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Schistosoma mansoni
cluster # 5827 cluster # 5827       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5827#0 length = 746 sequences # 3  

consensusID : consensus_5827#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 746
fasta sequence
                              [TGACCACAGAGAATAACAAACAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAATAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATTAAAAAAAAGTTAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAATGTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCA-TCAT-AAATAAATAAATAGGATATACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAACTAAATGATAGGGGGGAGATTAAGAAACTACACACACACACACATACACATGTATATATATCACACCTATACCATATACATATATATATCATTTTTTTAAAAATTATTTTTCCCAATTT-GTAATTGTTTACTTTAATTAATCAATAGTATAAACACTAAATATTATTGATCATTAAAAGGATGTTCTCCTTCCCTTTTGTTTTGTTTTTCGGGCCTTTTCTTTGTCATTTATACATAAGTAAATTCTTTGTTTATTTATTGATTTACTTGTTTTGCTACTATGCCCCTATTAAAGTTTATCATTGAAAAAAAATGTATGAATTCTATTTAGATGTTTCATAATTCTTAAAAAAAAAATATCAATTTTGGATTCCTTATCATGTTTACTATTCTATTAAATATGAATACCTACTTACTTACGCGTGGTACCCCTTNGTTGAGGAGCTTAGGCCGGCTCACCACCCTTCCTT]

[+] EMBL CD152889             [TGACCACAGAGAATAACAAACAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAATAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATT AAAAAAAGTTAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAATGTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCACTCCTCCCATAAATAAATAGGATATACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAATTAAATGATAGGGGGGAGATTAAGAAACTACACACACACACACATACACATGTATATATATCACACCTATACCATATACATATATATATCATTTTTTTAAAAATTATTTTTCCCAATTT GTAATTGTTTACTTTAATTAATCAATAGTATAAACACTAAATATTATTGATCATTAAAAGGATGTTCTCCTTCCCTTTTGTTTTGTTTTTCGGGCCTTTTCTTTGTCATTTATACATAAGTAAATTCTTTGTTTATTTATTGATTTACTTGTTTTGCTACTATGCCCCTATTAAAGTTTATCATTGAAAAAAAATGTATGAATTCTATTTAGATGTTTCATAATTCTTAAAAAAAAAATATCAATTTTGGATTCCTTATCATGTTTACTATTCTATTAAATATGAATACCTACTTACTTACGCGTGGTACCCCTTNGTTGAGGAGCTTAGGCCGGCTCACCACCCTTCCTT]
[+] EMBL CD152876             [                    CAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAATAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATTAAAAAAAAGTTAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAATGTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCA TCAT AAATAAATAAATAGGATATACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAACTAAATGATAGGGGGGAGATTAAGAAACTACACACACACACACATACACATGTATATATATCACACCTATACCATATACATATATATATCATTTTTTTAAAAATTATTTTTCCCAATTTGGTAATGGTTa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD152853             [                    CAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAATAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATTAAAAAAAAGTTAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAATGTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCA TCAT AAATAAATAAATAGGATATACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAACTAAATGATAGGGGGGAGATTAAGAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]


>consensus_5827#0 TGACCACAGAGAATAACAAACAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAA TAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATTAAAAAAAAGT TAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAAT GTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCATCATAAATAAATAAATAGGATAT ACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAACTAAATGATAGGGGGGAGATTAAG AAACTACACACACACACACATACACATGTATATATATCACACCTATACCATATACATATA TATATCATTTTTTTAAAAATTATTTTTCCCAATTTGTAATTGTTTACTTTAATTAATCAA TAGTATAAACACTAAATATTATTGATCATTAAAAGGATGTTCTCCTTCCCTTTTGTTTTG TTTTTCGGGCCTTTTCTTTGTCATTTATACATAAGTAAATTCTTTGTTTATTTATTGATT TACTTGTTTTGCTACTATGCCCCTATTAAAGTTTATCATTGAAAAAAAATGTATGAATTC TATTTAGATGTTTCATAATTCTTAAAAAAAAAATATCAATTTTGGATTCCTTATCATGTT TACTATTCTATTAAATATGAATACCTACTTACTTACGCGTGGTACCCCTTNGTTGAGGAG CTTAGGCCGGCTCACCACCCTTCCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)