cluster # 5893

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Schistosoma mansoni
cluster # 5893 cluster # 5893 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5893#0 length = 537 sequences # 3

consensusID : consensus_5893#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 537
fasta sequence

                              [ATAGTGCGTTACATCAACTGCACGTGTAATGAGGCTGAACTTTAAGTTCAAAAATCTTTTTGGGACAGCCTACAAATGTGGATCCGTTGTTTTCACGAACAATGGTTTGGGTCTTTTGAGCCCAGTTGGCAATCAGATAACAGTTTTTGATCTTAAGAAAGATGAAGTAGCGTCTATTGATATTTCCTCCTCTCACGATGTGCACCACTTGGCGTTGTCTCCTTCAATATCTCTGCTAGTCGCCATTAATGAGGTTGGTGATGCGTCTTTATGCTCACTCTCCACAGGAGCTGTAATATCTGTGTATCCTTTCAAGGGAGTGGTTTTGGCCGTTTCTTTCAGCCCAGATGGAAAGTTCTTGGCTGTTGCCAAAGGTAATAATGTGATGCTTTTCTTCTCGCCCTCTCCAAACCGCCAGTTTAATCATTTGGAACTCTACCGTGTGTTTTACGGCTTTACGGATAACGTTACTTGTATTGATTGGTCATGTGATTCTAGGTTTTTCATTGCTGGATCAGTCGATTCCACTAGCCGGCT]

[+] EMBL CD094957             [ATAGTGCGTTACATCAACTGCACGTGTAATGAGGCTGAACTTTAAGTTCAAAAATCTTTTTGGGACAGCCTACAAATGTGGATCCGTTGTTTTCACGAACAATGGTTTGGGTCTTTTGAGCCCAGTTGGCAATCAGATAACAGTTTTTGATCTTAAGAAAGATGAAGTAGCGTCTATTGATATTTCCTCCTCTCACGATGTGCACCACTTGGCGTTGTCTCCTTCAATATCTCTGCTAGTCGCCATTAATGAGGTTGGTGATGCGTCTTTATGCTCACTCTCCACAGGAGCTGTAATATCTGTGTATCCTTTCAAGGGAGTGGTTTTGGCCGTTTCTTTCAGCCCAGATGGAAAGTTCTTGGCTGTTGCCAAAGGTAATAATGTGATGCTTTTCTTCTCGCCCTCTCCAAACCGCCAGTTTAATCATTTGGAACTCTACCGTGTGTTTTACGGCTTTACGGATAACGTTACTTGTATTGATTGGTCATGTGATTCTAGGTTTTTCATTGCTGGATCAGTCGATTCCACTAGCCGGCT]
[+] EMBL CD095017             [ATAGTGCGTTACATCAGCTGCACGTGTAATGAGGCTGAACTTTAAGTTCAAAAATCTTTTTGGGACAGCCTACAAATGTGGATCCGTTGTTTTCACGAACAATGGTTTGGGTCTTTTGAGCCCAGTTGGCAATCAGATAACAGTTTTTGATCTTAAGAAAGATGAAGTAGCGTCTATTGATATTTCCTCCTCTCACGATGTGCACCACTTGGCGTTGTCTCCTTCAATATCTCTGCTAGTCGCCATTAATGAGGTTGGTGATGCGTCTTTATGCTCACTCTCCACAGGAGCTGTAATATCTGTGTATCCTTTCAAGGGAGTGGTTTTGGCCGTTTCTTTCAGCCCAGATGGAAAGTTCTTGGCTGTCGCCAAAGGTAATAATGTGATGCTTTTCTTCTCGCCCTCTCCAAACCGCCAGTTTAATCATTTGGAACTCTACCGTGTGTTTTACGGCTTTACGGATAACGTTACTTGTATTGATTGGTCATGTGATTCTAGGTTTTTCATTGCTGGATCAGTCGATTCCAC         ]
[-] EMBL CD155858             [                     ACGTGTAATGAGGCTGAACTTTAAGTTCAAAAATCTTTTTGGGACAGCCTACAAATGTGGATCCGTTGTTTTCACGAACAATGGTTTGGGTCTTTTGAGCCCAGTTGGCAATCAGATAACAGTTTTTGATCTTAAGAAAGATGAAGTAGCGTCTATTGATATTTCCTCCTCTCACGATGTGCACCACTTGGCGTTGTCTCCTTCAATATCTCTGCTAGTCGCCATTAATGAGGTTGGTGATGCGTCTTTATGCTCACTCTCCACAGGAGCTGTAATATCTGTGTATCCTTTCAAGGGAGTGGTTTTGGCCGTTTCTTTCAGCCCAGATGGAAAGTTCTTGGCTGTTGCCAAAGGTAATAATGTGATGCTTTTCT                                                                                                                                              ]




>consensus_5893#0
ATAGTGCGTTACATCAACTGCACGTGTAATGAGGCTGAACTTTAAGTTCAAAAATCTTTT
TGGGACAGCCTACAAATGTGGATCCGTTGTTTTCACGAACAATGGTTTGGGTCTTTTGAG
CCCAGTTGGCAATCAGATAACAGTTTTTGATCTTAAGAAAGATGAAGTAGCGTCTATTGA
TATTTCCTCCTCTCACGATGTGCACCACTTGGCGTTGTCTCCTTCAATATCTCTGCTAGT
CGCCATTAATGAGGTTGGTGATGCGTCTTTATGCTCACTCTCCACAGGAGCTGTAATATC
TGTGTATCCTTTCAAGGGAGTGGTTTTGGCCGTTTCTTTCAGCCCAGATGGAAAGTTCTT
GGCTGTTGCCAAAGGTAATAATGTGATGCTTTTCTTCTCGCCCTCTCCAAACCGCCAGTT
TAATCATTTGGAACTCTACCGTGTGTTTTACGGCTTTACGGATAACGTTACTTGTATTGA
TTGGTCATGTGATTCTAGGTTTTTCATTGCTGGATCAGTCGATTCCACTAGCCGGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case