These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5863#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 581 fasta sequence [ATTTGGAGACGGGAGA-GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA-TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA-TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTCACTTGACAAGAAATGGAGGCGTTGTCTCAATTTCGTTAATGTTGGGATATTTAGCAGCACATCTTCCTGCTTATTCTCCAGACGTTTCCATTCTATTTGTGTCACAAATATAATCTGACGTTTGTTTTTAAATCTTAGGCAAACGCGTTAAATACGGGTAACGATAACCTGCTTCCAACTGTATGCATCCTGCATAA] [+] EMBL CD064705 [ATTTGGAGACGGGACACGTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTACTTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAAGGAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAACTATTTGTTAAAGTATATGATTATTTCTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTCACTTGACAA ] [+] EMBL CD064675 [ GAGA GGGAGA GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTAACTTGACAAGAAATGGAGGCGTTGTCTCAATTTCGTTAATGTTGGGATATTTAGCAGCACATCTTCCTGCTTATTCTCCAGACGTTTCCATTCTATTTGTGTCACAAATATAATCTGACGTTTGTTTTTAAATCTTAGGCAAACGCGTTAAATACGGGTAACGATAACCTGCTTCCAACTGTATGCATCCTGCATAA] [+] EMBL CD126817 [ gatgaGGAGA GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||