cluster # 5832

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Schistosoma mansoni
cluster # 5832 cluster # 5832 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_5832#0 length = 1085 sequences # 3
consensusID : consensus_5832#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1085
fasta sequence
                              [CGAGCCTTTAATTCGGCACCAGGCGCTTAACATGGGGTAATGATCTTTGCTGGGGTGGACGTCGTGTCATACATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCCTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTTTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAATATTGTTCAAATGTCCCAATTATTATGTTTGTTGATGATGATTATTTTATCTATCCAAAAAAATGTGGTTGCTTATATTGAAGGTTTAAGCACCGAGCTACGTAAACTTTTGATCAGTGGTTATGTTTGGTATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTNTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGAACAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTNTTATTCGCCTTTTGTTG-GGTGTGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAAATG-ACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAANATG-TCATTCTTGATA-TTACTC-AATGCTCCCACTTATCG-TACC-ATACTACTTTTGAT-AAATTTCTGATAGACT-AATATA-TTATTGATC-AAAGATATTTA]

[+] EMBL CD081815             [CGAGCCTTTAATTCGGCACCAGGCGCTTAACATGGGGTAATGATCTTTGCTGGGGTGGACGTCGTGTCATACATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCCTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTTTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAATATTGTTCAAATGTCCCAATTATTATGTTTGTTGATGATGATTATTTTATCTATCCAAAAAAATGTGGTTGCTTATATTGAAGGTTTAAGCACCGAGCTACGTAAACTTTTGATCAGTGGTTATGTTTGGTATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTNTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGAACAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTNTTATTCGCCTTTTGTTG GGTGTGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAAATG ACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAANATG TCATTCTTGATA TTACTC AATGCTCCCACTTATCG TACC ATACTACTTTTGAT AAATTTCTGATAGACT AATATA TTATTGATC AAAGAT     ]
[-] EMBL CD193026             [                                                                        ATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAATACATATTAAAAAATGAGTCNTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTCTCTTGATCACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD075546             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGATGACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTATCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTTGATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAAAAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCTAGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCAACATTTTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTAGACCAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAATTATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTTTTATTCGCCTTTTGTTGTTGT TGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAATTGTACATACTTTTACTATTATCTGATATATGAAACAAGAAA ATGTTCATTCTTGATATTTACTCAAATGCTCCCACTTATCGTTACCAATACTACTTTTGATAAAATTTCTGATAGACTAAATATATTTATTGGTCAAAAGA ATTTA]




>consensus_5832#0
CGAGCCTTTAATTCGGCACCAGGCGCTTAACATGGGGTAATGATCTTTGCTGGGGTGGAC
GTCGTGTCATACATCTTTTCCTTCTTGGTAATGTCCCATCTAATAATGAACGTTTAAAAT
ACATATTAAAAAATGAGTCCTATGTATATCATGATATAATTCAACAAGATTTTCTTGATC
ACTATTATAATAGTACATATAAAATTATGTTTGGTATTAATTGGGCAGTAAAATATTGTT
CAAATGTCCCAATTATTATGTTTGTTGATGATGATTATTTTATCTATCCAAAAAAATGTG
GTTGCTTATATTGAAGGTTTAAGCACCGAGCTACGTAAACTTTTGATCAGTGGTTATGTT
TGGTATAATGCTGGACCAGTTCGTAAGAATATCGGCAGTCACGATAAGTGGTTGGTTGAT
GACAAAGAATATGCTCCGCGTTATTATCCTCCATATGTGGCAGGGGGTAATTTTTTTTTA
TCAATGAATTTGGCACGTCAATTAAATATAGCTATGCGTTACACAAAATATCTTCGGTTT
GATGATGTCTACCTTGGAATAATACTTAAGAAGTTATTACATGTACCGATGCATTTAAAA
AAAGTCTACACATTCCACCCTGTAAATTTAAATTCATCTGAGATATATGAAATGATTTCT
AGTCATGGCTTTGGCAAATCTGTTTCACAATTCTTCTTATGGGACCGCTTAAAATGTTCA
ACATTNTGTGTACACTCTATTGTTTAATTTACCATTTGTTTTTCTTCTTTTATACTATTA
GAACAATACTTATGACGTTTCTCTTCTTTTTTTTAATCATCCTTCCTGGATCTATCCAAT
TATCAGTCAAGATAAAATGGTAGACAGTTTTACAGGAAACTTTGTCATTNTTATTCGCCT
TTTGTTGGGTGTGGGTATCACCTGTCTTAATCATTTGTATTCTAAATGACATACTTTTAC
TATTATCTGATATATGAAACAAGAAANATGTCATTCTTGATATTACTCAATGCTCCCACT
TATCGTACCATACTACTTTTGATAAATTTCTGATAGACTAATATATTATTGATCAAAGAT
ATTTA
clustalw multiple alignements is not computed in this case