cluster # 5829

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Schistosoma mansoni
cluster # 5829 cluster # 5829 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5829#0 length = 757 sequences # 3

consensusID : consensus_5829#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 757
fasta sequence

                              [CACATTCATGACAACTATCCTATTGACAAAACTTTTGGATGTTCCTTTTATTACACGTGAACTTGTTGTTCAAATGATGCCTATTGCATTGACCAATGAAACATTACGTTATTCTACATTTGGTTTCTTGTATGGTACTACACCGACAGCTCCACCTGTGTACTTATTTGCTGCTGAATATCAAGTTATACCTGTGGCCATCGGTGTTGGTCTTGTCTTGGGAACATTCCTATGCGTACCAATTATGTTTATTTTTGCACGTATTATTGCATTGTACAACGCAGCACCAAGTGATTATGCAAATATACTTGGTAGAACTGTTGAAGATATTTCGTGGATTAGTATTGTATGCTGTATTTGGACATTGGGTGTGCTTTTTTTTAGTCGGAAGGCTATTCGAGTTCCTAATCGATTCACTTTATGTCATTTAATTTGTGTGCTATTCGCTTGTACTGGATTATTACTCGGTCGTTTCGTAAATTATTATTATTATGGCATTGAAGGAAGTGTAAACGGTGGAAAACTGAGTCAACCAGCTCATTGGTTAAATTACATACAATTTGCAATATTCTTTTTTGGTTCTACGGGTACACGTTTTTGGACCACATTAATCGGATTAGTTCTTGTTATGGAACGTGCTCGTAGTCTATGCTTTGTATTACGATATCAATTGCATATTTACTTAGCTGGGCTTTTTACACCTGCAGTTGTCACTGGCATACTACTGGTAACATCATTTAGTCAAATGGTGAAAGAT]

[+] EMBL CD178282             [CACATTCATGACAACTATCCTATTGACAAAACTTTTGGATGTTCCTTTTATTACACGTGAACTTGTTGTTCAAATGATGCCTATTGCATTGACCAATGAAACATTACGTTATTCTACATTTGGTTTCTTGTATGGTACTACACCGACAGCTCCACCTGTGTACTTATTTGCTGCTGAATATCAAGTTATACCTGTGGCCATCGGTGTTGGTCTTGTCTTGGGAACATTCCTATGCGTACCAATTATGTTTATTTTTGCACGTATTATTGCATTGTACAACGCAGCACCAAGTGATTATGCAAATATACTTGGTAGAACTGTTGAAGATATTTCGTGGATTAGTATTGTATGCTGTATTTGGACATTGGGTGTGC TTTTTTTAGTCGGAAGGCTATTCGAGTTCCTAATCGATTCACTTTATGTCGTTTAATTTGTGTGCTATTCGCTTGTACTGGATTATTACTCGGTCGTTTCGTAA   ATTATTATTATGGCATTGAAGGAAGTGTAAAC   GGAAAACTGAGTCAACCAGCTCATTGGTTAAATTACATACAATTTGCAATATTCTTTTTTGGTTCTACNGGTA                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BF936680             [                                                      ACGTGAACTTGTTGTTCAAATGATGCCTATTGCATTGACCAATGAAACATTACGTTATTCTACATTTGGTTTCTTGTATGGTACTACACCGACAGCTCCACCTGTGTACTTATTTGCTGCTGAATATCAAGTTATACCTGTGGCCATCGGTGTTGGTCTTGTCTTGGGAACATTCCTATGCGTACCAATTATGTTTATTTTTGCACGTATTATTGCATTGTACAACGCAGCACCAAGTGATTATGCAAATATACTTGGTAGAACTGTTGAAGATATTTCGTGGATTAGTATTGTATGCTGTATTTGGACATTGGGTGTGCTTTTTTTTAGTCGGAAGGCTATTCGAGTTCCTAATCGATTCACTTTATGTCATTTAATTTGTGTGCTATTCGCTTGTACTGGATTATTACTCGGTCGTTTCGTAAATTATTATTATTATGGCATTGAAGGAAGTGTAAACGGTGGAAAACTGAGTCAACCAGCTCATTGGTTAAATTACATACAATTTGCAATATTCTTTTTTGGTTCTACGGGTACACGTTTTTGGACCACATTAATCGGATTAGTTCTTGTTATGGAACGTGCTCGTAGTCTATGCTTTGTATTACGATATCAATTGCATATTTACTTAGCTGGGCTTTTTACACCTGCAGTTGTCACTGGCATACTACTGGTAACATCATTTAGTCAAATGGTGAAAGAT]
[+] EMBL AW017081             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTATGCTGTATTTGGACATTGGGTGTGCTTTTTTTTAGTCGGAAGGCTATTCGAGTTCCTAATCGATTCACTTTATGTCATTTAATTTGTGTGCTATTCGCTTGTACTGGATTATTACTCGGTCGTTTCGTAAATTATTATTATTATGGCATTGAAGGAAGTGTAAACGGTGGAAAACTGAGTCAACCAGCTCATTGGTTAAATTACATACAATTTGCAATATTCTTTTTTGGTTCTACGGGTACACGTTTTTGGACCACATTAATCGGATTAGTTCTTGTTATGGAACGTGCTCGTAGTCTATGCTTTGTATTACGATATCAATTGCATATTTA                                                                            ]




>consensus_5829#0
CACATTCATGACAACTATCCTATTGACAAAACTTTTGGATGTTCCTTTTATTACACGTGA
ACTTGTTGTTCAAATGATGCCTATTGCATTGACCAATGAAACATTACGTTATTCTACATT
TGGTTTCTTGTATGGTACTACACCGACAGCTCCACCTGTGTACTTATTTGCTGCTGAATA
TCAAGTTATACCTGTGGCCATCGGTGTTGGTCTTGTCTTGGGAACATTCCTATGCGTACC
AATTATGTTTATTTTTGCACGTATTATTGCATTGTACAACGCAGCACCAAGTGATTATGC
AAATATACTTGGTAGAACTGTTGAAGATATTTCGTGGATTAGTATTGTATGCTGTATTTG
GACATTGGGTGTGCTTTTTTTTAGTCGGAAGGCTATTCGAGTTCCTAATCGATTCACTTT
ATGTCATTTAATTTGTGTGCTATTCGCTTGTACTGGATTATTACTCGGTCGTTTCGTAAA
TTATTATTATTATGGCATTGAAGGAAGTGTAAACGGTGGAAAACTGAGTCAACCAGCTCA
TTGGTTAAATTACATACAATTTGCAATATTCTTTTTTGGTTCTACGGGTACACGTTTTTG
GACCACATTAATCGGATTAGTTCTTGTTATGGAACGTGCTCGTAGTCTATGCTTTGTATT
ACGATATCAATTGCATATTTACTTAGCTGGGCTTTTTACACCTGCAGTTGTCACTGGCAT
ACTACTGGTAACATCATTTAGTCAAATGGTGAAAGAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case