cluster # 5857

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Schistosoma mansoni
cluster # 5857 cluster # 5857 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5857#0 length = 917 sequences # 3

consensusID : consensus_5857#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 917
fasta sequence

                              [ACGATCTGAAGAAGTAGTAGTAGTTCCAGAAAAGTCGAAAAATTCGAAGTAGTAGATTCATTTATTGATGGAGTTGTTGTGTTATTGTCACATGTAGTATCAAACATATAGAATGGATTATTTATTACTATATCATCATCTGTGTATCAGTTTCATATGACAATTTTAGTCTTTCATTATATATATAATACTTGTGTTTTCCTATAACGTATATCTACTACAGTTATCTTTATCAATCACACATAAAGACAATACAAATTATGTTATAAAAATTACTTTTGTATAAAACAGAACAATTCTTCTAAGAGAGAGAGAATAAATGAAATCTGATCATTTATCGTTTATTTACCACTACTTCTTTCCATTTTCCTCTATGTTTTCGTTTGTCACTTTAATTTTGTATTTTTATTTTGTCCAGTTTAATTAGTGTTGAGGGTATGTTTTGTTCAGTTGTTCAGTTCTTTTATTTTCATAATTCATGTTTTTCTTCAATATATTATTACTTGCATTTGAAACTATTGTTGTTTAGTTTATATATCCATTCCTTATTGTTTTCTATTTTCAAATTTATAATATTTCGTTATCCCTTATCGTATAAGATTGATAATCATTCTAGTATAATAGAGTTATAGTAAAGCATGTTATGTAATCATCATTGATCACACTAGAAAATAAACACTTCATGACAATAAAGTTGAATTTTGTCGTCATTACGTTCTACTAATGCTACTAGTTTGTTAAATTAATAGTNGTATTTTGGTTTCATAGAANANAATTTGCCATCGCAACTGGGTTGTGTTTTGTTGAAGCTTGTCTGATTCCTCAGACATTTGNTGNGTACCCTG-TTATC-TACATTNTGNNTATACCCTATA--CCAGTGACATTA-TNTAGCNTCTA-TTATATGAAAAT-AAATAATTCG]

[-] EMBL CD152385             [ACGATCTGAAGAAGTAGTAGTAGTTCCAGAAAAGTCGAAAAATTCGAAGTAGTAGATTCATTTATTGATGGAGTTGTTGTGTTATTGTCACATGTAGTATCAAACATATAGAATGGATTATTTATTACTATATCATCATCTGTGTATCAGTTTCATATGACAATTTTAGTCTTTCATTATATATATAATACTTGTGTTTTCCTATAACGTATATCTACTACAGTTATCTTTATCAATCACACATAAAGACAATACAAATTATGTTATAAAAATTACTTTTGTATAAAACAGAACAATTCTTCTAAGAGAGAGAGAATAAATGAAATCTGATCATTTATCGTTTATTTACCACTACTTCTTTCCATTTTCCTCTATGTTTTCGTTTGTCACTTTAATTTTGTATTTTTATTTTGTCCAGTTTAATTAGTGTTGAGGGTATGTTTTGTTCAGTTGTTCAGTTCTTTTATTTTCATAATTCATGTTTTTCTTCAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD080624             [                                                                                GTTATTGTCACATGTAGTATCAAACATATAGAATGGATTATTTATTATTATATCATCATCTGTGTATCAGTTTCATATGACAATTTTAGTCTTTCATTATATATATAATACTTGTGTTTTCCTATAACGTATATCTACTACAGTTATCTTTATCAATCACACATAAAGACAATACAAATTATGTTATAAAAATTACTTTTGTATAAAACAGAACAATTCTTCTAAGAGAGAGAGAATAAATGAAATCTGATCATTTATCGTTTATTTACCACTACTTCTTTCCATTTTCCTCTATGTTTTCGTTTGTCACTTTAATTTTGTATTTTTATTTTGTCCAGTTTAATTAGTGTTGAGGGTATGTTTTGTTCAGTTGTTCAGTTCTTTTATTTTCATAATTCATGTTTTTCTTCAATATATTATTACTTGCATTTGAAACTATTGTTGTTTAGTTTATATATCCATTCCTTATTGTTTTCTATTTTCAAATTTATAATATTTCGTTATCCCTTATCGTATAAGATTGATAATCATTCTAGTATAATAGAGTTATAGTAAAGCATGTTATGTAATCATCATTGATCACACTAGAAAATAAACACTTCATGACAATAAAGTTGAATTTTGTCGTCATTACGTTCTACTAATGCTACTAGTTTGTTAAATTAATAGTNGTATTTTGGTTTCATAGAANANAATTTGCCATCGCAACTGGGTTGTGTTTTGTTGAAGCTTGTCTGATTCCTCAGACATTTGNTGNGTACCCTG TTATC TACATTNTGNNTATACCCTATA  CCAGTGACATTA TNTAGCNTCTA TTATATGAAAAT AAATAAT   ]
[-] EMBL CD074534             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTCTTCTAAGAGAGAGAGAATAAATGAAATCTGATCATTTATCGTTTATTTACCACTACTTCTTTCCATTTTCCTCTATGTTTTCGTTTGTCACTTTAATTTTGTATTTTTATTTTGTCCAGTTTAATTAGTGTTGAGGGTATGTTTTGTTCAGTTGTTCAGTTCTTTTATTTTCATAATTCATGTTTTTCTTCAATATATTATTACTTGCATTTGAAACTATTGTTGTTTAGTTTATATATCCATTCCTTATTGTTTTCTATTTTCAAATTTATAATATTTCGTTATCCCTTATCGTATAAGATTGATAATCATTTTAGTATAATAGAGTTATAGTAAAGCATGTTATGTAATCATCATTGATCACACTAGAAAATAAACACTTCATGACAATAAAGTTGAATTTTGTCGTCATTACGTTTTACTAATGCTACTAGTTTGTTAAATTAATAGTGTTATTTTGGTTTCATAGAAAAAAATTTGCCATCGCAACT GGTTGTGTTTTGTTGAAGCTTGTTTGATTCCTCAGACATTTGTTGTGTA CCTGTTTATCTTACATTTTGTTTATTACCTATAACCCAGTGACATTATTTTAGCTCCTATTTATATGAAAATAAAATAAATCG]




>consensus_5857#0
ACGATCTGAAGAAGTAGTAGTAGTTCCAGAAAAGTCGAAAAATTCGAAGTAGTAGATTCA
TTTATTGATGGAGTTGTTGTGTTATTGTCACATGTAGTATCAAACATATAGAATGGATTA
TTTATTACTATATCATCATCTGTGTATCAGTTTCATATGACAATTTTAGTCTTTCATTAT
ATATATAATACTTGTGTTTTCCTATAACGTATATCTACTACAGTTATCTTTATCAATCAC
ACATAAAGACAATACAAATTATGTTATAAAAATTACTTTTGTATAAAACAGAACAATTCT
TCTAAGAGAGAGAGAATAAATGAAATCTGATCATTTATCGTTTATTTACCACTACTTCTT
TCCATTTTCCTCTATGTTTTCGTTTGTCACTTTAATTTTGTATTTTTATTTTGTCCAGTT
TAATTAGTGTTGAGGGTATGTTTTGTTCAGTTGTTCAGTTCTTTTATTTTCATAATTCAT
GTTTTTCTTCAATATATTATTACTTGCATTTGAAACTATTGTTGTTTAGTTTATATATCC
ATTCCTTATTGTTTTCTATTTTCAAATTTATAATATTTCGTTATCCCTTATCGTATAAGA
TTGATAATCATTCTAGTATAATAGAGTTATAGTAAAGCATGTTATGTAATCATCATTGAT
CACACTAGAAAATAAACACTTCATGACAATAAAGTTGAATTTTGTCGTCATTACGTTCTA
CTAATGCTACTAGTTTGTTAAATTAATAGTNGTATTTTGGTTTCATAGAANANAATTTGC
CATCGCAACTGGGTTGTGTTTTGTTGAAGCTTGTCTGATTCCTCAGACATTTGNTGNGTA
CCCTGTTATCTACATTNTGNNTATACCCTATACCAGTGACATTATNTAGCNTCTATTATA
TGAAAATAAATAATTCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case