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Schistosoma mansoni
cluster # 5863 cluster # 5863       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5863#0 length = 581 sequences # 3  

consensusID : consensus_5863#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 581
fasta sequence
                              [ATTTGGAGACGGGAGA-GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA-TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA-TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTCACTTGACAAGAAATGGAGGCGTTGTCTCAATTTCGTTAATGTTGGGATATTTAGCAGCACATCTTCCTGCTTATTCTCCAGACGTTTCCATTCTATTTGTGTCACAAATATAATCTGACGTTTGTTTTTAAATCTTAGGCAAACGCGTTAAATACGGGTAACGATAACCTGCTTCCAACTGTATGCATCCTGCATAA]

[+] EMBL CD064705             [ATTTGGAGACGGGACACGTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTACTTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAAGGAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAACTATTTGTTAAAGTATATGATTATTTCTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTCACTTGACAA                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD064675             [     GAGA GGGAGA GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTAACTTGACAAGAAATGGAGGCGTTGTCTCAATTTCGTTAATGTTGGGATATTTAGCAGCACATCTTCCTGCTTATTCTCCAGACGTTTCCATTCTATTTGTGTCACAAATATAATCTGACGTTTGTTTTTAAATCTTAGGCAAACGCGTTAAATACGGGTAACGATAACCTGCTTCCAACTGTATGCATCCTGCATAA]
[+] EMBL CD126817             [      gatgaGGAGA GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGT                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_5863#0 ATTTGGAGACGGGAGAGTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCG TGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTT AACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTATTAAGTG ACATGGTAAAACTTGTATAATAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGT TAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCA AAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAG TAATGTATACGGTATAAAGTGTTCACTTGACAAGAAATGGAGGCGTTGTCTCAATTTCGT TAATGTTGGGATATTTAGCAGCACATCTTCCTGCTTATTCTCCAGACGTTTCCATTCTAT TTGTGTCACAAATATAATCTGACGTTTGTTTTTAAATCTTAGGCAAACGCGTTAAATACG GGTAACGATAACCTGCTTCCAACTGTATGCATCCTGCATAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)