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Schistosoma mansoni
cluster # 5813 cluster # 5813       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5813#0 length = 591 sequences # 3  

consensusID : consensus_5813#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 591
fasta sequence
                              [CATGGCATTGGTCACTATTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGTACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATAGCATCTTGACATATGAAGCGTTAAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTAGCGTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAATCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTACCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGAAAATATCGGGTAGAAATTAAATTTTGAACGGATTAATGGACAGCTGAATAAAGAGGTAGAACGAAACTATTTATTTTTCTCTATGATTAAAACAGCTTATATATATAAAAAAAATCCAACAAGAAACTCTAGTAAAGAG-AAAAAACAACTCT-GGAATGGAATTTTTCCGATAATATCCCCATTTTCTATCTTTTAAATTATATTCATTTGTGCTTGGATTTATGTTAAATGTCATGTTCGGTTGGCTTTTTTCATATCTTTTGATTGATCAGATCCATTATAATGTCCATTGATTTAA]

[+] EMBL CD095927             [CATGGCATTGGTCACTATTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGTACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATAGCATTTTGACATATGAAGCGTTAAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTAGCGTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAATCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTACCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGAAAATATCGGGTAGAAATTAAATTTTGAACGGATTAATGGACAGCTGAATAAAGAGGTAGAACGAAACTATTTATTTTTCTCTATGATTAAAACAGCTTATATATATAAAAAAAATCCAACAAGAAACTCTAGTAAAGAG AAAAAACAACTCT GGAATGGAATTTTTCCGATAATATCCCCATTTTCTATCTTTTAAATTATATTCATTTGTGCTTGGATTTATGTTAAATGTCATGTTCGGTTGGCTTTTTTCATATCTTTTGATTGATCAGATCCATTATAATGTCCATTGATTTAA]
[+] EMBL CD152291             [CATGGCATTGGTCACTATTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGTACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATAGCATCTTGACATATGAAGCGTTAAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTAGCGTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAGTCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTACCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGAAAATATCGGGTAGAAATTAAATTTTGAACGGATTAATGGAGAGCTGAATAAAGAGGTAGAACGAAACTATTTATTTTTCTCTATGATTAAAACAGCTTATATATATTAAAAAAATCCAACAAGAAACTCTAGTAAAGAGAAAAAAACAACTCTGGGAATGGAATTTTTCCGAT                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD152217             [CATGGCATTGGTCACCACTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGTACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATTGCATCTTGACATATGAAGCGTTCAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTGGCGTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAATCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTACCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGACAATATCGGGTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]


>consensus_5813#0 CATGGCATTGGTCACTATTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGT ACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATAGCAT CTTGACATATGAAGCGTTAAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTAGC GTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAATCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTA CCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGAAAATATC GGGTAGAAATTAAATTTTGAACGGATTAATGGACAGCTGAATAAAGAGGTAGAACGAAAC TATTTATTTTTCTCTATGATTAAAACAGCTTATATATATAAAAAAAATCCAACAAGAAAC TCTAGTAAAGAGAAAAAACAACTCTGGAATGGAATTTTTCCGATAATATCCCCATTTTCT ATCTTTTAAATTATATTCATTTGTGCTTGGATTTATGTTAAATGTCATGTTCGGTTGGCT TTTTTCATATCTTTTGATTGATCAGATCCATTATAATGTCCATTGATTTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)