cluster # 5827

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Schistosoma mansoni
cluster # 5827 cluster # 5827 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5827#0 length = 746 sequences # 3

consensusID : consensus_5827#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 746
fasta sequence

                              [TGACCACAGAGAATAACAAACAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAATAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATTAAAAAAAAGTTAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAATGTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCA-TCAT-AAATAAATAAATAGGATATACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAACTAAATGATAGGGGGGAGATTAAGAAACTACACACACACACACATACACATGTATATATATCACACCTATACCATATACATATATATATCATTTTTTTAAAAATTATTTTTCCCAATTT-GTAATTGTTTACTTTAATTAATCAATAGTATAAACACTAAATATTATTGATCATTAAAAGGATGTTCTCCTTCCCTTTTGTTTTGTTTTTCGGGCCTTTTCTTTGTCATTTATACATAAGTAAATTCTTTGTTTATTTATTGATTTACTTGTTTTGCTACTATGCCCCTATTAAAGTTTATCATTGAAAAAAAATGTATGAATTCTATTTAGATGTTTCATAATTCTTAAAAAAAAAATATCAATTTTGGATTCCTTATCATGTTTACTATTCTATTAAATATGAATACCTACTTACTTACGCGTGGTACCCCTTNGTTGAGGAGCTTAGGCCGGCTCACCACCCTTCCTT]

[+] EMBL CD152889             [TGACCACAGAGAATAACAAACAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAATAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATT AAAAAAAGTTAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAATGTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCACTCCTCCCATAAATAAATAGGATATACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAATTAAATGATAGGGGGGAGATTAAGAAACTACACACACACACACATACACATGTATATATATCACACCTATACCATATACATATATATATCATTTTTTTAAAAATTATTTTTCCCAATTT GTAATTGTTTACTTTAATTAATCAATAGTATAAACACTAAATATTATTGATCATTAAAAGGATGTTCTCCTTCCCTTTTGTTTTGTTTTTCGGGCCTTTTCTTTGTCATTTATACATAAGTAAATTCTTTGTTTATTTATTGATTTACTTGTTTTGCTACTATGCCCCTATTAAAGTTTATCATTGAAAAAAAATGTATGAATTCTATTTAGATGTTTCATAATTCTTAAAAAAAAAATATCAATTTTGGATTCCTTATCATGTTTACTATTCTATTAAATATGAATACCTACTTACTTACGCGTGGTACCCCTTNGTTGAGGAGCTTAGGCCGGCTCACCACCCTTCCTT]
[+] EMBL CD152876             [                    CAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAATAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATTAAAAAAAAGTTAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAATGTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCA TCAT AAATAAATAAATAGGATATACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAACTAAATGATAGGGGGGAGATTAAGAAACTACACACACACACACATACACATGTATATATATCACACCTATACCATATACATATATATATCATTTTTTTAAAAATTATTTTTCCCAATTTGGTAATGGTTa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD152853             [                    CAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAATAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATTAAAAAAAAGTTAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAATGTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCA TCAT AAATAAATAAATAGGATATACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAACTAAATGATAGGGGGGAGATTAAGAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_5827#0
TGACCACAGAGAATAACAAACAATCAATCATCGCAATGAAATAAAACCCAATTAGAGAAA
TAAAAGAGAAAAAACAAGGAGAAAAAAGTTGAAAGATTAAAAAAAATATTAAAAAAAAGT
TAAACATTTTTTGTTGTTGCTAGGTGTTTGTTTTGGTTTTTCCTTTTCAATATTAGGAAT
GTTATTACTATAGTAGAAATGAATTAACCATTACCCATCATAAATAAATAAATAGGATAT
ACATTATCATTAAAACTTAATATAAATAAAACAGAACTAAATGATAGGGGGGAGATTAAG
AAACTACACACACACACACATACACATGTATATATATCACACCTATACCATATACATATA
TATATCATTTTTTTAAAAATTATTTTTCCCAATTTGTAATTGTTTACTTTAATTAATCAA
TAGTATAAACACTAAATATTATTGATCATTAAAAGGATGTTCTCCTTCCCTTTTGTTTTG
TTTTTCGGGCCTTTTCTTTGTCATTTATACATAAGTAAATTCTTTGTTTATTTATTGATT
TACTTGTTTTGCTACTATGCCCCTATTAAAGTTTATCATTGAAAAAAAATGTATGAATTC
TATTTAGATGTTTCATAATTCTTAAAAAAAAAATATCAATTTTGGATTCCTTATCATGTT
TACTATTCTATTAAATATGAATACCTACTTACTTACGCGTGGTACCCCTTNGTTGAGGAG
CTTAGGCCGGCTCACCACCCTTCCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case