cluster # 5912

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Schistosoma mansoni
cluster # 5912 cluster # 5912 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5912#0 length = 798 sequences # 3

consensusID : consensus_5912#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 798
fasta sequence

                              [CTCGCAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAGTTTCTTCCCTCATGTTGAAATTTTACTTATTAGATGGCCACTGTGATTAACATCACAGATAAAAACCATCTTGAACAAATTATACAACAAGCAAATAATGTAACAAATGGTCCAAGCATTGTAGTTATGGATTTTTATGCTTCATGGTGTCGTCCTTGTTCAGATATAGCTCCTGTCTTTCAAGAATTAAGCATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAAACATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC-TACG-TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAGAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAGATTGGTGAAGCTATACAAACATTAGAATTAACAGAAGATGATATCAAAGATGGCGGGATAACTCAGT]

[+] EMBL CD080112             [CTCGCAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAGTTTCTTCCCTCATGTTGAAATTTTACTTATTAGATGGCCACTGTGATTAACATCACAGATAAAAACCATCTTGAACAAATTATACAACAAGCAAATAATGTAACAAATGGTCCAAGCATTGTAGTTATGGATTTTTATGCTTCATGGTGTCGTCCTTGTTCAGATATAGCTCCTGTCTTTCAAGAATTAAGCATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAAACATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC TACG TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAGAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAGATTGGTGAAGC                                                        ]
[+] EMBL CD065051             [                                                                                                                                                                                                                             ATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAACCATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC TACG TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGGCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACCGATGAACATCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGc                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD128193             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTA CTACG TTATAGTTCGTACGTTGGAGCTGAAC AAGTGATCGGATCACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAAAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAAATTGGTGAAGCTATACAAACATTAGAATTAACAGAAGATGATATCAAAGATGGCGGGATAACTCAGT]




>consensus_5912#0
CTCGCAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAGTTTCTTCCCTCATGTTGAAATTTTACTTATT
AGATGGCCACTGTGATTAACATCACAGATAAAAACCATCTTGAACAAATTATACAACAAG
CAAATAATGTAACAAATGGTCCAAGCATTGTAGTTATGGATTTTTATGCTTCATGGTGTC
GTCCTTGTTCAGATATAGCTCCTGTCTTTCAAGAATTAAGCATCAAGTATACAAATATGA
AATTTGTTAAAATTGATGTTGATAAACATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGAT
CATTACCTACGTTTATATTTCTACGTGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAG
TTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATG
AAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGT
CAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTAC
ATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTA
TTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTA
AAGAGAATGCACCAGAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTG
ATAGTTGTGAGATTGGTGAAGCTATACAAACATTAGAATTAACAGAAGATGATATCAAAG
ATGGCGGGATAACTCAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case