cluster # 5813

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Schistosoma mansoni
cluster # 5813 cluster # 5813 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5813#0 length = 591 sequences # 3

consensusID : consensus_5813#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 591
fasta sequence

                              [CATGGCATTGGTCACTATTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGTACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATAGCATCTTGACATATGAAGCGTTAAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTAGCGTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAATCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTACCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGAAAATATCGGGTAGAAATTAAATTTTGAACGGATTAATGGACAGCTGAATAAAGAGGTAGAACGAAACTATTTATTTTTCTCTATGATTAAAACAGCTTATATATATAAAAAAAATCCAACAAGAAACTCTAGTAAAGAG-AAAAAACAACTCT-GGAATGGAATTTTTCCGATAATATCCCCATTTTCTATCTTTTAAATTATATTCATTTGTGCTTGGATTTATGTTAAATGTCATGTTCGGTTGGCTTTTTTCATATCTTTTGATTGATCAGATCCATTATAATGTCCATTGATTTAA]

[+] EMBL CD095927             [CATGGCATTGGTCACTATTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGTACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATAGCATTTTGACATATGAAGCGTTAAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTAGCGTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAATCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTACCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGAAAATATCGGGTAGAAATTAAATTTTGAACGGATTAATGGACAGCTGAATAAAGAGGTAGAACGAAACTATTTATTTTTCTCTATGATTAAAACAGCTTATATATATAAAAAAAATCCAACAAGAAACTCTAGTAAAGAG AAAAAACAACTCT GGAATGGAATTTTTCCGATAATATCCCCATTTTCTATCTTTTAAATTATATTCATTTGTGCTTGGATTTATGTTAAATGTCATGTTCGGTTGGCTTTTTTCATATCTTTTGATTGATCAGATCCATTATAATGTCCATTGATTTAA]
[+] EMBL CD152291             [CATGGCATTGGTCACTATTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGTACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATAGCATCTTGACATATGAAGCGTTAAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTAGCGTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAGTCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTACCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGAAAATATCGGGTAGAAATTAAATTTTGAACGGATTAATGGAGAGCTGAATAAAGAGGTAGAACGAAACTATTTATTTTTCTCTATGATTAAAACAGCTTATATATATTAAAAAAATCCAACAAGAAACTCTAGTAAAGAGAAAAAAACAACTCTGGGAATGGAATTTTTCCGAT                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD152217             [CATGGCATTGGTCACCACTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGTACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATTGCATCTTGACATATGAAGCGTTCAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTGGCGTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAATCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTACCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGACAATATCGGGTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]




>consensus_5813#0
CATGGCATTGGTCACTATTCAGCGTTCGACTGATGTACTGCTGTCTATCCAACTGAAAGT
ACTACCAATAATAGTGGTATTGTTATCATAAGCGAGCGTTAGAAAATGTATGAATAGCAT
CTTGACATATGAAGCGTTAAATTAGTGCTTAAACTACTGAATTACAGACTCTAACCTAGC
GTTGTTTAATTCGATTAAGCTCAATCCATTAGTAGTAGTATCACTAGCCTCCATGCTGTA
CCTATGTGCTCTAAAACTCCGATTACATAAATACGTCTATGCTTGATAAATGAAAATATC
GGGTAGAAATTAAATTTTGAACGGATTAATGGACAGCTGAATAAAGAGGTAGAACGAAAC
TATTTATTTTTCTCTATGATTAAAACAGCTTATATATATAAAAAAAATCCAACAAGAAAC
TCTAGTAAAGAGAAAAAACAACTCTGGAATGGAATTTTTCCGATAATATCCCCATTTTCT
ATCTTTTAAATTATATTCATTTGTGCTTGGATTTATGTTAAATGTCATGTTCGGTTGGCT
TTTTTCATATCTTTTGATTGATCAGATCCATTATAATGTCCATTGATTTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case