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Schistosoma mansoni
cluster # 5924 cluster # 5924       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5924#0 length = 444 sequences # 3  

consensusID : consensus_5924#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 444
fasta sequence
                              [CTTATGAGTATCATTCTCTAGTTGTCAGCTATAGTCTCTATCTTCTGATAAAGGTATACTGTGCTATCATGATAACCAACATGCCATATAGAGGTATGTATTCACGGTGTTAAAATACCCCAGTTTTTGTGAAGTAAGATTAAGGATAGACGTGGTTAAAACATGACTTATTGATCTGTTGAAAAAGTAGGACATCTTAGCCATAAAAGCCTGTAATTATATATAATTTGGGCTAAT-TACACAATGCCTTAATCAGTTAAACTGTCGGTTAAATAATAAAACAACTATTTTTTGTTCAGTTTACCAAGTTATTAATATAACAGTAGAGGTAACACATACAATTGCATATGTATCTCAATTTTTCCCCTCTAAGTTAATTGGTTTAAATGCGTTATTAACAATCAACAAATTCTATACATTAT-CATCAACTGTGATGTTTATTAA]

[+] EMBL CD152161             [CTTATGAGTATCATTCTCTAGTTGTCAGCTATAGTCTCTATCTTCTGATAAAGGTATACTGTGCTATCATGATAACCAACATGCCATATAGAGGTATGTATTCACGGTGTTAAAATACCCCAGTTTTTGTGAAGTAAGATTAAGGATAGACGTGGTTAAAACATGACTTATTGATCTGTTGAAAAAGTAGGACATCTTAGCCATAAAAGCCTGTAATTATATATAATTTGGGCTAAT TACACAATGCCTTAATCAGTTAAACTGTCGGTTAAATAATAAAACAACTATTTTTTGTTCAGTTTACCAAGTTATTAATATAACAGTAGAGGTAACACATACAATTGCATATGTATCTCAATTTTTCCCCTCTAAGTTAATTGGTTTAAATGCGTTATTAACAATCAACAAATTCTATACATTAT CATCAACTGTGATGTTTATTAA]
[+] EMBL CD152155             [          TCATTCTCAAGTTGTCAGCTATAGTCTCTATCTTCTGATAAAGGTATACTGTGCTATCATGATAACCAACATGCCATATAGAGGTATGTATTCACGGTGTTAAAATACCCCAGTTTTTGTGAAGTAAGATTAAGGATAGACGTGGTTAAAACATGACTTATTGATCTGTTGAAAAAGTAGGACATCTTAGCCATAAAAGCCTGTAATTATATATAATTTGGGCTAAT TACACAATGCCTTAATCAGTTAAACTGTCGGTTAAATAATAAAACAACTATTTTTTGTTCAGTTTACCAAGTTATTAATATAACAGTAGAGGTAACACATACAATTGCATATGTATCTCAATTTTTCCCCTCTAAGTTCATTGGTTTAAATGCGTTATTAACAATCAACAAATTCTATACATTATCCATCAACTGTGATGT       ]
[+] EMBL CD152133             [            caTCTCTA TTGTCAGCTATAGTCTCTATCTTCTGATAAAGGTATACTGTGCTATCATGATAACCAACATGCCATATAGAGGTATGTATTCACGGTGTTAAAATACCCCAGTTTTTGTGAAGTAAGATTAAGGATAGACGTGGTTAAAACATGACTTATTGATCTGTTGAAAAAGTCGGACATCTTAGCCATAAAAGCCTGTAATTATATATAATTTGGGCTAATATACACAATGCCTTAATCAGTTAAACTGTCGGTTAGATAATAAAACAACTATTATTTGTTCAGTTTACCAAGTTATTAATATAACAGTAGAGGTAACACATACAATTGCATATGTATCTCAATTTTTCCCCTCTAAGTTAATTGGTTTACATGCGTTATTAACAATCAACAAATTCTATACATTAT                       ]


>consensus_5924#0 CTTATGAGTATCATTCTCTAGTTGTCAGCTATAGTCTCTATCTTCTGATAAAGGTATACT GTGCTATCATGATAACCAACATGCCATATAGAGGTATGTATTCACGGTGTTAAAATACCC CAGTTTTTGTGAAGTAAGATTAAGGATAGACGTGGTTAAAACATGACTTATTGATCTGTT GAAAAAGTAGGACATCTTAGCCATAAAAGCCTGTAATTATATATAATTTGGGCTAATTAC ACAATGCCTTAATCAGTTAAACTGTCGGTTAAATAATAAAACAACTATTTTTTGTTCAGT TTACCAAGTTATTAATATAACAGTAGAGGTAACACATACAATTGCATATGTATCTCAATT TTTCCCCTCTAAGTTAATTGGTTTAAATGCGTTATTAACAATCAACAAATTCTATACATT ATCATCAACTGTGATGTTTATTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)