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Schistosoma mansoni
cluster # 5816 cluster # 5816       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5816#0 length = 887 sequences # 3  

consensusID : consensus_5816#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 887
fasta sequence
                              [GGAACCGGGGGAACGTCAGCGATGTTTGTTGTTCTAGTACATAGGATTGCCTGGAATACAAATGTTACTATTGGATACGATAGGATTTATGTCTGATCTTCCAACTAATTTATTAGCTGCGTTTCGAGCTACTTTAGATGAATGCTTAGATGCAGATCTAATTTTGCATATAGTTGATGTAAGTCAACCGGAATGGCAATTACAAGTGAATCATGTAGAGGAGCTGTTGTGCAGTATTGGTGTTCTTGTAACAAAGTCGACAAACTCTGGACATACAAGTGATTCCAATACATTTGAACCACCTCAAGTGTTGAAAATCGGTAACAAAGTAGATCGAATGTAAGGAAATGGATCAAATGATGTGTACACTGGATTTGATGCATTAATATCTGCTAAAAATGGGACAGGTATGGAAGAGTTGACTTCAAAAGTTCGACTAGCTATAATGAAACGTCTTGGATGGTTTTCACGCACCTTGGATGTTCGCCAAGGTGGTCCTAGTTTTCAATGGATTTATTCTAATGCTATGGTCACAAGCGTGGAAGCCTCCCCTTCAAATTCAGAAAGGCTTAGAATAACCGCAATATTCACTCCTGTCGGTTGGATTAAATTTTGCAGAACATTTAAAATGGCATCCTCTGAAAATGTTTCTCAATGTTTCAAGTAGCGATGTTCTTCATGAATATCGAACACTGTATTTCTCTCCTTGAACCATAATCTTTTACAAATTGTTTGGCATGCAACATTGTTCTATTTTCATAGATTATTTTTTAAGATTTATTTTAA-ACAAAATAGNTATGCCGACCTTACTATTGTCTTCAGATTAGGGTGTACAGATTAAAATTAGACAATTATAGTACTGTATACATTTTATTCTGAAATATTTA]

[+] EMBL CD081807             [GGAACCGGGGGAACGTCAGCGATGTTTGTTGTTCTAGTACATAGGATTGCCTGGAATACAAATGTTACTATTGGATACGATAGGATTTATGTCTGATCTTCCAACTAATTTATTACCTGCGTTTCGAGCTACTTTAGATGAATGCTTAGATGCAGATCTAATTTTGCATATAGTTGATGTAAGTCAACCGGAATGGCAATTACAAGTGAATCATGTAGAGGAGCTGTTGTGCAGTATTGGTGTTCTTGTAACAAAGTCGACAAACTCTGGACATACAAGTGATTCCAATACATTTGAACCACCTCAAGTGTTGAAAATCGGTAACAAAGTAGATCGAATGTAAGGAAATGGATCAAATGATGTGTACACTGGATTTGATGCATTAATATCTGCTAAAAATGGGACAGGTATGGAAGAGTTGACTTCAAAAGTTCGACTAGCTATAATGAAACGTCTTGGATGGTTTTCACGCACCTTGGATGTTCGCCAAGGTGGTCCTAGTTTTCAATGGATTTATTCTAATGCTATGGTCACAAGCGTGGAAGCCTCCCCTTCAAATTCAGAAAGGCTTAGAATAACCGCAATATTCACTCCTGTCGGTTGGATTAAATTTTGCAGAACATTTAAAATGGCATCCTCTGAAAATGTTTCTCAATGTTTCAAGTAGCGATGTTCTTCATGAATATCGAACACTGTATTTCTCTCCTTGAACCATAATCTTTTACAAATTGTTTGGCATGCAACATTGTTCTATTTTCATAGATTATTTTTTAAGATTTATTTTAA ACAAAATAGNTATGCCGACCTTACTATTGTCTTCAGATTAGGGTGTACAGATTAAAATTAGACAATTATAGTACTGTATACATTTTATTCTGAAATATTTA]
[+] EMBL CD139636             [                                                                TTACTATTGGATACGATAGGATTTATGTCTGATCTTCCAACTAATTTATTAGCTGCGTTTCGAGCTACTTTAGATGAATGCTTAGATGCAGATCTAACTTTGCATATAGTTGATGTAAGTCAACCGGAATGGCAATTACAAGTGAATCATGTAGAGGAGCTGTTGTGCAGTATTGGTGTTCTTGTAACAAAGTCGACAAACTCTGGACATACAAGTGATTCCAATACATTTGAACCACCTNCAGTGTTGAAAATCGGTAACAAAGTAGATCGAATtgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD075538             [                                                                                TAGGATTTATGTCTGATCTTCCAACTAATTTATTAGCTGCGTTTCGAGCTACTTTAGATGAATGCTTAGATGCAGATCTAATTTTGCATATAGTTGATGTAAGTCAACCGGAATGGCAATTACAAGTGAATCATGTAGAGGAGCTGTTGTGCAGTATTGGTGTTCTTGTAACAAAGTCGACAAACTCTGGACATACAAGTGATTCCAATACATTTGAACCACCTCAAGTGTTGAAAATCGGTAACAAAGTAGATCGAATGTAAGGAAATGGATCAAATGATGTGTACACTGGATTTGATGCATTAATATCTGCTAAAAATGGGACAGGTATGGAAGAGTTGACTTCAAAAGTTCGACTAGCTATAATGAAACGTCTTGGATGGTTTTCACGCACCTTGGATGTTCGCCAAGGTGGTCCTAGTTTTCAATGGATTTATTCTAATGCTATGGTCACAAGCGTGGAAGCCTCCCCTTCAAATTCAGAAAGGCTTAGAATAACCGCAATATTCACTCCTGTCGGTTGGATTAAATTTTGCAGAACATTTAAAATGGCATCCTCTGAAAATGTTTCTCAATGTTTCAAGTAGCGATGTTCTTCATGAATATCGAACACTGTATTTCTCTCCTTGAACCATAATCTTTTACAAATTGTTTGGCATGCAACATTGTTCTATTTTCATAGATTATTTTTTAAGATTTATTTTAACAAAAAATAGGGATGCCGACCTTACTATTGTCTAAAAATTAGGGTGTACAGATTAAAATTAGACAATTATAGTACTGTATACATTGGATTtt          ]


>consensus_5816#0 GGAACCGGGGGAACGTCAGCGATGTTTGTTGTTCTAGTACATAGGATTGCCTGGAATACA AATGTTACTATTGGATACGATAGGATTTATGTCTGATCTTCCAACTAATTTATTAGCTGC GTTTCGAGCTACTTTAGATGAATGCTTAGATGCAGATCTAATTTTGCATATAGTTGATGT AAGTCAACCGGAATGGCAATTACAAGTGAATCATGTAGAGGAGCTGTTGTGCAGTATTGG TGTTCTTGTAACAAAGTCGACAAACTCTGGACATACAAGTGATTCCAATACATTTGAACC ACCTCAAGTGTTGAAAATCGGTAACAAAGTAGATCGAATGTAAGGAAATGGATCAAATGA TGTGTACACTGGATTTGATGCATTAATATCTGCTAAAAATGGGACAGGTATGGAAGAGTT GACTTCAAAAGTTCGACTAGCTATAATGAAACGTCTTGGATGGTTTTCACGCACCTTGGA TGTTCGCCAAGGTGGTCCTAGTTTTCAATGGATTTATTCTAATGCTATGGTCACAAGCGT GGAAGCCTCCCCTTCAAATTCAGAAAGGCTTAGAATAACCGCAATATTCACTCCTGTCGG TTGGATTAAATTTTGCAGAACATTTAAAATGGCATCCTCTGAAAATGTTTCTCAATGTTT CAAGTAGCGATGTTCTTCATGAATATCGAACACTGTATTTCTCTCCTTGAACCATAATCT TTTACAAATTGTTTGGCATGCAACATTGTTCTATTTTCATAGATTATTTTTTAAGATTTA TTTTAAACAAAATAGNTATGCCGACCTTACTATTGTCTTCAGATTAGGGTGTACAGATTA AAATTAGACAATTATAGTACTGTATACATTTTATTCTGAAATATTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)