCATACTATTTTGATGTGAAATAATTTTCGAGTATAATTTTCCCTCCATCACCC-TATT-TAGAACAAGTTAATG]

[+] EMBL CD080388             [ATTTTGTGTAAATTAGAAGTTGAGGAGTTGGATAAACAACTTAAAGTCTGGCGCAAACGGTGTGAAGAACAGGAGTGTAGTTTATCCGAAATGGCTGCTGTTGTGAATTCGAGTAAGCTTGAAGCTGAAAGTTTGCGTGAGTCACATAGTGCATTCAGTGATGCTCAATGGGCAAATGATTCTGAAAATCCAAACTGTTTTCTTTGTCAGAGTCCGTTCAATGTTAGTCGTCGTCGGCACCACTGCCGAAATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTACCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGCTATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATACAGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTGAGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTCATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTT ACACATTTCTTGATTNTTTGGTGTAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTNTTAATTCTTTTAAATAGATGAAATCGT AACTTAGA TTTNTACTACT CTATGCTTCATTAGTTNTTTTTTAA CCATCTTAGTCATTTCA CTTTCATACTATNTTGATGTG AATAATTTTCGAGTATAA TTTNCCTTCATCACCCNTATTNNAG AC AGNTNATG]
[-] EMBL CD074482             [                                                                                                                                                                                                  CTGTTTTC TTGTCAGAGTCCGTTCAATGTTAGTCGTCGTCGGCACCACTGCCGAAATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTACCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGCTATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATACAGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTGAGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTCATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTTCACACATTTCTTGATTTTTTGGTGTAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTTTTAATTCTTTTAAATAGATGAAATCGTAAACTTAGATTTTTTACTACTCCTATGCTTCATTAGTTTTTTTTTAACCCATCTTAGTCATTTCACCTTTCATACTATTTTGATGTGAAATAATTTTCGAGTATAATTTTCCCTCCATCACCC TATT TAGAACAAGTTAATG]
[-] EMBL CD074303             [                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTACCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGCTATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATACAGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTGAGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTCATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTTCACACATTTCTTGATTTTTTGGTGTAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTTTTAATTCTTTTAAATAGATGAAATCGTAAACTTAGATTTTTTACTACTCCTATGCTTCATTAGTTTTTTTTTAACCCATCTTAGTCATTTCACCTTTCATACTATTTTGATGTGAAATAATTTTCGAGTATAATTTTCCCTCCATCACCC TATT TAGAACAAGTTAATG]


>consensus_5792#0 ATTTTGTGTAAATTAGAAGTTGAGGAGTTGGATAAACAACTTAAAGTCTGGCGCAAACGG TGTGAAGAACAGGAGTGTAGTTTATCCGAAATGGCTGCTGTTGTGAATTCGAGTAAGCTT GAAGCTGAAAGTTTGCGTGAGTCACATAGTGCATTCAGTGATGCTCAATGGGCAAATGAT TCTGAAAATCCAAACTGTTTTCTTTGTCAGAGTCCGTTCAATGTTAGTCGTCGTCGGCAC CACTGCCGAAATTGCGGCCTGATATTTTGTCACGAATGTTCATCCAGAAAAATGACTCTA CCAAGTTCTGCCAAACCTGTACGAGTATGTGATACATGCCATGGATTACTTTTACATCGC TATAATGCTAAATAAACCATAATAAATAACTTTCATTTGTAACAGATTGCCATTTCATAC AGTCGTTTTAACAATACACTTTTCAAGTAAATAACTAAAAAACATACTTTTTTAGGTCTG AGCATAATAAGCCAGTGTGATATATTAGACTAATGACTTTTATGTTCATTATGTTCTGTC ATTTTCGTTTCCAGTTCCATCATCAGTTTTTCTTTTCACACATTTCTTGATTTTTTGGTG TAATTTGACTATTGTGTGTATTTTGCCGTATAGTTTATTCTATTTTGTTTATTAATTTTT AATTCTTTTAAATAGATGAAATCGTAAACTTAGATTTTTTACTACTCCTATGCTTCATTA GTTTTTTTTTAACCCATCTTAGTCATTTCACCTTTCATACTATTTTGATGTGAAATAATT TTCGAGTATAATTTTCCCTCCATCACCCTATTTAGAACAAGTTAATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)