cluster # 5903

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Schistosoma mansoni
cluster # 5903 cluster # 5903 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5903#0 length = 1088 sequences # 3
consensusID : consensus_5903#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1088
fasta sequence
                              [CTGGCCAANATTCGGCACGAGGTCTACTGTAATCCGCGTTTGGGTACTGAGCATACGCGAGTCGTTAACAGTTTGCGTCCACCCCTTCCAAATAATGATCCATTTCTTACACCGCGACCTATTCCTGGAGATCGTGTAGTTGTTTATGATGTATTTGCTGGGATTGGACCTTTCTCTATCCCAGCTAGTCGAGCAGGATGTCATGTGTTGGCGAATGATCTCAATCCTGATTCGTTTATTTGGCTTAAGAAAAATGTTGCCCAAAACTCATCGCGTAAACATCCTTTGAAAAATATTATCTGCTACAATATGGATGGACGTGAATTTATTCGTGAAATTCTTCTTCCGCACTACAGAAAATATGGGAGTTCTGACAAAATTGAATCAACTGATTGTGATTCCATTTCATCATCAATTGATCGTTTTGTAGTTATTATGAATCTTCCTCAATTGGCTATAGATTTTTTAGATGCATTTGTACCACCATTAAATTGTATAAATTCATCAAATATCATTACTGATAATAATAGTGATAATGTAACTGCTAATCTAAATGATTCATCTCCTATCCATCAAAAGTTCATTAAACCTTTGTATATTTACTGTTATTGTTTTATGAGACGTAATATTGAATCAGAAGAAAATATAAAAATACGTTTAGCTAAAGCATTAAATACAAATATTACTGATTTATTTCAATTTGTTAATTC-ACACCAANNTATG-AACAGTNTATGGGATAC-TGAATATTGAACAAACGAATGATCAATGTTTTATAAATAATTGGCATTATCGTTTTGTACGTAATGTTGCACCATTTAAAGATATGTATTGTGCTGAATTTGAATTATATTTACCAAAATTATGGTTATTTTATGATTATTCAAATCCAACAGTAAAACGTTCTCGAACTACTGAGAATGAACTAATTGAGTAAGAAACATCGAAATAATAGTCATAATAAGACATAAAGAAAAAAGAAGGAATGAATAAATAATTTGCTAATTTTGATCAATTGTAAATAATATTTTTAAATATTCTGAAGTATTTTTTTAAAGTTAAAAAAAGGTTACAATATAAATAAAATTTAT]

[+] EMBL CD080752             [CTGGCCAANATTCGGCACGAGGTCTACTGTAATCCGCGTTTGGGTACTGAGCATACGCGAGTCGTTAACAGTTTGCGTCCACCCCTTCCAAATAATGATCCATTTCTTACACCGCGACCTATTCCTGGAGATCGTGTAGTTGTTTATGATGTATTTGCTGGGATTGGACCTTTCTCTATCCCAGCTAGTCGAGCAGGATGTCATGTGTTGGCGAATGATCTCAATCCTGATTCGTTTATTTGGCTTAAGAAAAATGTTGCCCAAAACTCATCGCGTAAACATCCTTTGAAAAATATTATCTGCTACAATATGGATGGACGTGAATTTATTCGTGAAATTCTTCTTCCGCACTACAGAAAATATGGGAGTTCTGACAAAATTGAATCAACTGATTGTGATTCCATTTCATCATCAATTGATCGTTTTGTAGTTATTATGAATCTTCCTCAATTGGCTATAGATTTTTTAGATGCATTTGTACCACCATTAAATTGTATAAATTCATCAAATATCATTACTGATAATAATAGTGATAATGTAACTGCTAATCTAAATGATTCATCTCCTATCCATCAAAAGTTCATTAAACCTTTGTATATTTACTGTTATTGTTTTATGAGACGTAATATTGAATCAGAAG AAATATAAAAATACGTTTAGCTAAAGCATTAAATACAAATATTACTGATTTATTTCAATTTGTTAATTC ACACCAANNTATG AACAGTNTATGGGATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD137880             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aTTGTTCCGCAGTACAGAAAATATGGGAGTTCTGACAAAATTGAATCAACTGATTGTGATTCCATTTCATCATCAATTGATCGTTTTGTAGTTATTATGAATCTTCCTCAATTGGCTATAGATTTTTTAGATGCATTTGTACCACCATTAAATTGTATAAATTCATCAAATATCATTACTGATAATAATAGTGATAATGTAACTGCTAATTTAAATGATTCATCTCCTATCCATCAAAAGTTCATTAAACCTTTGTATATTTACTGTTATTGTTTTATGAGACGTAATATTGAATCAGAAGAAAATATAAAAATACGTTTAGCTAAAGCATTAAATACAAATATTACTGATTTATTTCAATTTGTTAATTC Aa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD074676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTACCACCATTAAATTGTATAAATTCATCAAATATCATTACTGATAATAATAGTGATAATGTAACTGCTAATCTAAATGATTCATCTCCTATCCATCAAAAGTTCATTAAACCTTTGTATATTTACTGTTATTGTTTTATGAGACGTAATATTGAATCAGAAGAAAATATAAAAATACGTTTAGCTAAAGCATTAAATACAAATATTACTGATTTATTTCAATTTGTTAATTCAACACCAAATAATGAAACAGTTAATGATA ACTTGAATATTGAACAAACGAATGATCAATGTTTTATAAATAATTGGCATTATCGTTTTGTACGTAATGTTGCACCATTTAAAGATATGTATTGTGCTGAATTTGAATTATATTTACCAAAATTATGGTTATTTTATGATTATTCAAATCCAACAGTAAAACGTTCTCGAACTACTGAGAATGAACTAATTGAGTAAGAAACATCGAAATAATAGTCATAATAAGACATAAAGAAAAAAGAAGGAATGAATAAATAATTTGCTAATTTTGATCAATTGTAAATAATATTTTTAAATATTCTGAAGTATTTTTTTAAAGTTAAAAAAAGGTTACAATATAAATAAAATTTAT]




>consensus_5903#0
CTGGCCAANATTCGGCACGAGGTCTACTGTAATCCGCGTTTGGGTACTGAGCATACGCGA
GTCGTTAACAGTTTGCGTCCACCCCTTCCAAATAATGATCCATTTCTTACACCGCGACCT
ATTCCTGGAGATCGTGTAGTTGTTTATGATGTATTTGCTGGGATTGGACCTTTCTCTATC
CCAGCTAGTCGAGCAGGATGTCATGTGTTGGCGAATGATCTCAATCCTGATTCGTTTATT
TGGCTTAAGAAAAATGTTGCCCAAAACTCATCGCGTAAACATCCTTTGAAAAATATTATC
TGCTACAATATGGATGGACGTGAATTTATTCGTGAAATTCTTCTTCCGCACTACAGAAAA
TATGGGAGTTCTGACAAAATTGAATCAACTGATTGTGATTCCATTTCATCATCAATTGAT
CGTTTTGTAGTTATTATGAATCTTCCTCAATTGGCTATAGATTTTTTAGATGCATTTGTA
CCACCATTAAATTGTATAAATTCATCAAATATCATTACTGATAATAATAGTGATAATGTA
ACTGCTAATCTAAATGATTCATCTCCTATCCATCAAAAGTTCATTAAACCTTTGTATATT
TACTGTTATTGTTTTATGAGACGTAATATTGAATCAGAAGAAAATATAAAAATACGTTTA
GCTAAAGCATTAAATACAAATATTACTGATTTATTTCAATTTGTTAATTCACACCAANNT
ATGAACAGTNTATGGGATACTGAATATTGAACAAACGAATGATCAATGTTTTATAAATAA
TTGGCATTATCGTTTTGTACGTAATGTTGCACCATTTAAAGATATGTATTGTGCTGAATT
TGAATTATATTTACCAAAATTATGGTTATTTTATGATTATTCAAATCCAACAGTAAAACG
TTCTCGAACTACTGAGAATGAACTAATTGAGTAAGAAACATCGAAATAATAGTCATAATA
AGACATAAAGAAAAAAGAAGGAATGAATAAATAATTTGCTAATTTTGATCAATTGTAAAT
AATATTTTTAAATATTCTGAAGTATTTTTTTAAAGTTAAAAAAAGGTTACAATATAAATA
AAATTTAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case