cluster # 5863

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Schistosoma mansoni
cluster # 5863 cluster # 5863 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5863#0 length = 581 sequences # 3

consensusID : consensus_5863#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 581
fasta sequence

                              [ATTTGGAGACGGGAGA-GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA-TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA-TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTCACTTGACAAGAAATGGAGGCGTTGTCTCAATTTCGTTAATGTTGGGATATTTAGCAGCACATCTTCCTGCTTATTCTCCAGACGTTTCCATTCTATTTGTGTCACAAATATAATCTGACGTTTGTTTTTAAATCTTAGGCAAACGCGTTAAATACGGGTAACGATAACCTGCTTCCAACTGTATGCATCCTGCATAA]

[+] EMBL CD064705             [ATTTGGAGACGGGACACGTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTACTTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAAGGAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAACTATTTGTTAAAGTATATGATTATTTCTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTCACTTGACAA                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD064675             [     GAGA GGGAGA GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGTGTTAACTTGACAAGAAATGGAGGCGTTGTCTCAATTTCGTTAATGTTGGGATATTTAGCAGCACATCTTCCTGCTTATTCTCCAGACGTTTCCATTCTATTTGTGTCACAAATATAATCTGACGTTTGTTTTTAAATCTTAGGCAAACGCGTTAAATACGGGTAACGATAACCTGCTTCCAACTGTATGCATCCTGCATAA]
[+] EMBL CD126817             [      gatgaGGAGA GTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCGTGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTTAACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTA TTAAGTGACATGGTAAAACTTGTATAA TAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGTTAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCAAAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAGTAATGTATACGGTATAAAGT                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_5863#0
ATTTGGAGACGGGAGAGTGGACTCTCCCCACTGTCGGCCATACTAGGGCATTTGGGGGCG
TGCTATGAAAACTAAAGTAGTCCAATATAACCCACCACCTGTTTAGACAACCTCCATGTT
AACGATCTTAATATACAAACAGATAAATACTACATATCTTGTAAGGGTATGTATTAAGTG
ACATGGTAAAACTTGTATAATAATATGCAAGGTATTAACCTCATGAGTGGGCTTCAGTGT
TAATACCAACACATGGAGTTAGTTAGGGTTTGAAGTCATAATACTTCCTTTAGTATTTCA
AAAATATTTGTTAAAGTATATGATTATTTTTTGATATGTGCAAACTACTTAAATACAAAG
TAATGTATACGGTATAAAGTGTTCACTTGACAAGAAATGGAGGCGTTGTCTCAATTTCGT
TAATGTTGGGATATTTAGCAGCACATCTTCCTGCTTATTCTCCAGACGTTTCCATTCTAT
TTGTGTCACAAATATAATCTGACGTTTGTTTTTAAATCTTAGGCAAACGCGTTAAATACG
GGTAACGATAACCTGCTTCCAACTGTATGCATCCTGCATAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case