cluster # 5908

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Schistosoma mansoni
cluster # 5908 cluster # 5908 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5908#0 length = 553 sequences # 3

consensusID : consensus_5908#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 553
fasta sequence

                              [CGACCGTCGCAGATTCGGCTCCAGAATAGCGTGTTATTTTAATAATTGAGAGAGCTAAAGTACCTGAAACTTGTTGACTAGTTATCCAATCATGAACTAATGATACTAAACGTCTTCGACCAAATTCATCGCTTAAATCAATTGATCCTGCCATTGATAAAATTTGTTCAACAACACATTCTTGTTCAATTGCTTTTTCATCAAACTCTTGAGCAAGAACAGTTTGAACAAGTTTATCTACAACAGTTTTAGCTAAGTCAACGTATACACTAACAGACGGTTGAACTATATCAGCTAACCGTTGTAAAGGATTGTTTTCTTCATTGTTATCTTCATGCTCAGGGTGTACTGCTGATTTTCTCGTTGTTGTTGTTGTGTCATTTGCATTAAGTTGTCTTTTATGAATAAATTCCACTAATGCCCTCCAGAAAAATGTTGCTTCCGGTGTAAGGCAATCGGATTTAAGTATTCGATCAGAAGTTAAATAATTTGGTGACCATTCTTGCACAACTTTCAACAGATCGTCTGGTGATAACATTTCAAATAGACTATC]

[+] EMBL CD097759             [CGACCGTCGCAGATTCGGCTCCAGAATAGCGTGTTATTTTAATAATTGAGAGAGCTAAAGTACCTGAAACTTGTTGACTAGTTATCCAATCATGAACTAATGATACTAAACGTCTTCGACCAAATTCATCGCTTAAATCAATTGATCCTGCCATTGATAAAATTTGTTCAACAACACATTCTTGTTCAATTGCTTTTTCATCAAACTCTTGAGCAAGAACAGTTTGAACAAGTTTATCTACAACAGTTTTAGCTAAGTCAACGTATACACTAACAGACGGTTGAACTATATCAGCTAACCGTTGTACAGGATTGTTTTCTTCATTGTTATCTTCATGCTCAGGGTGTACTGCTGATTT                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD098225             [                 GCTCCAAAATAGCGTGTAATTTTAATAATTGAG GAGCTAAAGTACCTGAAACTTGTTGACTAGTTATCCAATCATGAACTAATGATACTAAACGTCTTCGACCAAATTCATCGCTTAAATCAAGTGATCCTGCCATTGATAAAATTTGTTCAACAACACATTCTTGTTCAATTGCTTTTTCATCAAACTCTTGAGCAAGAACAGTTTGAACAAGTTTATCTACAACAGTTTTAGCTAAGTCAACGTAAACACTAACAGACGGTTGAACTATATCAGCTAACCGTTGTAACGGATTGTTTTCTTCATTGTTATCTTCATGCTCAGGGTGTACTGCTGATTTTCTCGT                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD065012             [                                                                                                                                                                                                                                                                             gTAACAGACGGTTGAGCTATATCAGCTAACCGTTGTAAAGGATTGTTTTGTTCATTGTTATCTTCATGCTCAGGGTGTACTGCTGATTTTATTGTTGTTGTTGTTGTGTCATTTGCATTAAGTTGTCTTTTATGAATAAATTCCACTAATGCCCTCCAGAAAAATGTTGCTTCCGGTGTAAGGCAATCGGATTTAAGTATTCGATCAGAAGTTAAATAATTTGGTGACCATTCTTGCACAACTTTCAACAGATCGTCTGGTGATAACATTTCAAATAGACTATC]




>consensus_5908#0
CGACCGTCGCAGATTCGGCTCCAGAATAGCGTGTTATTTTAATAATTGAGAGAGCTAAAG
TACCTGAAACTTGTTGACTAGTTATCCAATCATGAACTAATGATACTAAACGTCTTCGAC
CAAATTCATCGCTTAAATCAATTGATCCTGCCATTGATAAAATTTGTTCAACAACACATT
CTTGTTCAATTGCTTTTTCATCAAACTCTTGAGCAAGAACAGTTTGAACAAGTTTATCTA
CAACAGTTTTAGCTAAGTCAACGTATACACTAACAGACGGTTGAACTATATCAGCTAACC
GTTGTAAAGGATTGTTTTCTTCATTGTTATCTTCATGCTCAGGGTGTACTGCTGATTTTC
TCGTTGTTGTTGTTGTGTCATTTGCATTAAGTTGTCTTTTATGAATAAATTCCACTAATG
CCCTCCAGAAAAATGTTGCTTCCGGTGTAAGGCAATCGGATTTAAGTATTCGATCAGAAG
TTAAATAATTTGGTGACCATTCTTGCACAACTTTCAACAGATCGTCTGGTGATAACATTT
CAAATAGACTATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case